EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00188 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr13:48881838-48884400 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F4MA0470.2chr13:48884061-48884075TTTTGGCGCGCATA+6.05
HNF4GMA0484.1chr13:48882341-48882356TGAACTTTGGCCTGG-6.17
IRF8MA0652.1chr13:48884244-48884258TCTTTCAGTTTCGG-6.07
RREB1MA0073.1chr13:48882217-48882237ACACAAACCAAACACACAGA+6.19
SIX2MA1119.1chr13:48882317-48882333ATATCAGATTACAGTT-6.23
Enhancer Sequence
GCAGAACACA CAAAGATGCA CACATGCACA CAAAAAAACA CTCAGACACA CAGGCATGCA 60
CACATACACA CACACACACA CGCACACAGC AGAACACACA GGCATGCACA CACACAAACA 120
CACAGCAGAA CACACAGACA TGCACTCACA CACATACACA AACACACAGG CATGCGCAAA 180
AAAAACTTAC ACAAACACAC ACACACAAAC ACACACGCGC GCACGCGCGC ACACACACGC 240
GCACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAA ACATTCACAC ACACACACAC 300
ACACACATAC ACACAGGCAT GCACGTACAC ACAGGCACAC CGCACACAAA AACACTCACA 360
CATAAGCTTG CACAAAGACA CACAAACCAA ACACACAGAC ATGCACAAAG ACACTCACAC 420
AGGCCTGCAC ACACACTCTC TCCCTCTCTC TCTGCTTTGA TTGCGCAGTA CATTACAGTA 480
TATCAGATTA CAGTTCCTCC TCATGAACTT TGGCCTGGAG GATTGATGCC AACTGTGTAC 540
GTGCCGCCCC GTGCCTCCTC ACTGTCTGCA TGAGTGCCAG CGTGCTCCTA CAGGGGGCAG 600
TGGGCTACAA TACACATCAT AAGCAACTTG TCAAATGAAG TGATTTTGTG TGTGTGTGTG 660
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCA 720
GTTTTTCAGT CATTTTGATG CCACAGACAT TAAGATTAAA AAAGCATGCT TATATTTTAC 780
TGCATAAACT AAGAGACTGG TTTACATTGT TCAAAATTAA TATGACGCAT GTGTGATTTA 840
TGTTTATTTA GGTTAATCTT TCTTAGCTAT TTTGTTGTTG TTGTTGTTTC TTGATGTTTT 900
CCTCAACACT TACAAGGGTT CATGGAAAAC CCCTGATTTA GTCCGAGCCC CTTTTCAAGA 960
ACTGAAAATA TTTAGTAGCT GTTTACAGTT TTTCTTGTTT GCTTTGGCCT GGTTAAAGAA 1020
ACTAGGTTCC ACTTCATTTT CATTATCACT ATCCCAGCAG AGCAGAAGAC AGGTCTTGCA 1080
AATGTGTAAA CCCTTTCTCA TTGGGTTGAC ACATTTACCC CACCATTTTT CAGAACAGTT 1140
AACACAGATG TCATTCAAAC AGTCCAAACT TCATTGTTTT AGCTTTGGTA ACCAAACAAA 1200
AACCATCTAT TCCTAACCAT TAGGAACTAC CAAGATCAGT ATGAATTCAG TGTAACCGGG 1260
TCAGATTCAG TTTAGCAAAT TTTAGATTTA GTCGTGATCA GATGTTATGA GAGGCTGCCC 1320
TAATCTATCA TCACTCCATG ATCATTTCGC ACATCACTTA TTGTTTAACC ACTTGGTCCC 1380
AAGCCAGCAT CACTATTCTG AAGCCACTTG AATCTTTATA CAAACAATCC ATAAAAACCC 1440
TTGATAAGAA ATCAGTTCAA TATCACCATT GTTTAATATT AAAGAAATAC AACCTGCTTA 1500
GTTGGGAAAA CTTAATTATA TATGTGCATA TCTGTTTAAT GTTTAAGACT TTACATAACC 1560
CGACTTCACC ATTAAATCAG TTTGTAAATA TTAGAACGAC TGCTCACCGA ACTACTAGAG 1620
GAGGTGACAG AGGAGACTGC ATTATTCCTC TCAAAAAAAG TAAATTCAGT CAATCTGTAT 1680
TTTCAGTGAG AGCTGCTAGG GAATGGAACT CCATCCCACC AACAATTAGA AGATCATGCA 1740
CTTTTCATTC TTTTTTTGGT CCATATTGAC ATGATAGCAT CACACAGTTG CTGCAGATTT 1800
GGTCCATGAT CCGAATCTCC CATTCCACCA CATCCTAAAG GTGCTTGAAT GGATTGAGAC 1860
TGGTTCCAGC TGATAGAAAA GCAACAGTAA CTCAAATAAG CACTCGCTAC AACCGAGGTC 1920
TGCAGAAGAG CATCTCTGAA CACACAACAC GTCCAACCTT GAGGCGGATG GGCTACAGCA 1980
GCAGAAGACC ACACCAGGTG CCGCTCCTGT CAGCTAAGAA CAGGAAACTG AGGCTACAAT 2040
TCACACAGGC TCACCAAAAC TGGACAATAG AAGATTGGAG AAACGTTGCC TGCTCTGATG 2100
AGTTCTAAAG TTATATCCTT TCAGTGGTTT GTTATGCAGT GACATGCAGT CAAATATTTC 2160
GCCAAACAGT CCTTAGGGAT GCGGTAAAAC GCAGTCAGAT ATTTTACCGG ACAGATCCGC 2220
CACTTTTGGC GCGCATAAAC AATCATAAAG CTCTCGTGCT GCAGGAATGA GGAGGTCTGC 2280
TGAAGGCGCG CAGCTGTCGT GCAGTGAGAG ATTTGTGTCT TTAATAAACT ACGGCAGTTT 2340
GTGATCACTG AACAGTAAGA ATGATTAATA AATCCATATG AAACAACCCC TTAAAAGTCA 2400
CGTGTCTCTT TCAGTTTCGG GCTTTGGCGC GTTTTGCACT GAGCGTCTCT CTCTCTCTCT 2460
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT TTCTCACTCA CTCACTCACT CACTCACGCG GGCATGCACT 2520
GTGGTCTCAT GAGGAAACGC TGATTTTTGA TATAGTGTTT TC 2562