EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00024 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:23372278-23373893 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:23373603-23373614TTAATTAATAT-6.62
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:23372295-23372313GGAAGGAAGAAAGACAGG+6.77
FOXC2MA0846.1chr1:23373469-23373481TAAATAAACAAA+6.18
Foxj3MA0851.1chr1:23373467-23373484AATAAATAAACAAACAA+6.03
Hmx3MA0898.1chr1:23373595-23373612ATCAACAATTAATTAAT+6.19
IRF7MA0772.1chr1:23372691-23372705ACTTTCACTTTAGT-6.26
POU6F1MA0628.1chr1:23373602-23373612ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:23373602-23373612ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr1:23373511-23373522AAAACAAAGAA+6.62
ZNF263MA0528.1chr1:23372800-23372821GGAGAAGGAAGGTGGGGTAGA+6.16
ZNF263MA0528.1chr1:23372803-23372824GAAGGAAGGTGGGGTAGAGGG+6.27
Enhancer Sequence
TGGCTCACCG AGGAGCTGGA AGGAAGAAAG ACAGGATAAA GGTGACATAA GTGAGAAGAA 60
GAGAAGCGTG AAATTTGGAG GACATTTGCT TACTGAATGT TGCCCAAGAC TGAAGCAACA 120
AGTGAAAAAA AAAACTGTTG TGTTGAAGAG ATGTTGATGA TGCACACTGC TTACAAACCC 180
CAATTAGTCA TGTTAGGGAA CATATTTGTG AGAATCCATA TGACTGAAGG GCTACTGCAA 240
AAGATGTGTT TGTGAACAGC AAGTATGAAA ACTAACGTCT CAAAACCCTC GGAGAAGCAT 300
GGAGAAAATC ATGTCGACAG CCTTCCCTGT GGTTCAGTCC TTCTCCAAAG TCCAAAGCAT 360
TCAACGGAGA AGAAACAGCC AGGCCAGGTT TAGATCCCGT CGCATCGTTC AGCACTTTCA 420
CTTTAGTCTG TTGTCACGCT GCTCCTCAAT GTGTCTAAGG CAGGATGGCA GAGAAGTGAA 480
GTCCCCCCTA ATCCTTCTAT TGTCCCAGGC CTAATTGGAT TTGGAGAAGG AAGGTGGGGT 540
AGAGGGTAAA ATATGTGAAC CCCCTTTAAG TTTGCCTAAA GGGGGACTTC AGTTTTTTCA 600
TGGCCTGAAA AGGAGGAATC CTCCAGGGAT TTAAGGGATT GAAAGGTGAC AGAAGCTGGA 660
TTATGTTTTT TTATGACTGT GTCTTTAAGC AGGTAAACAG GGAAGCCCAT TACAGGGGAA 720
AGCGCAGGCA GGGGTTAATG TTGGGATAGC CGATTCCTAA GTATCTGTAA ATAAGTTGCT 780
CATTTCCATG GGAGTGAATT GTTGCTGTAA GACCTTTCCA TTGAAGACTT CAGATACCTC 840
TAAAGAAGCA TTTGCTGAAC TTTTAAGTTT TAAACATGGA CGCTAGACAT CAGCAACACG 900
GATTTGTTGC TGGTTCCATG GGTCACTGGC AAAAGTTGAG CTGTTCTGCA CAGTTTAAAT 960
CCTGTTCAGC TACTGTGGTT TAACACCATA TCACGTAAAG TTATTATATG TTGAGAGGTG 1020
GTGGTCTTAA GTACCTCTGG GAAGTGGTCG ACAACAGACA TTCTCAAATG TTTTATCCAC 1080
CATTACTACC CAAATTAAGC GTTGTACGCT AGTGACTGGA CTGGCAAAAA TATATCTTAA 1140
TACTAGGTTC AAACAGGGCC TAAGACACAA AACAACTTGC AAATAAATAA ATAAATAAAC 1200
AAACAAATCT GACAAAAAAT AAATAAATCT GCTAAAACAA AGAAATCAGG AAAGTAATGG 1260
GATACCAACA TTATGGCTTG CTGAAATTGC ACAAAATCAT GTTTCGTATC ATTCGACATC 1320
AACAATTAAT TAATATCTTT AACAATACAT TTAGGAATAT TACATTTTTT TTAACCACTT 1380
TATTTTAATG TACCAACATT AATTATTTCG GATGGGAAGA TAGTGGCTGG GATGCACAAA 1440
AAAAGAAACC AAAAAGCCAC TTTGGCGTCA TCCTTGCATT CTTTTTTTAT TTACAATCTC 1500
CTCACCGCTG CAAGCCACCA TACTCGCTGA CCTGAAGTGA CGTATGCATG TATTCCTTGA 1560
CCATTTACAA TGGACTTGGC GTTCGCTCTC GTGCTCCCAT GGCTTTCATA AAGCG 1615