EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00151 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr13:5633328-5635428 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr13:5634668-5634684GTTTGTTTATTTTAGG-6.02
FOXE1MA1487.1chr13:5635292-5635307GATGTTTATTTTAGG-6.04
FOXE1MA1487.1chr13:5634669-5634684TTTGTTTATTTTAGG-6.74
Foxj3MA0851.1chr13:5634666-5634683ACGTTTGTTTATTTTAG-6.22
IRF7MA0772.1chr13:5634503-5634517ACGAAACTGAAAAA+6.03
MEF2CMA0497.1chr13:5634750-5634765AGTCCAAAAATAAAA+6.17
NFYAMA0060.3chr13:5634554-5634565TCTGATTGGCT-6.32
NFYAMA0060.3chr13:5634876-5634887TCTGATTGGCT-6.32
ZNF384MA1125.1chr13:5635346-5635358GTTAAAAAAAAA+6.04
ZNF384MA1125.1chr13:5635052-5635064AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
AATTACATCT TTTTTTTAAA TTATGTAATT CTGCATCCAA TCCAATTCTT ATCCAGATGC 60
ATTAGGCTTA TCTGATAAAA AAGACCATCA TAGAAGCCAT TCAGGATACC CTTGCAGCCT 120
CACAAGAACA TACTAAAACC TCCTGAAACA CCCTACTCAT CCCCCAACAA CACCCTGATA 180
TCATAACCTC GCTCACTGAC TTTTAAAAAG ATCATGCTAA AAATCAAAAT ATGTCGTTCA 240
GCGCTCATTT CTGTGCACAT TCTGAAGTGT TGATACCACG TTTCCCAGGC CCTCCCCGAG 300
TCCTCCAATG CTGGGCCGCT CCGCTCATTT GCATGCCGAT GGCGCGCAGA TTAGCGACAT 360
TCCGCTGCAC ACAAAAAGCC AGTCAGAGCG ACACACACAC ACACATACTG CAGCGAAACA 420
TCTCACCCCA TTTCACTCTT ACCCAGTCAA TGCATTCCCT ATTGACAGCC AGGCCCTGGA 480
ACAATACCAA GACGCAATGT AGGATCAATC CTGCTGTTTG CTCCTTCTCC CCAGAGCGAA 540
CAAAGAGCGG GAAGAAAAAG GGCCCGAACC CCGACTGTTA AAAGAAGAAG AAGGGCTGAG 600
CGAGAAGCAG GGGGTGATGG GTAAGCATTA GGGGAAAATG GGCTTGACGG GCAGCTGGAA 660
AGAGTAAGCT CATTTAGAAA ATCGACATCC CCAGCTGAGA TAAAACCAAT GATGATTTGT 720
ACTGTATCTT CGGGGGATAA AAGCACTTCT ATAGGATTTC ATAGCACCCA GCATGAAAGA 780
GGTTGGCTGG GGGAAGAGAA GCGGCTACAT TTCTCTGCGA GTTCCCATAA TAAGTAGGGA 840
GAGTTAAACA GTGGCGCTGG GAGAAGTGTA CTCTTCTCTG TTTGACTCCG CCAAGCTCTT 900
TTCAGCTGCG CTGTGACACT TGAATTAATA CAGAAACGGC GGTGCTCCTT CCTGAGGATG 960
ACGGACCNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1020
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNTCA GACCTCAGTC 1080
CAAAAAAACT ATTGGTTGGA ACTGATTGAT TCACCTGAAT TGGTATTAAA TGGTGAGAAA 1140
TCTTAAATGG TGGCTGTTGA ATTTGATGCT GAAGAACGAA ACTGAAAAAT GGAGGACGGT 1200
TTTGATGAAA GTGATGTTTT ATGATATCTG ATTGGCTGGT AAACTTTTAA AGTCATCAGG 1260
AAATAATACA GTGGCACTTC CATTATTAGA AAAAGTAGTT TATAAAATGT GATTTAATAA 1320
TTTAATATGA ATTAAAAGAC GTTTGTTTAT TTTAGGTCAT TTAAAAACTG TTAAAATTCT 1380
TTAAAAACTG TTTAAAAATG TTTTTCTTTT GCTTCGGAGC GCAGTCCAAA AATAAAACAA 1440
CAATTGGTTG GAAAATGGTT CATCGGTATC AAATATTAAA TGATGATTGT AGAATTTGAT 1500
GTTGAATAAA ATGGTGGATA TTTTAGATAA ACAGGGTGTT TTATGATATC TGATTGGCTG 1560
GGCAACCTTT AAAGTCATTG GGAAATAGTG CAGTGGTACT TCTGTAATTT GAAAAAGTGG 1620
TTTATATGAG AGTAATACAA TAATTGTGTA TGTATTTAAA GTTTCATTCA TTTTAGGTCT 1680
TTTAAAAACA TGTTTTTCTT TTGCTTCGGC CTGCAGTCCA AAACAAAAAA AAAAAACAAT 1740
TGGTTGAAAT TGATCATTTC ACGTGAATCG GTATCAAATC TTAAATGGTG GCTGTTGAAT 1800
TTGATGCTGA AGAAAACAGC AGACGGTTTT GATGAAAGTG ATGTTTTATG ATATCTGATT 1860
AGCTGGGAAA CTTTTAAAGT AATCAGGAAA TAGTACAGTG GCACTTTCAT TAATAGGAAA 1920
AGTGGTTTAA AATTAGTGAT TTAATAATTT TCTATGTATT TAAAGATGTT TATTTTAGGT 1980
CATTAAAAAA GCATGTTTTT CTTTTGCTTC GGATCGCAGT TAAAAAAAAA CAAAACAATT 2040
GGTTGGAAAA TGGTTCATCG GTATCAAATA TTAAATATCA GTGTTGGGCA AGCTACTTGA 2100