EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00133 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr12:27059835-27061292 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARAMA0729.1chr12:27061079-27061097GGGGTCATTCGGTCATGT+6.01
RarbMA0857.1chr12:27060428-27060444AGAGTTCAAAGGGTCA+6.36
RargMA0859.1chr12:27060429-27060445GAGTTCAAAGGGTCAA+7.32
Enhancer Sequence
TTTTCTGTAT TTGTATATAT TTTAATTATT ATTATTATTA TTTATTTTAT TATTATAATT 60
TTTTTAAATG TCAGATGCTG ATTGTTTTAT TTGGGTATTG TTTTGTTGGG GCTAGATAGG 120
ATTGTATATG GTGTGTGGAT TGTTGTAAAA TGTAAAATGC TTTTTGCAAG AATAAAAATT 180
CCATGACAAT AAATAAATTC ATGCATGTTT GCAACCAGAT AACGATAAAA AATTTTTTCC 240
AACAATCCTT TAAAGCATTG GCATAAGTCA ATAAATTAAT TCTCATTTAT AATACAACAT 300
TTTTCAGCAT ATAATTCCCC AATGCTATTG ACTACAACAG TAGCAATCTT TATATGGTAC 360
ATCGGTTAAC TGAATTCAGA GCTGAAGTGA AAACCGCTCT TCTAAGTTCA CCATGATTGA 420
TATTTATCCA CTGATACCTT GCAAATCCTT TTTGATAAAC TACCATACTT TCCCCACATC 480
TTCTTCAGAA ATATTTACCA CACAGGTCCT AAACCACCAA CACAAACATC TCCTAAGTGC 540
CTGAAGTGTC TCTTGCATGT GTGCAGAGGT TAATTAGGAG CAAAGAGCTC CACAGAGTTC 600
AAAGGGTCAA ACCATAGACA GAATTGAGCC CACGAGCCAA AATGTTATCA TACCATTTAA 660
CAAGAAGTGC ATTACATAAG CCGATTGATA GCAATTGACT CTCATAACAA AAAAAGATGG 720
CTTCCAATGC CTTCATATAT TGACCCCAGG TCTCTGAAGG GGTGTGTGTG TGACCAGATT 780
GGAGTGTGAT TTCTGTCAGG TCGGGGTGGT TGAGTATGGG ATGAGGCGAA GGGGGGGGCT 840
CTCAGATGAC AGAGTTCTGC CCCTCCCCCA AGTGAAACGC AAATGAAAAG GAATGCAGAG 900
ATAAAAAAGC CTGTGTTTCC AGATAAGGGG ACAGAAGAAA GGAGCGGGTG AATGCTAAAA 960
GAGCTCTCTT GGGGAGATGA GAGGCGCTGA TGGCAGTGTT GGTGGTAGGA GATCATAGCA 1020
GGTTCCTCTC ATCAGCCCGG GCTTGTGTTT GATACTGGGT CTTTGTAGCC CTTTCAGCTG 1080
TGCATTGTTG GGAGGTGTAA TCCCGGGCGG ATTACAAAGG CAAGATCCTT TCATATGGCT 1140
GTGCCCAGCA GGCAGGAGGC AGTGCGCATG CTGAAGTGGA GGGCCACGCT CATTCCTCTA 1200
TCTGCCTTCA CAAGGGGCCA TATAGCTGCA GGGACAGTGA CGCAGGGGTC ATTCGGTCAT 1260
GTCCTCTCAG TGGAATTCTG CTCCCCCTTT TCCATTCACA TGTTTTTCTT TCATGATCGT 1320
CCTCCACCCT GTACCTGTGT GCAACACCTT ACTCTAACTG GCGAATCCAC AGAACAAGAT 1380
GCCTCCATTA AAGCTGTAGA CTCCACAAAT ATTATTGGAG TATGTTTTAC AAGAAAATAC 1440
AGCCTGATCT CACGAGA 1457