EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00284 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr16:885888-887705 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr16:886771-886786TGTTAATCATTGACC+6.06
HNF1AMA0046.2chr16:886771-886786TGTTAATCATTGACC-6.72
HNF1BMA0153.2chr16:886772-886785GTTAATCATTGAC-6.54
HNF1BMA0153.2chr16:886772-886785GTTAATCATTGAC+6.74
SP1MA0079.4chr16:887407-887422TAAACCCCGCCCCCA+6.48
SP2MA0516.2chr16:887406-887423TTAAACCCCGCCCCCAA+6.1
SP4MA0685.1chr16:887407-887424TAAACCCCGCCCCCAAA+6.14
ZNF24MA1124.1chr16:886324-886337CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr16:886312-886325TATTCATTCATTC+7.52
ZNF24MA1124.1chr16:886316-886329CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr16:886320-886333CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
NNNNNNNNNN NNNNNNNNAC ACACAAACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 60
TCTCTTTCAG TCAGGAATGG CAGACACTCA CTTCCGTTCT CTTTTTTTTC CCCCACACAC 120
TGATCATCAA TGAGCTTAAA GTCTATTAAG TATCAATACT GACGGCTTTG ATTAATCTCT 180
TAAAGAGGGG ATGTGATGCT GACATCACTG CTGTAAGGGG TTAAACACAG TTGTGTGGCA 240
GCAGTTGTGT GAATATATCC AACCTCTAAT GGTCAACATT GTTTTCTTTT TTAACCCAAT 300
AGTAGGGTTT ACCTGCATTT GACCCCAAAC AACTTGTTAG GGTCTACACT ATAACAATGA 360
AATCAAAACT GGGTTGTTTT AAACCCAAAA GTGTCAAATA TGGACAGCCC TTATGTTCGA 420
TAATTATTCA TTCATTCATT CATTCATTTT CTTGTCGGCT TAATTCCTTT ATTAATCCGG 480
GGTCGCCACA GCAGAATGAA CCACCAACTT ATCCAGCATA TTTTTACGCA GCGGATGCCC 540
TTCCAGACGC AACCCATCTC TGGGAAATTA TTATTATTAT TATTATTATT ATTATTATTA 600
TTATTTATTT TCATTTAAAT TTAAGTGACA CTTTTTTTAC CCATTGGATT GGTAGATTTG 660
TCTAAATCTG ACCCCGCATT AGATTAATAC AATTTATTAA AAATGTTGGG TTGTTTGAAT 720
TATATACAAA AGTCAAAAAT GGGTTATTTT TGTATTTAAT ATAAATTGAA TTTTTAACCC 780
AACTGTTGTG TTTGTCCATA TTTGATCCAA CATTAGATTA TGATAACCCA TCTGTTTATT 840
TTGTAAATTA ACATGATATG AAAAAATAAC CCAATCTTGT GTTTGTTAAT CATTGACCAA 900
ATGTTGGGTC AACATAAAAA AAATATATAA ATGTTTTTAT TAAATTTAAA GGACATTTTT 960
AATCCAGCTG TTGTATTTGT CCTTATTTGA CCCAGAATTG GGTTAATAGA ACCCAGCATT 1020
TCTTTTAAAG AGTATACTAC TGTAATGTGA AAAAATCACC CAATATTGGG TTTTCCATAT 1080
TTGACCTGAC ATTGGGGGTG ACAGTAGGTA GTGCTGTCAC CTCACAGCAA GAAGGTCGCT 1140
GGTTTGAGCC TCGGCTGGGT CAGTTGGCGT TTCTGTGTGG AGTTTGCATG TTCTCCCTGT 1200
GTTCGTGTGG GTTTTACACA CACACGCTCA TACAGCACTG CCAATTTTGG CATATTCAAT 1260
TCATCTACAG TATACCACAT GCGGGGGAAA CCCAAACAAA CACATGTTGA CCTTAATTGA 1320
GGTAAAATTG GTGTTATATT TAAACATCAT TTCATTTTCT TAATAAGATA ACACGTTTCC 1380
CATAATGCTT ATCAACTACT TTTAGTATTA TGTCTGAAAT AGCATGTACT TATGAGCTTA 1440
ATGAACAAAT GTTAGTGGGC GGAGCCGCAG TCTCTCCAGC TGATGATGAC ATCACTCGCA 1500
TAACCTCAAA CGTGTTGTTT AAACCCCGCC CCCAAACCCT TCTGATCAGA GCTACTGCTT 1560
CCACACACTG CTCTGGGTTA ATACTGTGTT ATTTACAGAA ACACACACAC ACAGCACAAA 1620
TCTACACGTT CACTGACAGC GTCAAGATCC TCTCTTGCAG GATACCCCAA ACTTCTATTT 1680
ACCCCCAAGC AAAGAACAAA ACGGAGATTT GCTGTGATGA TATCCAGATT GGGGGGGTTG 1740
CGTTAAAGAA AGCAATCCCA TTCGAAATGG TCAAGGTAAT TGCTCCTAAC ACTGAAACAC 1800
TCCACTCCAC AAAGGCC 1817