EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00109 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr11:30261181-30263397 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BARX2MA1471.1chr11:30262383-30262395GTAATGGTTTTA-6.62
Foxd3MA0041.1chr11:30261550-30261562AAACAAACATAC-6.37
GRHL2MA1105.1chr11:30261939-30261954TACAAACCAGTTTGA+6.4
HOXD13MA0909.2chr11:30262863-30262874GTTTTATTGCG-6.32
HOXD9MA0913.2chr11:30262863-30262873GTTTTATTGC-6.02
NRF1MA0506.1chr11:30261631-30261642GCGCATGCGCA+6.32
NRF1MA0506.1chr11:30261630-30261641TGCGCATGCGC-6.32
POU1F1MA0784.1chr11:30262291-30262305CTAATTTGCATAAA-7.34
POU2F1MA0785.1chr11:30262293-30262305AATTTGCATAAA-6.11
POU2F2MA0507.1chr11:30262291-30262304CTAATTTGCATAA+6.13
POU3F1MA0786.1chr11:30262292-30262304TAATTTGCATAA-7.22
POU3F2MA0787.1chr11:30262292-30262304TAATTTGCATAA-7.22
POU3F3MA0788.1chr11:30262292-30262305TAATTTGCATAAA-6.74
POU5F1MA1115.1chr11:30262293-30262304AATTTGCATAA-6.14
Pou2f3MA0627.1chr11:30262290-30262306CCTAATTTGCATAAAT-6.69
ZNF263MA0528.1chr11:30261691-30261712GGAGGAGGAGGATGGGTGGGT+6.25
ZNF263MA0528.1chr11:30261679-30261700GAAGAAGGAGCAGGAGGAGGA+7.28
ZNF263MA0528.1chr11:30261685-30261706GGAGCAGGAGGAGGAGGATGG+7.94
ZNF263MA0528.1chr11:30261682-30261703GAAGGAGCAGGAGGAGGAGGA+9.01
Enhancer Sequence
AAATGACTGA GTGCACCTTT AAGTGATCAG TGTCCCAGCT TGTCCAGTTC AGAGAAGTAC 60
AATTTATGAC TGCATATCTA CAGCATTTAA ACTCCAATAT ACCTTACACT GGTGTTATTC 120
TAAGGAATCA GCCCTTTAAA TGTGGACAGC ACTGTCCAAA AGACGGGCTC TGTTTATAGA 180
AAACACATTT TTACCTTGTA AACATCCCCG TAGGTCCCGC TGCCTATCCT CTGGATAAGC 240
TCGAAATCCT CTTGCGGATT TCGCCTAGAC AGATCGAAAC TAGAGTTCAT CGTGGGGACT 300
CCTACCTCTG ACAGTCAGTG TTAGATTTGC TGGGGTCCCT GACGCGAACG AAATGAGAAA 360
AGAGCAAAAA AACAAACATA CGGCGTCAGA AGGGAATCTC AGTCTCAGTA CTTGTCTGTA 420
ACTTTAACAT GGCTTCCCGT GAGTTCCACT GCGCATGCGC AGAGCTCGTA GAGTGGAGAA 480
TGTTTGGAAT GGGAGGATGA AGAAGGAGCA GGAGGAGGAG GATGGGTGGG TCAGATGACC 540
ACGCATATAA AACAGCAGAT AACCTGTGTT TAGCCAATTT TATATACTAA CCTTGTCTGA 600
AATGTTCTCA AAAGTGTGTT AGTTTTCTTA TACTAAAGCT TGACTATATG TTGACAGTGA 660
CATGGTTTGA TATTTTGTTT GTTATGGATA GTTTTTTTTA GCTTTAAAGG GATAGTTCAC 720
CCACAAATGA AGATTCTGAC ATCATTATTT TCACTTCTTA CAAACCAGTT TGAGTTTCTG 780
TCTTCTGCTG AACACAAAGG AAGTTATTCT GAAGAACGTT GGAGCCACTG ACTTCCATAG 840
CATGTTTTGT TCCTACTATT GATGTCTTTG GCTGCTTCCA ATAATAATAA TAATAATAAT 900
AATAATAATA ACAATAATAA TAATAATGAT GATCATCATG ATAATAATGA TGATGATGAT 960
GATAGTAATA ATATTAAAAA CTAAATATTT AATGTAAAAT ATTTTACTAA ATAAGGTGAG 1020
TTAAATATGT AAGATTAAAA TGGGAATGCA AAATTTGACT GCTAAAGATG GCATTATTAT 1080
TTAATGCTTG AAAGAGTATT TTATGAAATC CTAATTTGCA TAAATAAATA AAAAATGTAA 1140
CTTAAATATT AATCTGTTTT GGATATTACA TAAATGCCGT TGCTGCTGAA AAAAAATATT 1200
TTGTAATGGT TTTAATAGCT ATAATGAGAA TTGCATTAAT TTAAATGTGA AAATGCATGT 1260
TCCCTATATG GACAACTGTT AGAAAATAAT TAGGTGACAT GTAAAATAAC AAATCCCAAA 1320
TTTGTCCCAG AATACAATAG AAACCATTGG CATTTATTGG TTTTAATGGA AATAGTTGGT 1380
GGTTTGTAAT GCTTTTACTT AACGATTAAA ATTTCTGAGG ATATATATAT ATATATATAT 1440
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 1500
ATATATATAG AATATATATA TAGAATATAT ATATAGAATA TATATAGAAT GTCAGAATCA 1560
TTAGCCCCAA TTTCAATTTT TTGTTTTCTT TTTTAAATAT TTCCCAAATG ATGTTTAACA 1620
GAGCAAGGGA ATTTTCACAG TATGCCTGAT AATATTTTTT TATTCTAAAT AAAGTCTTGT 1680
TTGTTTTATT GCGGCTAGAA TAAAAGCAGC TTTTAATGGT ATTTCAAATA AGGGTATTTT 1740
CTTTCGATAT AGTCAACAAA ACAAACCATC ATAATAAAAT AACCAGCCTA ATTACCCTAA 1800
CCTGTCTAGT TAACCTAATT ACCCTAGTTA AGCCTTTAAA TGTCACTGTA AGCTGTATAG 1860
AAGTGTCTTG AAAAATATCT AGTCAAATAT TATTTACTGT CATCATGGCA AAGATAAAAT 1920
AAATCAGTTA TTAGAAATGA GTTATTAAAA CTATTATGTT TAGAAATGTG TTGAAAAATC 1980
TTTGCTCCAT TAAACAGAAA TTGTGGGAAA AAATAAACAG TGGGAATAAT AATTCTGACT 2040
TTAACTGTGT GTATATATAT ATATATATAT ATATATATAT GTATATATAT ATATATATAT 2100
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATTAGGCA 2160
TATTATTATA TATATTAGGC AATTAGGAAA GTTATTGTAA AATTATGGTG TGTTCA 2216