EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00124 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr12:4970319-4972886 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr12:4972286-4972299GTATAATTAATTA-6.12
NFYBMA0502.1chr12:4972708-4972723CTGATTGGCTCCTGT-6.32
NFYBMA0502.1chr12:4972862-4972877CTGATTGGCTCCTGT-6.32
NFYBMA0502.1chr12:4972657-4972672CTGATTGGCTCATGT-7.52
POU4F2MA0683.1chr12:4972284-4972300ATGTATAATTAATTAC+6.13
TP73MA0861.1chr12:4970760-4970778AGCATGTTTTAACATGAC+6.07
ZNF384MA1125.1chr12:4971516-4971528TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr12:4971515-4971527TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
AAGGCCCAGC TCTTATAGCC TGTACATGCT CTTGGCAAGC AGTTCCAGCT GCAGTGTTAA 60
CCTCATAAGC CCATTGAGAT TTTCCACATT ATTCTGTCCT CTCAGGCATT TGTCTTTCAT 120
GGAGGACCAG CCTTTTTGGA GGGACATGAA TAAGTGATGT TGTAAAGATG CAATATTTTA 180
GAAATCAGAG ATTTGCAATA ACCCGTTTTG GCCACTTGAG AACTGATCAG AAGCATTGGG 240
AATTGTGGCT GTCAGTTAAA CGTTTGACCA ATAATTCAGG AAATCATCAC CATGTACATC 300
AATATTCTTT TAAAAATACA TTATTAAAGT CTTTTTAGAT GGATGGATGT ACAAACAGAC 360
AAATGATTTT CAAGCAAATG CATTTTGATG TGAAATAGAG ACCTAATTTC TTGGGAAAAC 420
TTGCATCATT GCATGATAAG GAGCATGTTT TAACATGACT TTAATAATGT TTTATGACTT 480
GAAGTTATGA CAGAGCAGTG CTGGATATTT TACTGAGAAA GGCAAACACA CTTTTTTGCA 540
GAGGTGTTAC ATTCAAAATG TGTAATTAAG AGGAAATTGA GGAAATGCTC GAGTCGCTGA 600
CCTTGACTGA TGTAGGTTCT GTTTCGATGA GGAGAAAGAG GAACTTGCAT GTTTCAAACC 660
TGACAGTCTA AACTTATTTA TGTTTGTAAA GTGCATCTAA TTCTTCATAT AAGTAGCTTG 720
AAACTGAACA GAGAGTTACA CACTGTTTCA GTGTCAGCAC TTCTTTCTTT TCTCTTATTT 780
CAGATCTTTA TATCATGCAC TCACACACTC ATACCTGCCT CTTTCTCTCT CCATCCGTCT 840
GTTCTACTTA TTTCCTCCTC CCCCTTTTCA CTCGAGTAGA GTCGCTCTTC GAGACAGATG 900
TTCATTAGTT GTGACTGCAG ACGCTGAGTG TGTGCGCGTG TTTGCATGAG AGTGTGTGTG 960
TGTGGCTCAG GGTCAGCATG ATGCTCGCAG TTGGATAGCT CAGAGTTGAA CTGTTGTCTG 1020
ATCAGCTGTA TGGCCGTACT GGCTGATCTG AGCGAAAACA TGGTGGATTT TTACACTAAG 1080
ATTCGCTCCA GCCACCGACC GAGAAGTGCA ATGCCGTTCT CTCTGAACTC TCAGGTATGT 1140
CCAAAACCCG TTTCTGGACA CATTAATGCT ATTTGCTGTT GTTTTGATTT GACTGCTTTA 1200
AAAAAAAAAC TTAATATTTA ACACATCGCA TGGTGTTTAT ATATGAGCAG TATGCTCGGA 1260
AAAGTAGCAT ATATGTTGAA ATGTGCTTTA AAGCATGCTA TATTGTTGTT CTTAGCGAGG 1320
ATGTGGTCTC TTCCTGTTGA GACACTCCCC GCTGCCGATA ATTCGAAATG CACTTGTCGT 1380
GGTATACATC CAAAAAAGTT TGTTGTAGTA AAGTTGTCCA ATTCTTTAAA ACTCTAATAT 1440
ACAGAATATG TACAATGCTT GAGCTTCGGC ATCACTTCAG TTCTGGTCAA AAAGGGAAGC 1500
TTTGTTTATA TTAGGCCTGC ACGATTATTC GTTTCTGAAT TGCGAGTTGA AAGCTGGGTT 1560
TATTTTGATG CACAATGATC AGATATGGTT ACAATTATTT GACAGTTCAT TACCCTGAAG 1620
GATGTGAATA ACGTAACACA ATCTAAATGT GCAGATTTTT TTAAGTTTTA GAATTATTTA 1680
TGCTCTTTGC ACGCTAAATA GCAAAAAGAT TTGCTGTTCA ATATTAATGT TGGTTTTACT 1740
GATGTAAACT TGTTGACAGT GTGTTTGGAT GCTTAACAGT TTAAGATTTT ATATATAATT 1800
GATTTAATTT TATTAAAGTT ACTGTAGTTA TTTCCTTAAT TTGTCATCGC AACTGACAAG 1860
TTTATTATAA AAATGGCAAC AATGATCTAG AGGATTTAAA TCAACAGTAG CATACTGTAG 1920
CCTAGGGCTG GGCGATTAAT CGAAAAGTAA TTGAAATCGA AATTCATGTA TAATTAATTA 1980
CATTTTTCCA GGTCATTTTT TTCAATGACT TTCCCTACCG TGTGTGGTTG GTTACCCCTC 2040
TCTGTTAAGG CTGAATTATA CTAAAGTCCC TTTAAGACAC GTCATTTCAC TCGACAGCCA 2100
TCTTTGAAAC GCCTCTCGGG CAGTATGCTC GGGCATTCTG TTTGAATGGG AAAACATCAA 2160
ATTTTCCAAA ACTACTTGCC AATATTATGA TTACATTACA TATTATGAAT AACCAATAAA 2220
ATTTAACAAC AACTGTCTGC TTAGTCTCAT TACAAAATGG TCGTATCACT CAAAATCTGC 2280
AGAAACTTAT ATCTAGTCCA AGCCCCTCCC CTGGAGAATC GTCATCCTAT AGCGATTGCT 2340
GATTGGCTCA TGTACTAGAA GGCGGGTTTT TTTCAACATG TAGCGATCAC TGATTGGCTC 2400
CTGTACTAGA AGGTGGGTTT TTTTCTCCAT GTAGCGTTCA CTCATTGGCC CCTGTACTAG 2460
AAGGCGGGGT TTTTTTCACC ATGTAGAGAT CACTCAATGG CTCCTGTCCT AGAAGGTGGG 2520
GTTTTTTCAC CATGTAGCAA TCGCTGATTG GCTCCTGTAC TAGAAGG 2567