EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00014 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:13243683-13245807 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:13245750-13245760TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr1:13245750-13245760TCTAATTAAA+6.02
POU4F1MA0790.1chr1:13244687-13244701ATGTATAATTAATG+6.06
YY1MA0095.2chr1:13245630-13245642CAAAATGGCGGA+6.11
ZNF384MA1125.1chr1:13245305-13245317TCAAAAAAAAAA+6.11
Enhancer Sequence
GATATGGACA AGTGTTTACT CGTTGTTTTT TGGAACTAAG GTGTGCAGTA TGAAATTTAA 60
TTTTATTAGT GTTTTTATAT GTATATGTAA CTTATTTATC TATTTTTACT ATGGAGAGCT 120
CTGCTGTGAC ATGTGAAATT CCCTTTGGGG AAGTCAAACT TAACCTAACC TAATATAGTA 180
TTATATATAT ATATAATGTA ATTGTGTATT TGCTGCTGTC ATGTGTCTGA TTTACAATTA 240
AAATACATTG AAAAGGTTTT TAAGTAAATT AAAATGTTTC CCATAGCTGT TCATAACCTA 300
ACATTAAAAT CTAGAAATCA TCATTTCTGG TGTTTATTTT GTGTCTATGA TAACGTTAAT 360
AATATGTTTT ATGATAATAA TCCAAAAAAA ATGAAGATTT AAAATGCAGA AGCGCCCCTT 420
GCGGTTGCGA ATCAAGTGTG TTTGTACATG CAACACCGAC TCAGCCCAGG AGATGGTGGT 480
CTAACTCCGC TAATCAGCAA CCCCCAGTCC AGTGACCTTG CTTTGGTTTA TACAGCTGTT 540
TTTGTGGCTC GTTTTTAGCT AGAGGAGGTC ACTTATGTTT CCAAACGGAG GCAGATCGCA 600
TCGACACAGG CAATAACCAG CGCACGAGAG GAATATTCAG TATTTGAAGC CAATCTGGTG 660
AGTGACGACA TCGGCTACAC ATAGCAATGC TTACCTTTAT TGTATACGCT CTGTCGTCCT 720
TTATGTTTTC TCTGCATTTG TGTTTCATCG GTCCGCAGTG AAGCGCATAG CTCATTCAGA 780
CTCTCCTCCA AACTACAGAC ATGAAATGAA TCAAAAAGTG TATAAGTTAT AAGCCAAAGT 840
CATGTTTAAG TGCTGCGTGT GCTCCACTAG CTCGCGTGAT CGTCACTGTT TAAAAAGGAT 900
ACTCAGTCCA CTTGTTGATA AACATTATTT ACAATGACAT TTAAGAAACA TTGCTTTGAA 960
TTAAAGTTTT TACATTTAAT TATGCAGAAC GACGTATTAT CAAAATGTAT AATTAATGTT 1020
CCAGTGTACG AAAATTACAT CACAATAACT CTCGACAGCT TGTTCGAAAA AGTCAGCATG 1080
AATGTGATTA TTCGGTGAGA GGCTGAGGGC AATCATCACT GGAATAATTA TATTGACTTT 1140
ATGAAACGAT TCGATGAGGC TAACATTGAT TAACTTACAT TTTTGACACA CTACTGCCGG 1200
TTCAAAACAA AGTAAAACAG CAATGTTAAG ACCTTCGAGC AATGAACGTG ACATTTTGTT 1260
ACCCAATTTA ACGAGTCATC GTTCACGAGT TATCCATAAA TCCAATTTCG CCACCTACTG 1320
GTGTCAAGAC GTAACCGTGC AAAATATCGA CATCATTAAA AGGGTAGTTC ACACTGAAAA 1380
TTTAAATTTG CTATTTAATT GCTCAGATGA TGAATGTAGC TTCGGCCTTC GGTAGTTCTA 1440
ACATTAAAGT GAATTTTTAG ATGAAACCAT GGTAACTTAA TCGTTACATG GCTAACTTGC 1500
TCTGGAGAAG GTTTTATTCG TCGTTCAACC ACGTTGTAGA CAAAAAAATG AAAAGTTTAT 1560
CTTTTTTATA AAAAATTACA TTTACACAAG TTTTTCAAAA CAATCCACTT TTACTGAAAT 1620
CCTCAAAAAA AAAATTTTTA TCACATATGA CATAGGCTAA TATTTGACAC TGTCGCCTTT 1680
ACTGTTAGTA AACAGTATCT TCAGGGAAGT ATGTCAAAGT TACAGTGTAT AGCCTATATA 1740
TGTATCTGTG TTCCAAATCG CATACTTTCA TACCATATAG TACGCTAAAA ACAGTATGTG 1800
AGCCAAGAAG TATTTCCGAA TTCGAAAAAC ATTATGTGAG AAGTACCCGG ATAACGGCGA 1860
GATTCTGAAG AGCGCATTGG ATGGACACTA TTCCATGATG CCATCCGAGA GAATTCAACG 1920
AACAACGAAA CTGGCACGTG ATGATGACAA AATGGCGGAT GTAGTACGTC CAAGTTCCAT 1980
TTATAACACA GACATTGATA CTGTATAGAA CACAGGTGTC GAATCCAGTG CCTGTAGGGG 2040
CGCAGCTTTG CACAGTTTAG CTTTAACTCT AATTAAACAC ACCTGATCAA ACTAATTAAG 2100
TCCTTCAGGC TTGTTTGAAA CCTG 2124