EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00032 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:35337742-35339490 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F7MA0758.1chr1:35339057-35339071TTTTCCCTCCAAAA+6.61
EVX1MA0887.1chr1:35338442-35338452GGTAATTAGC+6.02
EVX2MA0888.1chr1:35338442-35338452GGTAATTAGC+6.02
HNF4A(var.2)MA1494.1chr1:35338699-35338714AGGGCCAAAGGTCAG+6.37
HNF4GMA0484.1chr1:35338698-35338713TAGGGCCAAAGGTCA+6.3
Hmx3MA0898.1chr1:35338674-35338691ATTTTTTAATTGCTACA-6.22
Nr2f6MA0677.1chr1:35338699-35338713AGGGCCAAAGGTCA+6.56
RORA(var.2)MA0072.1chr1:35338541-35338555CTGACCTACTTTAA-6.45
RREB1MA0073.1chr1:35338519-35338539GGGGGGTGGATGGGTGGGGG-7.24
RXRBMA0855.1chr1:35338699-35338713AGGGCCAAAGGTCA+6.21
RxraMA0512.2chr1:35338699-35338713AGGGCCAAAGGTCA+6.18
YY1MA0095.2chr1:35339363-35339375GCAGCCATTTTG-6.52
ZNF384MA1125.1chr1:35339217-35339229AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:35339218-35339230AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr1:35339222-35339234AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:35337981-35337993TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:35337982-35337994TTTTTTTTTTTT-6.22
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ZNF384MA1125.1chr1:35337986-35337998TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:35337987-35337999TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
ATGGTGAATC TAGTTTATCT AGGTTTCATT GATAAAAGTC ACAATAGTAC TACTACTATT 60
ACACTACTAT AATATTACTC ATACAGTGCA GAGTTAAGCA AACACCACAG TTCTTAAAAT 120
CCTTGTTAAC AAATCAGTAA GTTGAAGAAG GTTTGTTTTA TTTCAAATAA AATCCTAGTG 180
AATGATAGTC AATTAGGCTT TTTTACACAT CCATTTTCAA AATACCCATT AGGATGCTGT 240
TTTTTTTTTT TTTTTTACCA CTCAGAAGGT CATCTACTGT CCAAGACATT GTTTAAATCA 300
GTTGTAAATT ACAAACTAAT TCCTGCTCAT TGGAGAATGA TTTTGAGGTG GGATCTGTGA 360
GTTCATAACC ACTCAGCAGT GTACTGCTGT GTCTTTGGCT GGCATGGCTC ATGTTGTCTT 420
ACTGCCGAGA TGATGCCTCT AATTGGCTTT GGGTATAATA ACAAAGGCCA AGATCCTGGC 480
AGAGAAGAGG AAGAGATGAC CAGGTCAAGA AACAATCCCC CAGAGAAAAA GCTGCAATTG 540
GATGTATCCC TATCCGTAGG GACAAACACA GGTTGTGCCG TGGAGAATGA GAGGATGGCA 600
GTCCTCTCTT AGGTTCTGTG TGCCCCCCGG TGCATCGCCG CATCAGGGTC CATCTGTTGA 660
AACCCAGGAA CCATCAGTGC GCAGGGACTA ACACGGCAGT GGTAATTAGC CCCAGGATGC 720
AAACAGCTAC CATCAAACAG ATGTGGGGGA AGTCGACACA TTGTTAACTG GTTTGATGGG 780
GGGTGGATGG GTGGGGGAGC TGACCTACTT TAAATCGTGT GATGCAACAC CTCAATACAA 840
GAAAGCAGCT ATCCACACCA TGAAACCAAG TAAAATTCTT AATGATGCCT CGTCAGTGCT 900
TGCAACCAAA TTGATATGAG CTTTTTTTCT CGATTTTTTA ATTGCTACAA ACAAACTAGG 960
GCCAAAGGTC AGGCTCATTA TATTTTCTGA ACTTTCACAC AATGTTTCCG TGAACTTGTC 1020
ACATGGACAT CGCCCCTGGA GCAATTTGGG CATATGTGCC TTGAACTTGT AGTTCAAGGT 1080
GTTAATAATG GAAGACACCA GCCTCTGCTG CTCTACTATT TGTTAGGGTC ATCTTGAATC 1140
ATGTGTGCCT CTTAACCAAG CACATTAAAG CTTTGCTATC AACAGATATC TGACAGTCAA 1200
GTGTGACAGT CAATCACTGT TTTGTGGATT CTGCATTTAC CATAATCTCA ATGTCAAAAA 1260
TTGTCTGTTT AAGCTGATAA AACATTTGTT CCCTCCAAAA ATCTCCTCAA AAGAATTTTC 1320
CCTCCAAAAA GAATGAATCC AAAATGAAGG TTTAATGGCA GAGATTTTGA CAACTGACCA 1380
ATAGGTTGTT AATTCATAAA ATGATACCTT TTGCCCAAAA AGCAACTGAT TTCGGTGTAA 1440
TTATCCTTGA CATCTATTCA ACGACAACAG CAAGCAAAAA AAAAAAAAAA AACACCGGTT 1500
ACATACCCTG CAGACAACTG CAATACAAAT CTTTTTATTT TTTGCTGACC TTGAAGGCTT 1560
GCCTTAAAGT GCCTTTGATT TGGTCTGCCT GCTGGGTTGA GTATACATAG GATTCCACTG 1620
AGCAGCCATT TTGAATGCTT TAACAAATTT AAATGTATAT GTATAAAAGC ATTTAATTGA 1680
GAATTTAGGT TGGGTATCAA CTAAGCTAAA CTAGGCTAGT CAGCAGGCAT TACGCCCTGA 1740
CAGAATGC 1748