EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00266 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr15:20574278-20576348 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr15:20575152-20575164GTAATGGTTTTA-6.62
CTCFMA0139.1chr15:20574715-20574734TGGCGCCCTCCAGTGGACA-6.37
Dmbx1MA0883.1chr15:20576247-20576264AACCTTAATCCGTTACA-6.03
FOXB1MA0845.1chr15:20574351-20574362AATGTAAATAT+6.32
HNF1AMA0046.2chr15:20576150-20576165GATTAATCATTAAAA+6.31
POU2F2MA0507.1chr15:20575857-20575870ATATGCAAATAAC-6.1
POU4F1MA0790.1chr15:20575507-20575521AATAAATTATTCAG-6.25
POU4F3MA0791.1chr15:20575505-20575521TTAATAAATTATTCAG-6.33
POU5F1MA1115.1chr15:20575857-20575868ATATGCAAATA+6.02
ZNF384MA1125.1chr15:20574852-20574864AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr15:20574853-20574865AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr15:20574851-20574863TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
ACAGGGTTAA ATGGATGGAA ACCTACATGA TACCATGCTT TTTGCAGAAT TCCAGTGAAC 60
CAACAGGAAA TGGAATGTAA ATATACAAGA CCAACAGTTT ATTGCCACAG GTCAGAGTAC 120
AATCAGCATA CTCTGTTGAC CACAGCACCC TCTACTACTG CATATAGTTC ACGGGAAGAC 180
TTCAAGAACT GCTAAAATTA CTTTGGGCAT ATTAAATAAA TATAAATAAA TAAAAAGATT 240
TATATAGTTC CTCAGTCTTT GAAAAACAAT AAATCAGTGC ACTGCAGCCA ATGAATATTC 300
AGCTGCATCT GTCTACAGGG ATCCAGGAGC ACCACATGCT GCCCGCTGGA CTGTTCACAT 360
GACAGCGGGG GGATGAGGGC CTGTTCCTGA CCTCTGCTAT TCTCCTTTTG CAGTCATTCA 420
CTGTACTAAA ACTGCTCTGG CGCCCTCCAG TGGACAAATC AATAGATAAA GTGCAGAAAC 480
TAAGGGGAAA GTAAAGACTT GAGTTCACTA CATGGGAAAA GTCACTCAAT TAGAGATCTT 540
TGGTGAAAAT ACACAAGATA AATATAAAAA GAGTAAAAAA AAAAAAAGAA AAAAAATTGC 600
ATTTCTGCAC TGTCAGACAT GGACTTGTAA TAGTGAACAC TGCTTTTTAA CTAATTTGAT 660
GAAAATGTTT TTATTTGATT ACATCATTTG ATGAACATCA AGCATGTCTT TTCATTTTTT 720
CGCTCTTCAA TATGTTCTCA TTAGATTAAA TACAGATTTA ATTACAATAT ATATTTATAT 780
TACAGGTATT TTATTTAGAA TAAAGCAGAA CATTAATGTG TGTTTTAGGG TTAATCTATT 840
CTTTATGCTA AACCATCCAA ATCAACATTT GAAAGTAATG GTTTTACCGA TCACAAATCT 900
TATAGTTCCA ATCACATTAT GGTTTCTTAA AGCCATGGAT CGGACCATTT TTCAGACCAG 960
CCAAAAAGGG GAGAAGACAA AGGTAATTTG CTTTCCATTT ATTACAAAAA CATTGTATTA 1020
CAAGAAACTT TTGGTTTCTT AGAACTTAGA ACCTGTATTT ATATATAAAT GATAAAATGA 1080
CGAAATAATC TGCTGAATAA AAATAAATAG TAAAATATTC AGTATTGTGA AAAAAATTCA 1140
CTGTTACTAC TTCTGTTGCT GACAACACTA AATGTAGAAA TCTAACATTA TCATTTGTAC 1200
AACCCATTTT TATTTTTGGT CTCATTATTA ATAAATTATT CAGTTATTTA CTGATAAAAG 1260
TTCAAGTTTC ATTGCTAGAT GTATAATTTT TGAAGAATTA TTCAGTGGCA TATTTTGATG 1320
GCTGGTTAAT TATTTAAATT AAACAATTTA ATTGCTACCT ACAACTTTCA TTTTTGAGCG 1380
TCATTAAATG CATATGACAG TGATATTAAT CTTTACCATA AACATAAGTG GTTTTATCTA 1440
TACTATAAAC TGTTATTCCA GTACCTCTGT GTTATTTGAC TGTTTGTAAC ATATGTAATT 1500
AACCCAAGAC TAAAGACTGA ATTTCTCTTG ATTTTTGCAC TTTTAGATTT GAATGCAGCG 1560
ATTCGAAGGA TTAATAAACA TATGCAAATA ACCATCATTT ATAACTTTTT GTGTGGGTGT 1620
TGAGATCTTG ATCTTTAAAT GATTAATCGA GCAGCTTACA CTGAATGCAT TAATGACGTC 1680
TAAACAAGTC GTGACAGAAA ACACCTTTAT AAACCTAAGA AACCCACTAC ATACCGAATA 1740
ACACACCAAA ACTTTTTCTG TCATCATTAT ATTTTACAGG AAAGCCTAAA TGTTTTCATA 1800
TGTGTGATAA AATCATGTCA TGTGATTTGA ACAATGCGAG AGGCGATCTT TCTGCGATCG 1860
TTACAAATTT AGGATTAATC ATTAAAAAAA TATATATATA TTTTTTTTAT TAATCCACAG 1920
GGGACATGTG TTCCGAACGG TGGGTTGTGA TCCACACGAA TCACAGATCA ACCTTAATCC 1980
GTTACATCCC TATTAGAAAG TATTGTAAAG ATTTGGGTCA GTAAGATTAT TGTCCAAGAA 2040
CAAGGACAAT AAATTGTTCA AAAGTGGCAG 2070