EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00088 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr11:5742988-5745122 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr11:5743042-5743053ATATTAATTAA+6.62
BHLHE23MA0817.1chr11:5743477-5743489AAACATATGCTG+6.04
GSX1MA0892.1chr11:5744682-5744692TTTAATTAGG-6.02
LMX1BMA0703.2chr11:5743045-5743056TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr11:5743052-5743065AAATTAATTAGCT+6.15
Enhancer Sequence
TCTCATTAAT TAAACCCATT TAATAAAAAA ATAATTTAAT TTATTTATTA ATAGATATTA 60
ATTAAAATTA ATTAGCTTTT AACTATAAAA CAAACACAAA ACGGTTACAT TAGATTTCAA 120
ATGACAATCC CTAAACCATC CCCAACATTT GTCCTCTCTT CTCAGATGGG ACGGCGGGCC 180
AAATCAAAGG TTACCATGGG CCAACTTGGG CCCTAGTTTG GGCATGTCTG CTTTAAAGTA 240
TACAATAAAG TAGTGAAGGC TGCAGGATGG CATAGTGGGT AGCATGTTTC CCTCACAAGC 300
AAGAAGGTCA TTGGTTTGAG CCCTGGGCTG GGTAAGTTGG CATTTCTATG TGGAGTTTGC 360
ATGTTCTCCC CCTGTTTGTG TGGGTTTCCA GGTGCTCTGG TATCCCGGTT AGGCTAAATT 420
GTCCGAAGTG AATGAGTGTA TGGATGTTTC CCAGTGATGG GTTGCAGCTG GAAGGGCATC 480
CGCTGTGTAA AACATATGCT GAATAAGTTG GCGGTTAATT CTGCTGTGGT GACCCAAGAT 540
TAATAAAGGG TCTAAGCCGA AAATAAACTG AATGTAATTC CCGTCAGTTT AAACAGCCAT 600
AGTTTTATGT AAAATCACCA TATTACAACA ACAGGTTTGG TATTTAATGT GCAAACTTAA 660
AGTGCTCATA AACAGTTGAA GTCACAACTA TTAGCCCCCC CCCCCCCCCC CTTATGTCTT 720
TTCTAGACAT AATAGTTTTA TTATTTTCCT TTATTTAGCC AGGAGATCAC ATTGAGACAG 780
TACTGTCTCT TCTTCCAGTG AGACCTGGTC AAGATGGCAG GCAGCACATA AAGTTTCATA 840
TAAAAATCAC AAACAATACC ACAAAATTAC AAAATCACCA TTCTTAAAAA CATCAGCTCA 900
TAACAAACAA TTGCAGGTGT CCTTTAAAAT GTTGTATAAA AGATGTTTAA AAGTACTCAG 960
AGTCGGAAGA GTGTCAAGAT TGAGCTGATT TTGCACTTCT ATTATGTTGA TTGTTGGTGT 1020
GAAATGGTAA TAAATTAAAA ATATAGGATG GTAATTTACC TAAAAGAGCC TTTAAAATAA 1080
ATAAGTACAG ATGTAATTTA ATAACTCATT TTTAACAACT GATTTATTTT ATCTTTGCCA 1140
TGATGACTGT AAATAATATT GGATTAGATA TTTTTCAAGA CACTTCTATA CAGCTTAAAG 1200
TGACATTTAA AGGCTTAACT AGGTTAATTA GGTTAACTAG GCAGGTTAGG GTAATTAGGC 1260
AAGTTATTGT ATACCGATGG TTTGTTCTGT AGACTATCGG AAACAAATTG CTTAAAGGGG 1320
CTAATAATTT TGTCCTTAAA ATGGCTTTTA AAAAAATTAA AACTGCTTTT ATTCTAGTCA 1380
AAATAAAACA AATAAGACTT TCTCCAGAAG AAAAAATATT ATCAGACATA CTGTGAAAAT 1440
GTCCCTGCTC TGTTTAACAT CATTTGGGAA ATATTTTAAA AAGAAAAAAA TTCAATAGGG 1500
GCTAATAATT CAGACTTCAA CTGTATAGCA CACCTTTTAA GTATGCACTA AAACTTTTCT 1560
TTATGACTCA GGGGTGTCAA ACTCAATTCC TGGAGGGCCG CAGCCCTGCA CAGTTTAGTT 1620
CCAACCCTGC TCCAACACAC TTACCTGTAG GTTTCAAACA AGCCTGAAGG ACTCAATTAG 1680
TTTGATCAGG TGTGTTTAAT TAGGGTTGGA ACTAAACTGT GCAGAGCTGC GGCCCTTTTG 1740
GGACTGAGTT TGACACCTGT GCCTTATGTG GTTTTCTTTT TCTGTCTACT CTTATCTAAT 1800
TAGTATACTT TTAGGATAAA ACTTCATGTT TATATTTTAA TGTGGGGTAA AGTGGTACTC 1860
TTTAAAGACT ACATTAAAGT GGAGATTAAA GGAACTCGAC GTAGTAGTTG CAATACATTT 1920
GAAAATGAAT TATTTAATTG TCATACATTA TTTGCTATGT TGACTTTAAA TGGCCAGACA 1980
AAATGCAATA CTCACTGTAT CCAGTAGATG GAAACTAAAT ACCGTGGTAA ACAGTGCACT 2040
TTAACTATCT GTTCTCAGAA GTGGCCTGTA CTTGATATAC GATCATTTCT GAACCCTGAT 2100
TTATGTTTAG AAGTATAGAT GTGAGTGATG AGTG 2134