EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00280 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr15:46598354-46600504 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr15:46598957-46598968AAGCAATAAAA+6.32
HNF1AMA0046.2chr15:46600360-46600375GGTTAATAATTTACA-6.32
HNF1AMA0046.2chr15:46600360-46600375GGTTAATAATTTACA+6.33
HNF1BMA0153.2chr15:46600361-46600374GTTAATAATTTAC+6.23
HNF1BMA0153.2chr15:46600361-46600374GTTAATAATTTAC-6.5
Hmx3MA0898.1chr15:46598422-46598439ATAAGCAATTAAATAAC+6.44
IRF7MA0772.1chr15:46598580-46598594ACTAAAACGAAAAT+6.16
LMX1BMA0703.2chr15:46598658-46598669TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr15:46598655-46598668AAATTAATTAAAT+6.07
PHOX2AMA0713.1chr15:46598659-46598670TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr15:46598659-46598670TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr15:46598659-46598670TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr15:46598659-46598670TAATTAAATTA-6.62
Enhancer Sequence
ATTTGATTAT TTTTAACAAA GTATTTTTTA AATCAAACAC TACTTAAATT AGATTTAAAA 60
ATGTAAAAAT AAGCAATTAA ATAACATAAA ATTTCTCAAA TTAAAATGCG GAAAACTGTA 120
TAGGTATATA TACTAAAAAG AAATATTAAG ATATTTTTAA AAATCATTAA AATAACACTA 180
CAAAAAACTA TAGGTATGTG TACTAATTTG AAATAAGAAA TAAAATACTA AAACGAAAAT 240
GAGAACAACA ATAGGCATTT TACTAATTAA AAATACGAGA TGTAACCCCA AAACTTTAAC 300
TAAATTAATT AAATTAAAAA TGTAAACCTA TATTTATATT CATTTACACT AAATTTATAA 360
TTAAAATATA ATGAATAAAA TCGCTAAAGC TCATTTTTTA GAAAGAGAAA AGGGGAAAAC 420
AACAATCAAA TCTAATTATC AAAACTCCAG TAGTCGCTGA TGCTAGTTGT AATGGGTTAA 480
ATCAGGTGGA AATAGCTCTT TAAGATAACA ATCGCAGATT AACGCTGTTT ACAATGCTAG 540
ATAACATCAA TCGGAAACAA ATCTCGACAT TTTCCCTTCA AACTCCAACA ACCACAACAA 600
TAAAAGCAAT AAAATAATAA TAATACACTC AACAGAATGC TGTGTTGTTG TAACCCAACA 660
CTGGGTCGAA AAGTGTTATT TAAAATAGCT TACATATAAA AATCAACCGA ACTGTTAGGT 720
TAAGACAACC CAGCATTTTT AGAATGTAAA AATAATAGCC TAATAATAAT AATACACTCT 780
ATGTTAATAA TGTTGTTATT CGACTGTATT TATTATTATT ACACTAAATA AGGTTGGGTC 840
AAATGGACAA ACGAAACTGA AATGTATAAT TTTATTAAAT TATGCCTACA TTTAAACGAG 900
AATTTTCAAC ACAAAGTTGG ATTACGACAA CTCAATTTGT TAAAGATGAC AATAATTGAT 960
AACAATAATA AACAGGCCTA TAATGATAAT AGATTTTGTA GATCGTGTTG GAGGGTCTTC 1020
CCTGTCTCTG TGTGAGTGAT TATGGGGTCA TTTCCCCTCA GCAGGGTTTG AAAGGCTCTA 1080
AATGATTGCG GATAATGGAA TAATAAAATA ACAAACTAAT AAAAAGCGTC CGAAAGCGCG 1140
GAGCGGCCCG TATTACAGTG GATCCGGAAA GCTGCGGTTC CCCGCGGGCC CGCATGCAGA 1200
TGTTAAACGC GCCTATTGAG CCACTATACA TGAGAAAGAC GAGCGCAATA AAGTCCAGCG 1260
GGGAGCGAGG GTGAACACAG GACACACACA CTGATATTCA ACTTGTTCTC ATTTCACTCT 1320
CACATTAGAT TAGAAATATG CTACACCACG TAGCCATGTT GTCTTCAGGA AACTCCTAAA 1380
GCTGATTTTC GCGCGCGCGG GCTTTTACTC AATGAAGGCG CGGTACACTT TTACCCTTAA 1440
TTAGCCGTTT TCCCCATTTT GTTAAGTTTT TTCCTTCATG TATGCTGTTG AATTGTTTTA 1500
CTATGTAGTA CTTACTATGT CTACTATGAG ACCTTGGTCA ACTTTTAATG CTGAAAAGTT 1560
AAATTTTTAA TAGTCATTTT TAATATAAGT GCTATTTTGT TTGGACTGTT GTTGTAGGCG 1620
CGAAATGGAG GCGCGAAAGC CTCGTAATAA ACTGCCATTA ACTTTTATGT TATTTAAAAA 1680
TTTCTGCTAA ATATAGTTTT TATACAATAT ACGGTTTACT ATGTCATTAA AAGTCACTTT 1740
GGTAAGTTTT AACACCTGAA GTCGACATAT ATCATTCACA ACAGCAAATA AACTAACAAA 1800
AAAAGTTTTT CCATTGTAGG AGTATCTAAT ACATTTTTTT AAATTAGTTG TAATATATTT 1860
TATGTAAGTG ATACAGACCT AATGTGCAGA ATATGCTGAA TGTGTTAAGG GTTTATTCTG 1920
TGATAACCAC CATTCTGACT GTATATTATA CCAGTTATTA CAGCCCTACA TGCCACAAAA 1980
CTAAACCAAT AGACACAAAA CTAGAGGGTT AATAATTTAC ACTAACTCTT TAATCAAATG 2040
TAAAAGGGGA AGAGGCTAAA ATAAGGGAAA ATTTATTTTA AATGAAGGCT ATTTGTTGAT 2100
TCTTTTCTTG TAAGAAAAAA TGCTGCGTCA CTTTAACACA AATATGGGTC 2150