EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00246 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr14:41789986-41790944 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr14:41789988-41790001TAATTAATTATTG+6.39
NR2F1MA0017.2chr14:41790459-41790472CAAAGGTCATGAG+6.3
Nr2f6MA0677.1chr14:41790454-41790468GAAGTCAAAGGTCA+6.67
POU4F2MA0683.1chr14:41789987-41790003CTAATTAATTATTGAA-6.2
POU4F3MA0791.1chr14:41789987-41790003CTAATTAATTATTGAA-6.02
RXRBMA0855.1chr14:41790454-41790468GAAGTCAAAGGTCA+6.44
RXRGMA0856.1chr14:41790454-41790468GAAGTCAAAGGTCA+6.29
RxraMA0512.2chr14:41790454-41790468GAAGTCAAAGGTCA+6.37
Enhancer Sequence
GCTAATTAAT TATTGAAAAG CATAAAAACT ATTTGAGTAA CATGACTAAT GACGAGGGCA 60
GAAATATATT GATTTTCATA GATGATGTTT CAGCATCCAG ACTGCTAATT GCAATCACCA 120
TTCGACAAAT AAAAGACGTG TAACTCTCTA ACTTGGTATT TCAAGCTCAT TAGCGATCAA 180
CATCCGACCC CTAAAAAAAG CAGCAAAAAA TGAGATCCAG TAGTTGTTGC CAGTCAAATT 240
AAACTCGTGT TTTCTTCTTA CACTCCCCGA GGAGACTAAC AAAGGATAAC AAGCTCGTTC 300
CAAATCCTTC ATGTTAACGA CTAGAGTTTT GCCCCGACAA ATGCGAGCTT GACAAAAGAC 360
GCAGCGACCA CTATGATGAA AAATCTGTGC GATAAAGTGA TTCAGCAGCT TTTGTTCCTC 420
GGCCTGCTGT CCCTTTACTC TCAGGGTGTC TGATTGGCGG CTGAGTGGGA AGTCAAAGGT 480
CATGAGAAGT CTGACAAAGG GCCTGGGCCA ATACAAAAGT TACTAAGTGT GTCAGATTGG 540
GAGGGGGGTC CTGAAAAAGA CCTCCTGCCT GGTCCCCTAA CAAAGAACCA TCAGCATGTG 600
AACAGCTATG AGTGTCAGCA CTCCAGTTCT CCTCTCCTTC CCCCAATGCA GGGCCTCTCT 660
CATGGCATGC CCTCTGTTGC TGTTGGGGGA TAAGCGGTAA ATCGCTGGCT GGCATAAGGG 720
AGCATGTGTG TTTTGGGGTA GGGGGTTGCT AAATGCTACG ACTGCTCTGC AACAAAGAAC 780
AAATCAAAGT GTGCCTCTTG TTTTCTTTTA AAAATACATA AAAGATTTTG GGGAGGGATC 840
GGGGAACTTG TACGAGGAAT GCGAGTCGGT TAATTTGGCA CTGAAGCTGA TGGAAGGTTT 900
CCAGTGAAGT TACAAATAAG GCTACTTAGT TGTGCGTCTT CGCTTCTCGA AAAAAAAG 958