EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00168 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr13:20216584-20218612 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ATOH1(var.2)MA1467.1chr13:20217550-20217560GACAGCTGTT-6.02
FOXC2MA0846.1chr13:20216940-20216952TTTATTTACTTA-6.07
Foxd3MA0041.1chr13:20216888-20216900GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr13:20218433-20218445GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxj3MA0851.1chr13:20216890-20216907TTGTTTGTTTATTTGTT-6.12
IKZF1MA1508.1chr13:20217535-20217547GCTTCCTGTTTT-6.62
SOX10MA0442.2chr13:20218477-20218488TCCTTTGTTTT-6.32
Sox3MA0514.1chr13:20218478-20218488CCTTTGTTTT+6.02
Tcf7MA0769.1chr13:20218331-20218343TCTTTGATCTTC-6.02
Enhancer Sequence
AGCCTTCTTC TCATGCGCAC CTGATTTGAT TCCCCCTCAC AATTAATTCC CTGGAAATGG 60
ACATCTCTCC TCAGAAGAAA ACATTTTGTT CCTCTGAAGA TGGTGTCCTT TTGTCATGTA 120
CAGGGTGTGC TGTAAATAAA TCCAGTTCAT TTAAATATTG GGTCAAGAAG AAGCATTTGA 180
ACTTTGATAT TTTGAAAAGG AAATTGCAAG AAATTACTCT AACAATCAGG CTTTAGTGGA 240
TTGGAAGCTT CATTGTTGTG AAAAAGTTAA AGATAAGTAT TTTGCACATT CCTTCTTTCT 300
TTTTGTTTGT TTGTTTATTT GTTTGCTCGC TTACTCATAT ATTATTTACC TACACATTTA 360
TTTACTTATT ATTTCTGTGT TTACATATAA TGCTACCACA GCATGTCTGC AACATATGAA 420
ATAACACAAA CAATTCCTGA TTGTGAGCTG CTGTGATATT GACCAACACT TGCCTGTTTG 480
ATTGTGGATG AGGTTTGTTT GTTGCTAGTC CATTTGCACT CATGCCCTTC TCCTCACCTG 540
CTGCCCTCCT TCTCTTTGAT GCTCACTTCC TTCCTTTTCT GTGGTCTCCT CCTTCTCCCC 600
GCAGGCATTA CCATCGCCAG CGCTCTCATT GATGCGTCTC AGCAGAGGCC CGGCGACTTC 660
AAAGACAAGG CCTTGAGTCT AAAGAGCCGC AAACAGCAGC ATGCGGTGCA CCAGGGAACC 720
TGCGTTTGAA GCAACCGACT GACCCTCTCT TTCTCATCTT TCTGTTCTTC TCCTTATCGT 780
CCAGCAGATG ATGAGAGAGC AGCTCTTGAA GTGTAAATGA CAAAGGAGGG TCAAGACATT 840
AGTAGTCGTG TGTGGCTCCT CCTGAATTGC ACGCTCCATA GTGGAGCTCC TATTCCCTCA 900
GTATTGCTTG AACCTCTGTG GAGGACATCT GCATTTTGAT TGCACACATT GGCTTCCTGT 960
TTTTCCGACA GCTGTTTCTC AAAAAGGGAG GGAGTGTGTG AATAAAACTC ACTCCAACCC 1020
AAAGTAGGAA CAGGTTCCAT GCCAGAATTA ATCATGCGGT CACGTATGTC GAGGTACTGA 1080
AAATAAACCT GGCTTTATAC TTTCGAGGTG ACAGTGAGTG ATATGTCTGT TGATGACTCG 1140
GTATTTACTG TTAACAATAG TCAGTGATGA TTGTATGGTA AGCTTAATTT TAGAAGTCAG 1200
AATTGGATTT GTCTTGGAGA ACTATCCCAC CAAGCAATTT TGTGTTTAAA AGACAATTAA 1260
TAGACATTCA AACATAGATA TGTTGATTAA GATAAGGCTA TATTTCAGCT GTCAGTGAAA 1320
ATCTAGTATG GCCCATTTTC ACTGAGCGGT ACAGTCGGCA TGGGTCACCC TTATCAGGCA 1380
AATGGTACTA AATTTCAGTC AACATCATTC TCACTCAAGG AAATGTCTAC AGTAAAGCTG 1440
TATGGGTCGT TCACATATCA TATGAGAAGC ACTTCTCACA GAACAGATGC TTTATACACA 1500
TAAATACTTG TTAAACATGA TTTGATTATA ACTGCAGATC AATAATCGTG CAAAATAGCC 1560
TTCTGCAACG TCTGCGGTTA TATAAAACAA ATAAATACAA CACATATAGC GCATACAGAC 1620
CTTACAGTCT CTGATATGTT ACCAATTACA GAAAAAAAAC TACACACAGC ATACGTTTAG 1680
TCCTTATTTA GGTTCTAAAA CAACATGCAA CATATAGCTC ACAGTCAGTG CAAACCTCTC 1740
ATCTGTATCT TTGATCTTCA CCAGCACATG TAACTACTTG TTAAAAAGTA ATTTCATCAT 1800
TCCGAGTTCA TAATAGTCCA AAAAGTGATA ATAATAGATA TACAGGGCAG TTTGTTTGTT 1860
TTCATGTTTT AGGTTGCTGA AAAAATCTTT TTCTCCTTTG TTTTTTCACG CTTCACTCTC 1920
ACGTTTGTTC ATTTCTGAAA CAAACACGTT ATTATCATTA GCTCAAGAAG TTTGTTATTT 1980
CAAATATAGA CATGTGCATG TAGACGTCAC TGCACGTGGG CTCGCTGA 2028