EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00118 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr11:40445975-40447821 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MTF1MA0863.1chr11:40447327-40447341GAGCCGTGTGCACA-6.57
RFX3MA0798.1chr11:40447308-40447324TGTTGCCGTGGTAACC+6.14
RFX4MA0799.1chr11:40447308-40447324TGTTGCCGTGGTAACC+6.24
RFX5MA0510.2chr11:40447308-40447324TGTTGCCGTGGTAACC-6.36
RFX5MA0510.2chr11:40447308-40447324TGTTGCCGTGGTAACC+6.54
RUNX1MA0002.2chr11:40447061-40447072AAACCACAGAC-6.62
ZNF143MA0088.2chr11:40447092-40447108AAATGCATCATGGGAA-6.76
ZNF384MA1125.1chr11:40447284-40447296GATAAAAAAAAA+6.02
ZNF384MA1125.1chr11:40446610-40446622TGTAAAAAAAAA+6.07
Enhancer Sequence
TTCTATCAAA TGCTGGATTT TGGTTGCCAT ACCTGAAGAA TAAATGTCTG CATCTGACTT 60
TAAAATCAAC CTGAAATCAA CAAAATATCA ACATCATTTG ACGTTGTTAT TAGAAATCAA 120
AATAACGTCC TTAGACGCTG ACTAGACATT GAATTTGGTC ACCTGACGTC ACAACCAAAA 180
TCTAACCTAA TATTAATGTT TTATGACGTT GTGTGCCTGC TGTACAATAA CTAAATGCAC 240
TACAGAATGT TACGTTTACA CACATCCACA AGTGACATGT AAATACATCA GCTTTTTACA 300
GCGTAATACT CACTCCTCTT GAGTACTTTA ACCTTTACTC ATACTTTGAG TAATATTAAC 360
AACAGATACT TTTACTCTAC TTGCACCACA TTTTTGGTAT GAGTTTTCAG TACTCTTTCC 420
ACCACTGTTT GATTCTGAGC CTTTAATTGT CATTTATCAG GGATTTATAA AGCATGAATA 480
GTCCTCACTT TAGATTAGGC CACAAAACTG GATGAAGTTG AGTTAATAAA GCATTTATTA 540
ACATATGAAT TAACTATTAC TAAATGCCTG AATAATAATA TATAAATGTT GAATTTAATA 600
GCTTATTAAT CCTTTACTAA CTCATTCTAA ATGATTGTAA AAAAAAAACA ACTACTCTTA 660
AATACAAATG ATTTGTAAAT AATGCGATAC TTAATTTAGT CATGAAAAAT TAATCAGTAA 720
GAAAGTATGA AAGAACAATT ATTAAGCACA TTGTAGGTCA AGAATACAGC ATTTGTTTGC 780
AGTTATAAAC TGCTCAGTAA TGACTATCAA TGTAGAGTTA ATGCTTAACA AATAATGAGT 840
TAACTATTTG CTAATGCATA ATAGATTATT CATATAGTGT GTGGTTTTTA TAAAGTGTTA 900
CAATTGACTA AAATGATAAC TGGCTTAAAT TGCATTTATT CAACCATGTT TATATTAATA 960
TTTAGATGAT TTAAGGATCT ATTTTTCTAT ATGCACCAGT TATGCTCAAG TAAGTTTAAA 1020
CGCATTCGTT AACTCCTCCA TTGGAATAAA AATAATAATA CGTTACATTC TGCTGAAAGA 1080
ATAAATAAAC CACAGACCAA CCGAGAGGAA GGAACTTAAA TGCATCATGG GAAGAAAAAA 1140
AGCAGAGGAA GGATGAGATA AGACGGAGTG ATAGTAAATA GCTAAGTTCT AGTAGTCAGA 1200
GTTTTCCTTT GTGCCAGAGG GCTCTCTGAT TGGACAGTTT GCCAGTGTGG GCGGTGCCTG 1260
TGAGTGGGCG AGAGCCAGTC GTTAGTTTGA GGAAATGAGC CTGGTTTGTG ATAAAAAAAA 1320
AGGAGGGGGT GAGTGTTGCC GTGGTAACCT GTGAGCCGTG TGCACACAAA ACATTTTCTG 1380
CAAATGGAGG GGGTTAAAAG GGGGTCGGAT TTCAAAGCAT GTAAACTTCC ATCTTGAGTT 1440
GCGTCTGATG CATTATCTGT GCAACTTTTG TTTTTGCAGA ATGATGGAGA GTATTGGAGC 1500
ACAGAGATCA AAAGAGATAC AGATACTTAA AGGGATAACG CTGCTTTATG CCCATTTGGA 1560
TTATTACTAT AAACAGAATA TTTAGCAGAG ACTGGGCTGA GCAAATACGC TGATAAAATA 1620
GCAACAAGAG GACGCCAATG CCTCGTCACA GTCTCCAGCA TGTTGTACTT CCAGAATAAA 1680
ATATAAAATC TAACTTACAA ATGAACAGTT AGAACCAGTT TTATGGATGT TCAATATCAG 1740
TGAGGTGTCA ATTTTGGTTT AAGCTTTAGA TATTATTACA CTGTAAAATC AGCAGTCAAC 1800
TTTATCAAAT GAAATGACTG TAGTTAACTC AAAATATACT AGTTTT 1846