EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00013 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:12608315-12610140 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:12608456-12608468GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:12608460-12608472GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:12608464-12608476GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:12608468-12608480GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr1:12608472-12608484GTTTGTTTGTTT+6.32
NEUROD2MA0668.1chr1:12609761-12609771GCCATATGGT+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr1:12608491-12608504TTTAAGTGGATTT-6.39
ZNF24MA1124.1chr1:12609156-12609169AGATGAATGAATG-6.25
ZNF24MA1124.1chr1:12609051-12609064GAATGAATAAATG-6.48
ZNF24MA1124.1chr1:12609043-12609056AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr1:12609047-12609060GAATGAATGAATA-7.52
ZNF384MA1125.1chr1:12609319-12609331TGTAAAAAAAAA+6.07
Enhancer Sequence
TCTTGCTTTT TTATGTTTGA TGTTTGACAG TGAGCAGATA TTTCTTTGCT TATTTCCATA 60
TGCTGTAAAA AATGCTGTGT TTCACACAAT CAATGTATGT TGGGACAACA TGAAGGAATC 120
AAGTTAACTT ATTTGTTTTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGTT TGTTTGTTTT TACAAATTTA 180
AGTGGATTTT ACTTAAAACA TAAAGTTGTC ACCCCCCCCC CCTAAAAAAC AAGATTTAAA 240
TAAACTTTAA ATAAGTAGTT TGAACAAATA ACATACATTA TTTATTTATT TATTTATTTA 300
TTTATTTATT TATTTATTTA TTTATTTATT TATTTATTTA TTTATTTATT TATTTATTTA 360
TTTAAGTGAG ACATATTGCC ATTAGGGCGA GGCAGTGGCG CAGTAGGTAG TGCTTTCAAC 420
TCACAGCAAG AAGGTCGCTG GGTTGCTGGT TCGAACCTCG GCTCAGTTGG CATTTCTGTG 480
TGGAGTTTGC ATGTTCTCTC TGCCTTCATG TGGGTTTCCT CCGGGTGCTT TGATTTCCCC 540
CACAGTCCAA AGACATGTGG TACAGGTGAA TTGGGTAGGC TAAATTGTCC ATAATGTATG 600
TGTGGATGTT TCCCAGAGAT GGGTTGCAGC TGGAAGGGCA TCCGCTGCGT AAAAACTTGC 660
TGGATAAGTT GGCGGTTCAT TCCGCTGTGG CTATTATAAT AATTAATAAA GGGACTAAGC 720
CGACAAAAAA ATGAATGAAT GAATAAATGA TATTGCCATT AGTGAGCAGT GCAATTTTCA 780
AACATTGTAA TGCTCATAGT AAATCTGATC TGATGCAGAA GATTTAGGCA AACAAAGTCA 840
TAGATGAATG AATGTTTCAG GAGAATTGAA TGACATGAGG GTGAGTAATT GATAGCAGAA 900
TTTTCATTTT TGATTGAACT AACCCTTTAA TCAATCTAAT TCAAACCTCT AAATTTAACT 960
TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGACTGACT CATCAAAAAT AACTTGTAAA AAAAAATTCA 1020
GTTGTTCATT AATCAGACGT CATAGTGTTC AGTGTTATAT ATGCAGAACT AAACATTCTA 1080
TACAAGAGCA TTTAATGAAT TCAGTTTTAT GTCTAGATTT TACCAACATT TTTTTTCTGA 1140
TTTCTATTTT GTGATCATTG CACTTACATT ATACTTTTTA AATGAACAGC CAAAATGCAA 1200
GCATCACTTT GGGGAGTATG ATCAGTGCAT GCAACGATGA ATCTGAAACT TCAGTTCCCC 1260
CTTGCTTTGC ATTTTTCCCT CAGCCTGCCT CTCGTTCAAG CCCCACTCCT TCTTTCTCCC 1320
ATTCTGTGAG TTGTAAGAGC CCAAAATAAA ATCAATTTCA TGTGCTGCTG AAGCTTTAGA 1380
TCTTTTTTCA TTACTCTCAA TTCTTCTCTC CGTCTTCCTC ACTCTTAGTG GGGGTCTTTC 1440
GGTGGAGCCA TATGGTGAGT GCGAGCGTAT CAGGGTTGTT GATGGGTATT TCACCCCAAC 1500
ACAAAAGCCG GGGGCCAGCT GAATGATGCC CATGAATGCA TGAGGACAAG CGGGGTGAAA 1560
AGGAACCTGT GGCCATGTCA TAGAGGATCG CCGGGGAGGG GCTGCATATG ACATCACAAA 1620
AAGGGGACAA AAGACTTTAG CAGGTCTTTC TCCTCGGTGT TCTCCACCCC CTGCCAGAAA 1680
AGCACCAGCT AATTATCCAG CGGCTGACAG GAGGGCTGTG CATGCATGCA TTTGGCTGAG 1740
ACTGAGCAGC CGGGTTCACA TACTTTTGGC TCCAAGTGAG AAATGAAACA TCTCCAGTGC 1800
TCTGATGAAT GAGGTTCTTC ATGCA 1825