EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00125 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr12:5700085-5702573 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr12:5700144-5700156TAAGTAAATAAA+6.07
IRF1MA0050.2chr12:5701061-5701082AAACTAAAAATGAAACTAAAA-8.3
LMX1BMA0703.2chr12:5700761-5700772TTAATTAAAAC-6.14
POU4F1MA0790.1chr12:5701932-5701946CATTATTAATGCAT-6.18
POU4F1MA0790.1chr12:5701929-5701943TTACATTATTAATG+6
POU4F3MA0791.1chr12:5701929-5701945TTACATTATTAATGCA+6
Rarg(var.2)MA0860.1chr12:5702061-5702078GACGTCAAGCAAGGTCA+6.19
SOX21MA0866.1chr12:5700219-5700234AACACTGACATTATT-6.38
ZNF384MA1125.1chr12:5700267-5700279TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr12:5700266-5700278TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr12:5700268-5700280TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
TTATTGGCAG TATTAGCAGC ATTATAATGG ATGTATAAAT TAGCTAATGA ATTTATAAAT 60
AAGTAAATAA ATATATCTTG TTGCCAATAC AATTGTTCTC AATTTCATTT AAAAGGATAG 120
TTCACTCAAA AATGAACACT GACATTATTT CCTCACCCTC TTTTTTCTAA ACACGTTTAA 180
GTTTTTTTTT TTATTCCGTT GAGCACATAA TAGGATATTT TGAGGATTGT TGAAAGCCAC 240
CAGCCATTGA CATCCATAGT TTATTTTTCT GTTATGGATG TCAATGGCTA TTCAACCATT 300
CTTCAAAATA TCATCTTTTG TGACCAACAG AAAACACAAA ATGGCAAGCC AATTTTCATT 360
TCAGAGTGAA GTTTATATTT AGTAGATACT TCCAATACTT TATTTAGTAC TATAGTGATA 420
TACTAAAATA ACCCAAACTT AACTTAATTT AACTAAGCTA AAAACTTGAC TAAACTAAAT 480
TACACTAAAA ATTTAACTTA ACTAAACTAA AACCTTAACT AAACTAAAAA CCTAACTAAA 540
ACCTAACTAA ACTAAAAACT TAACTAAGCT AAAAACCTAA CTCAACTAAA CTAAAAACTT 600
AATTAAGCTA AAAACTTAAC TTAACTAAAC TAAAAACTTA ACTAAACTAA AAACTTACCT 660
TAACTAAACT AAAAACTTAA TTAAAACCTA ACTAAACTAA AAACTTAACT AAGCTAAAAA 720
ACTTAACTAA ACGAAAAGCT TAGCTTAACT AAACTAAAAA CTTAACTACG CTAAACAACT 780
TAACTAAACG AAAAGCTTAG CTTAACTGAA CTAAAAACTT AACTAAGCTA AAAAACTTAA 840
CTAAACGAAA AGCTTAGATT AACTAAACTA AAAACTTAAC AACAGTAAAA ACTTAAATAA 900
AAGAAGCTAA CAAAACTAAA CCAAACTAAT CTAAACTAAA AGCTAAACTA AACTAAAAAC 960
TTAACTTCAC TTAACAAAAC TAAAAATGAA ACTAAAAACT TAACTAAGCT AACCTAAACC 1020
CTCAACTAAA CTAGACTAAA CTAAAATCTT AACTAAACTA AAAACTTAAC TAAGCTTAAA 1080
ACCTAACTTA ACTAAACAAA AAACTTGACT AATCTTAAAT AAAAACTAAA CTAAACTAAA 1140
AACTTAACAC TACACTTAAC AAAACTAAAA ACAAAACTAA TAACTTAACT AAAAAACCTA 1200
ACCAAGCTAA ACTAAAACCT CAACTAAACT AGACTAAACT AAACTAAAAA CTTTACTAAA 1260
CTAAAAACTT TACTTCACTC AACGAAACTA AAAACTAAGC TAAAACTAAA AACATAAGTT 1320
AAACTAAACA CTAAACTAAA CTAAATCAAG AACTTAACTA AAACGTAACT TAAATAAATA 1380
TTTTTTATTA AATATATATA TATACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1440
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA 1500
CACACACACA CACACATTTA ACCCATCGCT GCATTTATTG TATAAGGATG GTTTGTTCTG 1560
TAGACTATTG GAAAAAATAT AGCTTAAAGG GACTAATAAT ATTGACCTTA AAATGATTTT 1620
TTAAAAATGA AAAACTTTTA TTCTAGCCAA AATAAAACAA ATAAGACTTT CTCCAGAAGA 1680
AAAAAATATT ATCAGACATA CTGTAAAAAA TTCCTTGCTT TGTTACACAT AATTTGGGAA 1740
ATATTTACAA AAGAAGAAAA AAAAGGGGGG CGAATAATTC TGACTTCAAC TGCATATACA 1800
TATTATTAAT ACAATGCAAT AGCATACTAA AATACAAATT TATGTTACAT TATTAATGCA 1860
TGCATTATTT TAAGGGTTGG GATGTGAAGT CTGACAATTA ATTTAAAAAT AAATGATGTC 1920
AAGTAATCAC TCTTCAAGAC TATGTTTGCC TCTAAAAATG TGTAACTGTA ACATTAGACG 1980
TCAAGCAAGG TCATTGTTGG TGTTATGTTA GGTGAAGTTG AGCGTGGACA GACAGCAGAT 2040
CCTGGTGAAT GTGTGTGTTG TGTTGTTCTG ATCTGATCTG GGGTGTGGGA CGGAGAGCAG 2100
AGGGTGAGAA GGAAAGGTAG ACGCTCTTTA AGGCTGTAAT TATGCCTGTG TTACGGAGAA 2160
GAACAAAGCG CAGCCCTGGA GTCATAGTGC AGGGATGTGT CTTAATACAC ACGAGACTCA 2220
GCGCTAATAA CAATACAGCC GAGCGTGGCC CAGACACACT GGCGTCTGCC GGCCTGAAAC 2280
ACACTACCAT GCATACACTG GAGTGAGTGA GTGAGTGTGA GTATGTGCGT GAGAGAGAGT 2340
GTGTATGTGT GTGAACGTGC GTGCAAGTGT GTGTGTGTGT GTATATGTGA GTTTGTGAGT 2400
GTACCTGTTT GACTGAACCT GTGTGTGTGT GTGTGCGTGA GCGTGCATGT GGGTGTGAGT 2460
GTATGCCTGG GAGTGTGTAT ATGTGTGT 2488