EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00163 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr13:13118414-13119683 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr13:13119088-13119099GATTTAATTAA+6.02
NR2C2MA0504.1chr13:13119656-13119671TGACCTCTGACCTTA-7.04
Nr2f6MA0677.1chr13:13119656-13119670TGACCTCTGACCTT-7.28
PBX2MA1113.1chr13:13119579-13119591CCTGTCAATCAA-6.44
PBX3MA1114.1chr13:13119576-13119593CCCCCTGTCAATCAAGG-6.3
RXRBMA0855.1chr13:13119656-13119670TGACCTCTGACCTT-6.55
RXRGMA0856.1chr13:13119656-13119670TGACCTCTGACCTT-6.58
RxraMA0512.2chr13:13119656-13119670TGACCTCTGACCTT-6.62
ZNF384MA1125.1chr13:13118978-13118990AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr13:13118979-13118991AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr13:13118980-13118992AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr13:13118981-13118993AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr13:13118977-13118989TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr13:13118577-13118589ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
CCAGTCTATT ACCAAGGTCA ACTGTCATAT AAAACCTGTT GATACGCCAT ACAACATGCT 60
GGGTACCACA CAATGTGTGG AAACAACATA AAGTATTTAA GTTAACTTAT CAGTTTTTAC 120
AAATTTAAGT GGATTGAACA AAAAACAATT AAGTTGCCCA ACCATTAAAA AAAAACTCTA 180
GAGCTGCGTT CGAAATCGCA TACTTCCACA CAAAATAGTA CACTAAAACA GTACGCGAGC 240
CGAGTAGCAT GTCTAAATTC ATAGAATTTG AAAAAAAGTA CGTGCGAATT ACCTGGATGA 300
CTGACTACTT CTGGCGAGAT TCTGAAGTGT GCTTCAGCTT GACGCTACAC TATCCCATGA 360
TGGACCGCAA GAGAATTCAG AATTCAGTTT ATTTTGGTTT AATTTTCACT GCTGAAAGTT 420
CAAACACTGA AGAGCAAATC CATTGATGCA CAGCTCCACA AGTCCCAAAC CAAGCAAGTC 480
AGTGGCGGCA GTGGCAAGGG ACAAAACTTC ACCAATTGTC AAAAGTGAAA GAAAAAAAAA 540
TTCTTGAGAG AAACCAGGCC CAGTAAAAAA AAAAAAAAAC CTTACAAAGA TTTTCCATCA 600
GGTTCTAGAT GGTCTTGGAA AATTTCCTGC TTACCTGAAG CCACCAACAA AATGCTACTG 660
TCACTTTCAG AGTGGATTTA ATTAATGTCC AATAATAATA CATGAGAAAC ATGAACATTC 720
AGGTCGAATA GAACATGGCT AAATTACACA CTTGCCCTTT AAACATTTGT AAACCTAAAT 780
GAATGACACA TCGCACCCAA GCACTAAATA AAGACATATA CCGCTGTAGC GAACAGACAA 840
AAGACACATT TGTCAGTGGA TTAAATATTC AGCATTTCAT TACTGAAGCA TGTAGAATTT 900
CAAGCACTGG TGGTCCCACA GAGAACCGCG ACTGAAATTG AGTCATCTCT CTGAGGACGA 960
AGCAGTCTTT CTTCACTCGC TTGTCAATTG AGCTGTTGAA TATGTTGCGA GCCACTTGCA 1020
TACACACTCC CCAATGCAAC ATTTTCACAA AACATCAGTG TGTATGTGTG CGTGAGGTGT 1080
GACTAACCCA CAGTGCCACA GATTAGCATT CTAACAAAGC GACTTCGGCT GCCATATGTG 1140
AGCACGACAA AGGCCACGCC TCCCCCCTGT CAATCAAGGT ATCTAAATCG CCACGGCAAC 1200
ACCCCCTTAG AACATCCCCC TTCTGATGAC TCAATAGAGA GTTGACCTCT GACCTTAGAA 1260
CCCTGCCAG 1269