EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00128 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr12:8489490-8491566 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr12:8491331-8491347GTTTATTTACTTAAGT-6.77
FOXC2MA0846.1chr12:8491332-8491344TTTATTTACTTA-6.07
FOXD2MA0847.2chr12:8491333-8491346TTATTTACTTAAG-6.15
LMX1BMA0703.2chr12:8491057-8491068AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr12:8491060-8491071TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr12:8491056-8491067TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr12:8491056-8491067TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr12:8491056-8491067TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr12:8491056-8491067TAATTTAATTA+6.62
RREB1MA0073.1chr12:8490524-8490544GGTGTGTGTGTGTGGGGGGG-6.17
RREB1MA0073.1chr12:8490526-8490546TGTGTGTGTGTGGGGGGGGG-6.38
ZNF740MA0753.2chr12:8490537-8490550GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr12:8490535-8490548GTGGGGGGGGGGG-6.92
Enhancer Sequence
CAGCAGAATG CCTAAACTCA ATACCTATGT ACCTATGATC CAGTCTCTGT GCTCTCTGGG 60
ATAAAGGTAA AGTCAGAGCT GCAGAGCTGT TGTCCAGGGG TGAAGACACA AAGGCCCAGT 120
GGCAGGTCTT TTCTCCCCCA AAGCCGATAC CACCTGCAGG GCCCGGGCCT CTCCTGAGTG 180
TCCCAGCACC ACTCTCCAAA TGATGATTAA TCACGGAGTG CTAAGAGGGG GGGGGTGGTT 240
GCACCCTGAC ACAGCCATAA TGCTGGTCAC CAGAGTCTGG ATTGGCCAGC GGTGGTCAGT 300
GGGTGGATGT CCGAGGAAGA TGGATGACCT CGACCTCCTG TCATTAACAA GAGAAGAAAC 360
AAAACAGACA ACAAAAAGAA AGGCAGCACG GTGTGAGGGA GAGTTTGTGT GGGAATAAAT 420
GAGAGTTTTG ACATTAGCGA ACGTAAAGTA AACGCAAAGT AGTCCCTGAC ACGACATGAC 480
AGCGCTGAAC TTGTGGAAGT TTGAGGATCG TTTGCTCTCA TCAGCGGAAA GAGGAGCCGA 540
GGTTTCTCTG ACAGTTACAA ATGAAGCCGC GATTCATTAT TTTCCAGGGA ATTCGCTCCT 600
GCGCAGACGA AGATGGAGAT GCAGCCGTGG CGTCACTGCC CATTTGGATG GAGATGAATC 660
AAGGCGCTTT AGCCCAGACG CAGCACTGAC AATCACATCA GCGAGGCTAT CGGACTCCCC 720
TCTACTCCTG GTGGACGGAT CCGGTGCGGA GCGGAGCGGG TAATAAAGGC TCCTACTGAA 780
ACCCCATTAA GCCCGGTCTC CAAAGACCAG CTCATTAGCA TAGCGGAATA TTCCCCCCGT 840
TTGTGTAATT CTATCAACTC TTATTGCTTC CACTATCCTA TTCTTAAATG ACGCTAATAA 900
TGTGGAAAGT TTAGCTGTAT AAATGAGGCT GTTCTTGCGC TTTTGCAGCT TGTGTTCATT 960
TTAATCGGGG GTCTGGTTAC CTCATTCACA ATCCCCCTAA TGACCCATCT TTGTTAATTA 1020
AGCAGACGAG GACTGGTGTG TGTGTGTGGG GGGGGGGGGG TGCACATGCA AGAAAAGCCA 1080
CAATTCTCCT TTGTTGTCAA ATTGACACCA GTGTCTGTTG TCTGTCTGAA ATTAAGGACA 1140
GATTTGGATA CAAGCATGCT ATTTGGCATT TAGCACATGT AATAGACGTG AAGCTGTAAA 1200
TTAGGAACAA ATCAGTGACT TTTAAATCAG TTATTTCATG ATCACTACCA TTGAAAAATC 1260
AGGGAAAAAT GTAATTATTC CACCATCTAC CTATTCTTTT ATTCCCACAT CCAATAATGT 1320
TTGAGAATCA TGTAGTTTAA GTGTTCTTGC TGCCTTACAA TTTTAAGTTT ACTTCACTTA 1380
AATATTGAAG TTGTCTTAAC TCAGGTTAAA GTTGACAGGA CTTGACAATA CAAGTGTAAT 1440
GGACGTGGTC TAAGTTTAGC TAACTTAAAT AGATAAGTTG TTGTAATTAA GAATGATGTT 1500
AATAGGACTT TATAATTGAA GTGTAATGTT TAGTGAACAT GAATATTCTC TCATTCACTC 1560
TACGGCTAAT TTAATTAAAT TTACTTATAC TACCTGTCTT TGGAGGAAAC CAGAGCGTGC 1620
AAATACAAAT TTCACCAAAG ATGCAACCCA TCAGGCACAC AACATCATAA GATGTTAATA 1680
TTAGGTTAGA TTAAGGTAGT GACATCCTGT GACCAAAATT CAATGCCTGG CCAGAGTCTA 1740
AGGACAACGT TATTTTGATA TCAAATAACT AGGCCCACAC GGAATCTGTG CACGCAGAAT 1800
TTTGCAGATT TTCCGCAGAT TTCCAGTCCA TCATTAATTC TGTTTATTTA CTTAAGTAAA 1860
TGTGTGTAAA TCTATATTTA TTAATTTTTT AAAGTAAATA CAGTAATATT ATAGACTAAT 1920
GTAAAAATGT TCATCTGATT TATGTACAGT GCAGTTTGTA AAGTAATATT TATTTTAGTA 1980
GATATATTAT ATTAGAGACT TGCTTTGTTT ACCAAATAAA GTAAATCTAA CTGGATTTGC 2040
ATTCAAACAT TAAATAAAAG TTAAAAAGAT TTTATT 2076