EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00171 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr13:21880134-21882386 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr13:21881752-21881766TTTTGGCGTGAAAA-6.64
FOXB1MA0845.1chr13:21880398-21880409TATGTAAATAT+6.62
FOXC1MA0032.2chr13:21880398-21880409TATGTAAATAT+6.62
FOXE1MA1487.1chr13:21880149-21880164CCTAAAACAAACAAA+6.7
Foxd3MA0041.1chr13:21880153-21880165AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr13:21880157-21880169AAACAAACAAAC-6.32
HOXD13MA0909.2chr13:21882355-21882366GGTTTATTGGG-6.02
NFAT5MA0606.1chr13:21880799-21880809ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr13:21880799-21880809ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr13:21880799-21880809ATTTTCCATT+6.02
RUNX1MA0002.2chr13:21882060-21882071GTCTGTGGTTT+6.62
Sox11MA0869.1chr13:21881506-21881521AACAATTCCAGTTTT+6.64
ZNF384MA1125.1chr13:21881605-21881617AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
TGGAGATACT GTTGTCCTAA AACAAACAAA CAAACAAAAA AGTTAATAAA AATCATCCAC 60
ATACCTTAGG AACGGTATAA TAGAAAATTT TGGCATTTTT AAAACCATGA CTTTCTTTAT 120
AAATGGTTAT CGTCCCATGC CTAATCAGGA TTCTGTCAGT TGTGCAACTG ACAGCGCATA 180
CACCATCACA AAAGAGCTTG CATTCACTAA GATTAAAATA ATTTTGCAGC TTATGAAAAG 240
ACCATTATTG CTGTTAAGAT GACGTATGTA AATATTAAGT TATATGTCAA TATCATCTGT 300
GCAATATGAG ACATCACCCA TGAGAACAGC AAAGTTATTA TTAGCAACTC AGTTCATCTC 360
ATTCTCGTTA GGCAATGCGT GCAGGGCCGA TGGGTGCATG CAGATTTATT TATTTATTTA 420
TTTATTTGTT AGTTTTGATA GTAGACATTT CAAATGCAAT AAATCTGTTA AGATAAAACT 480
TGTAGAAATG GTGCACAGAA TTTTTGTTAG GGTGCCTACA TTTTGGAAGT TAGGAGCCCC 540
AGTGCTACCA AGCAAAAAGG CAAATTTCGA GACCTGTTTA ATTATGGCAC ATTCTTTAAT 600
ACAAAGGTAA ATGAGGTATG TCCCATTAAA TATTATTTTG CTCTTTTTTT ATATAGTTGC 660
TTGTCATTTT CCATTGGTCT TTTTTTATCC TATTGATTTT TATATTTTAC TCTGCTCATT 720
TGGCAGATTT TAGCATTTTG TTTTTTGTTT TTTACGAGGA TGGTGTTGTG TTGATAGTCA 780
TACACACAAA GGCAGATGAC ATGGCCTCAA AAATGGTGTG TTCTGTATAG GGGTGCAACA 840
TCAGGGGGGG GGCATCCAGC AGGTGGAAAC ACCCCATCCC CCTTGTTTGA GGGCAATATC 900
TTGCTTCTGT TCACCATTTG TGTGAATGCA CACAATTGGG TTATTGCGCT CCAGCTGAAA 960
AAGCAAAATG CTTTTGGTGC CCATTGAAGC AATCCTAATA GATTTTTTCA TTTAGCAAGA 1020
ACAGAAACCT TAAACTAGAA CCCAAAACGT ATTTTTGCTG CCTTGTGAGC ACTTCTATTC 1080
CCTGGACCTA GTTATTTTAG AGATGTGGTG TTCTTATTTA CTTTTTCAGT TTTGTACTTG 1140
CGCGCACACA CACACACACA CAAACACACA GACACACACA CACACACACA CACACACACA 1200
CATGCATAAC AGCAGTGCTT CTCATATTAA AAATGCCATC GTTTTCTGTT AAGTTCTTTT 1260
CACATGATTC ATCTCGACGT TTGCATCCCA TTGCAGTGAG CTGAACTACA GAGTTTCCCC 1320
CGGCGCCGCG TTGTGCTCAG GTCAAGCGTT GTAATGTGAC GCTTAAAGTT CAAACAATTC 1380
CAGTTTTGAC CCTGTTTGCT GCTGACCTTT TGAAGCGCAG CCAGTTATTA CCAGACAATT 1440
TGCATGACAT ATTGTTGCCA AGCTCCTGTG CAAAAAAAAA AAATCTGAAA ACAGAAGAGT 1500
ATCTGGATAC ATCAGAATGT ACAACACAAC ATTAGAGTTG CATCTTGACA TTCAGAGAAT 1560
AATCATGGTA TTTTACGCAT TAGATGTTGT TTATTTGTGT ATTATGGTAA AATTGCCCTT 1620
TTGGCGTGAA AAAGGCAATA TAATAACCAT TCGCAAGAAT ACATACTTTC CTTTCTAGTT 1680
GATCATTTAG GTTTAGAGCA CGCACGCATA TCTCAGAGGG AGCTTTATCT CTTGCATTAA 1740
CCTGGATTAT CATTAATCTG CCTTTAAAGA CTCTGCCCTC GGGGACCCAA CATTTGGTGC 1800
TCGTAGAAAC CAGCGAAGAA ATACAGCGGG GAGTAAAAAC CTCTATGAAT ATTTCCATCA 1860
GGTAATCCTT TGTCCCTTGG GCTCACCGCC CATTGCACTA GTCATCCTCT CGAGTGCCTG 1920
CGTCTGGTCT GTGGTTTAAT CCAACAGGCC CATGATTAGT TGAGGCCTGT CGCAGCATGG 1980
GGCTGGATTA GTCTCCCGCC CTGGTAGACG CTCATGACCA GCCGCCGCCT CAAGCCTTCA 2040
CACAGAGCTC CTATCTCTCC CAGATGCTGA TTATGGGCCA CACTGGCAAC ACAGCCTCAG 2100
GGCAAGAGAA AAGGGAAGGG TGTACGCTAT TGGAATGGGA CCTAGGTTGT TAAAGTGGCA 2160
TTAGAGACAG ACCTCCACCT TAGCTAATGA GGGGCTTGGA GAGGTGCTTA TTGTCCTTGT 2220
TGGTTTATTG GGTCAAATTT CAGTCAGGCA GG 2252