EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00012 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:12603828-12605286 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
SIX1MA1118.1chr1:12605173-12605184GTAACCTGAGA+6.02
SIX2MA1119.1chr1:12605169-12605185AGTTGTAACCTGAGAC+6.06
SPICMA0687.1chr1:12604558-12604572TACTTCCTCTTGCT-6.1
Enhancer Sequence
ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CCATCCATCC ATCCATCCAT CAATCCACTG 60
ATATAGAGAT AGATGTCACA ATATACTGAA CAGAATAATA TCTATACCTA TATATCAGTA 120
TTGATCTACC AGTCCATCCA TCCATCCATC CATCCCTCCA TCTACCCACC CATCCATCCA 180
GAGATAGATA TCTCAAAGTT CTGAATAATT TTACTGAATA GAACGAATTC AATCTGTACA 240
GAATATAATA CAGATAGATA TCTATATATC TATCAGTGTT GATCCATCTA TCCATCAGTC 300
CATTTATCCA TCCATCTATC CATCTAGAGA TAGATATCTC CATATACTGA ATTTATTGAA 360
TTCTATACTG AATAGAATAC CATCTATATC TTTATGTATT TTGGTTTTGA TCCATCCATC 420
ATTTTACTAT ATGTACAGTA CTAGTCTTTC CATTCCATCA CTGATTCAGA TGCGTTTGAT 480
TCAGGTTTGA CCTAAGTTCT GCTGAATAGT GAGTCTCCAG GAGCAAAGAA ACTAATAGTC 540
GACCATGTAA TGTGATCCCA TTGCTCAAGT GAGTTAATCG GAAACATTGC TCTACCTAAA 600
CGTGTTGTTA TACATTAATG TATTGCATTG TGTGTATTTT TTTCTACTGA ACATCACGCT 660
GATCTCATAA GCAGGGTTTG ATCTCATTGT AACAATGTTT TCCATCTCTT TCTCCGCGCT 720
GTCTCTCAGC TACTTCCTCT TGCTTTCATC TGTGGCGCTG TCAGGAGACT GCTGCAATAG 780
CTACGTGCGT GTTGCGTTTA GCACCCTCAT TAACCACGCT TTTGTTTTGC CGCACCATGT 840
TCAGACTTTA CGCTTTGGAG AGAAACACAA AATAACAAGC GAAAGAAGGG AGGGTGAAAA 900
AAGCACAACA CTCTTTGAGC GATTAAATCT TTTCTCACCT CTCAATTCAC CGCCGACGGC 960
TGAGCCAGAA ATAAGGGACC GTACAGACAT GGAGAGAGGA AAGGAATGAC TACATGGAGA 1020
GTTGTAGTTT GGTGCTGTTT GATCTGATGA GAGCTGATGG AAATGGGTCA GGATGGGTAG 1080
TCATGTAGGG CTGTGTGTCT TTTTGCCCTC TGGGGTGTGA ATGACCTGTT GGGGCTCAAT 1140
GCACAGGTTT CACACCCTTA GGGTTAGCGC ACACTCTGAC TATCTGTCAA ATGCAGTCAG 1200
ATGCCCAGCC ATGTGAGAAG CACACATGTG TTTGTGTGAA GGAGCAACAT GGCTATCATA 1260
TCACCTTGAG AAAGCAACAC AGTGTTAGTA GGGCTTGTGG GTTTCTAAAT AATTAGCCAT 1320
ACAGCATACT TGTAAATAAT GAGTTGTAAC CTGAGACATG ACAATTTTAC AAGATTATTA 1380
CATAAACACC AATGGCACGG TGTTTGTGTA TAAATGAAAA TGAATCCAAT AAATTTTACA 1440
AGATTGAATA TATATATA 1458