EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00036 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:38860349-38863004 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr1:38860967-38860982GGGTGCAAAGGTCAG+6.83
HNF4GMA0484.1chr1:38860966-38860981TGGGTGCAAAGGTCA+6.3
POU6F2MA0793.1chr1:38862198-38862208AGCTCATTAT+6.02
RXRBMA0855.1chr1:38860967-38860981GGGTGCAAAGGTCA+6.02
RxraMA0512.2chr1:38860967-38860981GGGTGCAAAGGTCA+6.11
Enhancer Sequence
AATGCCCTTG GTGTAAAGAG ACGTAATCAG CGTCACTCAC GAGTCTCTCT TAAACTTTAT 60
TTAACGAGTC ATTCATCTTT GTTTTGTCTC CAAAAACAAG CTTGTGAAAG AAGGTGCTGC 120
TTAACAGCAC ATGAAACGGT GCCATAAAAA GGCTGAAAGC AAATGACGAT CAGCCACTTT 180
CTCTTCTTCT CACTCTTTTA CACAGATGTG TCACTTGTAA TGCTTTCTGT CCTTCTCTCA 240
ACTGAGCCTA ATTGTTCTTT CGATAGTTTT GTTCGGTTCA GATTTTTCCT GACCTCTCCG 300
ATCAACCCTT CACCTCTAGA GGTTCAGGTC TTTCACCATG GCTTAACTAC TTGAACCATT 360
TGATCTCCCC ATGCATCTTC TTTCATAGTG TCCATGTCTT AGGAAGCCTT GGGCTGGCTT 420
TGTATTATAC GGTGTGCTTT TGAAATGGGA GTTATTTAAG TCAATTGTTA TGCAAGTCTA 480
TACAACATAA AACAGTTAGA AGAAACTGTT GCTATTGGCA GGTTGAGGTT ATTTTTCTAG 540
TCTGCTGGGG TGTGAGTGGG TCTGAACCCT CCCGAGGAGG CGGTTTGCAT GCTGCACTGG 600
AGAGGAGATT GGATTTGTGG GTGCAAAGGT CAGTGTGTGG GGGTTGTGGC CTGTGGACCA 660
AGCTGACCTC TGAAACTTTC ATCATCCTAC TCATTTCACA TTTCGAACAT CTATCTGTTC 720
TCGTTTTCTA TTTATCTTTC TTTTTTTATC TTAAAGTATC TTTCTTTCTA TCAATCCATC 780
TATCCATCTT TATCTGCCCT TCTATCTATC TTTTTATCTA TCTATGTATC TATCTATGTA 840
TCTATCTATG TATCTATTCA TCCATCGATC CATCCTTCCA TCCACCCATC ATTCATCTAT 900
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 960
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATATATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 1020
CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT CTATCTATCT ATCTATCTAT 1080
CTATCTATCT ATCTATCTAT CATCTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTA 1140
TCTATCTGTC TATCTTTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTG 1200
TCCACCTGTG CATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 1260
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 1320
TCTTTCTGTC TGTCTGTCTG TCCACCTGTG CATCTATCTA TCCATCCATC CATCCATCCA 1380
TCCATCCATC CATCCATCCA TCCATCCATC CATCCATCCA CCCACCAATC TATCTATCTA 1440
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 1500
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 1560
TCTATCTATC TATCTATCTA GTGTTATTCA GCAAACTTGC ACTACCTGCT ATTATAAGCA 1620
TGACATTTCA TAGATTCTAG TGCACATCCC CATCTAACAC GCCTATTCTC CAAATATCTT 1680
CCTCTGGAAA CCAGTTCATC AGGCCAGCTT ATCTCCAGCT GGTGTGGATT GCACCTCTTT 1740
GGTTAACTAC TTGAGCTGAA CCCAGTCACA TATTTTTGCA TTTGTTTAAA TCTCTTACCC 1800
TGGCACGCTG CTGAATCACC CTTACACGAC TCTAAAGACC TCTGTTCCCA GCTCATTATA 1860
TACCGCGATT GAAGGACTCT TCCTACACAC AGCCTCTTAT GCGTGTGTTT ATAATATCTG 1920
CATATCAAAG ATCAACAGCA TTGTCTGTAA CATTCTCAGC CAGAATAATC CGCTGACAAA 1980
GAGCGCTCGG CTAGCCAAAA ATTCTCCCAC TCTTTTCTGC CATTGCGGCA GCTAACCACA 2040
TGTGACCCGT GGAAGGACCC TGCCCGCACC CCTCATTGTA ATTGGCCGTG TGATTATGTG 2100
TGTGTGTGTG CTAACAGGCT CTCCTTCAGC ACCCTGCTGT TCCCATTTGC TGGTTACAGT 2160
CATAAACTGG GCAAGCCCTG GTTGTTTTAA CAGCGCATGT GTTGATGAGC TCTCTTTGGC 2220
GATCTCACAT AAGAAGGACC CAATTAGACT CAAGGCAGAA GACTCTGGAT AAATCTGTGT 2280
GAGTACTGTA AGTGTGTGTA TTTGTATATA TGATTTCTCT CAGTTGTTTA TAAAATGTTG 2340
AAATGACCTT GCTATTTAGA GGTGTTTTGT GCTTGTTTAT GATGGCAGTC GCGAGCCGCA 2400
GCATCATTCG GTGAAATCCA TTCATGCTCA TTCTCCAGCT GACATCTTTT CACCTATTTT 2460
TTCCTGAATA ATCCTGCTGG TCTTTTACTT TTTTTTCTTT CTTTTTTTTC CAAAGGTTTT 2520
CAGTATGGAT GATTGTTGAC CTTCCCTTCC CAAGTTCTGC AAAGACAGTA TTACATTTTA 2580
GACAGCAAGA CTTCTTAAAC CTTCTGCACG TTCGACTTAC GCTGATATTC AATATATTGT 2640
GAAAATGAAC ATGCA 2655