EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00040 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:54372231-54374713 
TF binding sites/motifs
Number: 26             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:54372511-54372523GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54372515-54372527GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54372547-54372559GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54372551-54372563GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54372555-54372567GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54373140-54373152GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54373144-54373156GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54373148-54373160GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54373152-54373164GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54373156-54373168GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54373160-54373172GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:54373164-54373176GTTTGTTTGTTT+6.32
GSX1MA0892.1chr1:54373257-54373267CCTAATTAAA+6.02
KLF13MA0657.1chr1:54372779-54372797GTGCCACGCCTCCTTTTT+6.59
LMX1BMA0703.2chr1:54374392-54374403AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr1:54372413-54372424TTAATTAAATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr1:54372410-54372421ATTTTAATTAA+6.62
NFYBMA0502.1chr1:54374526-54374541CTGATTGGTCAAGTG-6.41
Nfe2l2MA0150.2chr1:54372391-54372406TGCCATGAGTCAGCA+6.1
Nfe2l2MA0150.2chr1:54373019-54373034TGCCATGAGTCAGCA+6.1
PHOX2AMA0713.1chr1:54372414-54372425TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr1:54372414-54372425TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:54372414-54372425TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:54372414-54372425TAATTAAATTA-6.62
ZNF384MA1125.1chr1:54373039-54373051TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr1:54373038-54373050ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
TGAGATAGCG TTGGGTTTCA TTTGAGTTTT TATTAAAGTG CTGTCCGTCA GTGACACTTT 60
TTAAACTGCC CACAAATAAC ACAACATAGT CCTAATAAAA TCTACGAATG AGATTGTACC 120
GATTCATGCG AATTAGCCAC TAAATCAACA AGTTACGAAT TGCCATGAGT CAGCATCGAA 180
TTTTAATTAA ATTATGATTA AAGCATCATC CGTCAGCTCG TGACACCCGT TTTCAACCTG 240
CGCACAAAGA CAAAACAGTG ATTTTGTGTG GTTAGTTTTT GTTTGTTTGT TTGTTTGTTG 300
ATTTATTTAT TTATTTGTTT GTTTGTTTGT TTGTTTGTAT GTTTTATTTT TTGTTTTTGT 360
GGTAATTCGG GCAGCTAGAT GCTGTTTTTC TAGCCTGATC TCACAAAGAA ACATAACTAT 420
ACAACACAAT CTCACGGCAG TTCGTAACTT TTTTATTTAG TGGCTAATTC GTACGAGTTC 480
GTATGATCTA ATTTGAGATC TTACATTTTA GTACGAATTG CTCATCCCCC AATGACCGTT 540
GGGTTTAGGT GCCACGCCTC CTTTTTAAAA TCCTACAATT TCGTACGACT GAACTCGTAC 600
GAATTAGTAC GAATTGGCCT CTAAACTGGC AAAACGTAAA ATACTTACGT TTTCTTGTGA 660
GATCAGGCTG AACTATTTTA CGTTTTGTCA GTTTAGTAGC TAATTCATAT GAGCAAGTCG 720
TACTAAAATC TACGAATGAG ATTGTACAGA TTCATACAAA TTAGCCGGTG AATCAACAAG 780
TTATGAATTG CCATGAGTCA GCATCGAATT AAAAAAAAAA TTTGATTAAA GTGTCATCCG 840
TCAGCTCGTG ACACTCGTGT TCAACCTGCG CACACAGATA GAACAACACA GTGATTTTGT 900
GTGGTTAGTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTTAGTT TAGGTTTTGG 960
GGGTATTTTT GCCAGCTAGT ATGGAACCAG ATTAGTTTCA AAAACAATAC ATTTTCAAAG 1020
GTTTTGCCTA ATTAAACAAA CCTGTCTAGT TAACATACTT AACCTAGTTA AGCCTTTAAA 1080
GTTTAAAGTG CTCTTTTATA AATTATTTTA TCTTGCAAAA TAACTAGTAA GATATTATGT 1140
TCCATCACCT TGTTTTAAAA AATGTGTAAA AAAATCACTT TAGCACAAAA TGTTCATTTT 1200
TTTCGATGGA AATTTCAGCT GGCACTTAGA GGTTTTTGCA TCTGAGCTCT TAATATACAC 1260
ACACACGCAC CTGCACACGC GCACGCACGC ACGCGCACAC ACCAAAATTT CAATATATGT 1320
CAGTATTGAA CAGTTGAGTC TGCATTGGCT GTAATTGTAA ATATTCACTA GATGGCGCAG 1380
CAGCTCAACC TCAACACAGC TCTAACTCCA CAGCAGCTCA GACTCAAACA GCAGTCAATG 1440
AATGATGTGC AGTGAGTCCA TCTAGACTAG AGTCACAAAG CAGTCCAGAC CACACACGCT 1500
ATTTAAAGAG CCCGCTTCAG ACACCACACA CTAATACACA CACACACACA CACACACACA 1560
CACACACACA CACACACACA CACGGAAACC ACACAAACAC ACACCAGCTA TCACAAACAC 1620
TGCATTACCA CCATTCACAG CAGACAGAGA CTTAAAAGAC ATCTGTTTAG CTGAGCGTTT 1680
ACAGTATCTA TTCATGCATC TTTCCTTTTT ATTCCTTTCA TTTTGATCAA TTTTCAATTG 1740
ATGCACTAAA TAGCTAAAAG TGCATTTAAG AAAATAAATC TGAAAATGTC TGTTGTTTAC 1800
AGAACAAAAA AAAATAATAA TAGTTTTACT CAAACACATG ACTATAAATG ATAAATTCAG 1860
AGAAACTGTG AATTTCCATG ACATCTTTTA TTTGTTTTCT CAGCATAAAT GAGTGCACAA 1920
GCTTTTCATC ATGACATTTT TCATCCATTT CTCAGTGAAT ACGAACTATA TTTTTTGTTG 1980
CATTTAAACA AAACAGTTTT ATTAAACAGA TTTATCCAAT AAAGTAAAAG TTTGGGCACC 2040
AAATATATTT AGGAATTGAA AAATATTACA TTTAAATAAA AAAATACATA TATAAAATAC 2100
AAAATTTCAA CAAAATGTAA TATATATATA TATATTTCTC TTTAATTTTC CTGTTTATTT 2160
AAATTTAATT AAAAATTTTC CACAAGATAT TAATGTCATT TACTTATTAA TTTTTCTTTG 2220
GCTTAGTCCA TTTATTCATC TTTATTGGTT AGGTGGCCCG GTGTGCTCTG ATTGGACAGG 2280
AGGCAGCTGT GTGCACTGAT TGGTCAAGTG CCTCACACCG TGCTCTAACA AAACATGCGA 2340
TGCAGCTTAA TCCTGTGTTC TGCCGCGACG TTGCAGAAAT AGAAACGGTG TCAAAAATCG 2400
AAATTTCTCA CATCCCTGTC ACTGATGGTC AGCACAAAAA CTCCTTTTAA CACAGCAGAA 2460
TGAACCACCA ACTACTTTAG CA 2482