EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00135 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr12:27611404-27613007 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr12:27611428-27611440CAGCATATGTTT-6.04
HOXA13MA0650.2chr12:27612493-27612504GTTTTATTGGT-6.32
HOXB13MA0901.2chr12:27612493-27612504GTTTTATTGGT-6.32
LMX1BMA0703.2chr12:27611973-27611984ATTTTAATTAA+6.62
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Enhancer Sequence
AGCGGAATTA ACTGCCAACT TATCCAGCAT ATGTTTTATG CAGCAGATGC CCTTCCAGCC 60
GCAACCCAAC ACTGGAAATA AAATTAAATA TATTATATAT ATAATATATT ATATGCTCAA 120
TTATACTTTG ACTTGTGCTT TGACTGTATG CTTTAATCTA ATAGCCTCAA ATAACCTCTG 180
GCCATATACC ATCTACAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAGAA ATGGAGAAAA AAGGCAAAAT 240
TAAAGATTTT TCCTTTAATA TAATTATTTT ATTTTAAACG TGCTGTATTT TAAAACTTGG 300
ACAGAACTTT TTTTGATTGG AAAGTCTGTA AAACTGAAGA TAATGTCCTG GCAGAATGAT 360
TATATTCTTT ATTATTGTTA TTAATTTTTA TTGAAATATT ATTCATATTT TTATTCATTT 420
TTTTATTTAA TTCATTCACT TTCTTTTTGG CCTAGTCTCT TTAATAATGA GGGGTCGCCA 480
CAGCGGAATG AACCGCCAAC TTATCCAGAA CATGTTTTAG GCAGCGGATG CCCTTTTAGC 540
CCCAACCCAA CACTGGGAAA TGTTATTTAA TTTTAATTAA CTCCCAATTA ATTACAACTT 600
TACAACATAT TTTTTAAATC TGTTTTATAA ATTGTGCTTT CCCAAGACCT GTCAGAAATT 660
GTGACATTGT CCAACTGAAA ATACTTCAGT TGTGGTTTAT ATTTAACCAT GGTCAAATAT 720
CGGGAAAAGT AAACTAAGTC AATATTTTAC AGACAATAAT TAAATGATTT ACCACTTTTA 780
AACAAATAGG CTAATGTTCC AGTATTTATC TTTGGGAAAC AATGCTCGCT TCATAGCATC 840
ATTGCAAAAA AAAGCTCTTT TTCCCTCACA CTGCATAAAC GGCTTTCATA CTGTACATGA 900
AGACTTGCAG CTACCTTTAT TTTAGGAGGA AGTTCTTCTC TTCACGAAGT TTGAAATCCC 960
CTGCACTGGT CCTTCTCCGC CCATATAAAT GTCGTTTTCT TTGTGTTCCT CGACAAAAAA 1020
AAGACGTCCT AATATAATAA ACATGCTCGA ATCATATAGC GTGTTTGGTC CAATCCCAAA 1080
CTCTTCCTAG TTTTATTGGT TTGGTGTAAA CAATACGGTT CCAGCTGTTT CACCAGGCAT 1140
GTTAGTGCAG TGCTGATTGA CATTTCTTTA CTGCAATCAA AAGAGAGTCT GAGTTATTCT 1200
CGGCTCTGGT TGGTCGACGC GCCTTTTGGA GGCGTGTATT GGAAGTTGAA TCCGAATCCA 1260
GCTGTGAATT GGTTCGCATG AGCGGATTCG TGCTATAGAC CGTTTTGCCG ACTGGAAGAA 1320
TCGTTGGAGA CTTGAGTCTT TTCAAAATAA TGGACAAGAC TTCAGCATAG GGAGCTCTCT 1380
TTTACACATC GTTTTAGAAC GAGCTTAATG TTTTTTTGTC TTTTCATGTG CAGACAGAAA 1440
AGCTCTGCCT GCATCTTCAG ACAAGACTCT GAAGGATTTT ACTTATTATC TAAGGATCTA 1500
TGAGTGTAAT CGTTGTTAAT TCGTGTGAAA ATTAGATACT GCGGTGATCC ACAGAAAAAG 1560
AAAAAATCCT AAATTCATAT CCATTACTAC TTTTAAGTGC GCG 1603