EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00011 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:12586813-12589791 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr1:12588839-12588851AAACATATGCTG+6.04
CDX2MA0465.1chr1:12587333-12587344GAGCCATAAAA+6.14
Lhx3MA0135.1chr1:12588262-12588275AAATTAATTATAC+6.19
POU1F1MA0784.1chr1:12588032-12588046TAAATTTGCATATT-6.14
POU2F1MA0785.1chr1:12588034-12588046AATTTGCATATT-7.22
POU2F2MA0507.1chr1:12588032-12588045TAAATTTGCATAT+6.62
POU3F1MA0786.1chr1:12588033-12588045AAATTTGCATAT-6.32
POU3F2MA0787.1chr1:12588033-12588045AAATTTGCATAT-6.18
POU3F3MA0788.1chr1:12588033-12588046AAATTTGCATATT-6.98
POU5F1MA1115.1chr1:12588034-12588045AATTTGCATAT-6.62
ZNF24MA1124.1chr1:12588918-12588931GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr1:12588914-12588927AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
GGTTTGATAC GGCCGAGCGC TCTCTTTGGC TCCGAAGCCT TAATGCAATT ACCTCTGCTC 60
TAATCACATT GCCTGAACAA AGACGTCAAA GACTTTGGTG AATTTCAGGG GTTCTGGAAT 120
GCCCGCAGTG TTGCATGAAA AATCACAGTC TAAAAGAAGT GCGATAAGTA AAAACAGATG 180
CACAGGCTAA TGCACTTAGA CACGGTCTGG CTTTAAAGAG TGAAAAAAGA AATCCCTCAT 240
CTGACATAAC CTATTTAAAA ACTCGCGAAC AATATGGTAA TGAAACAAAT ACATTTAAGT 300
TGAAAGCCAA CTCAAGAGAC AGGTGTAACT TTGACGCATA CGGCCTCAAA TTTTTTTAGC 360
ACAAGCTCAA AAAGAAAGTA TGTGACTGAT TGAATTCAAA TGGCATAATG AATAAGTCAC 420
TGAGCAAGGA ACATCTGCAT TTTTGGTGTC AGTACAACTT TATGACACCA TACGGGAGCG 480
CTACGTCTCA ATCTCCCTGA CAGAAGCGCA TCCCTCGCAG GAGCCATAAA ACCACGCCAC 540
GGATTCAACT TTTGTCATTG ATATTATGTC CTTCCCCAAA CAAACAATGA CCACAGCAGG 600
TGGAGCGCGG GCCAAATGAG GTTGGCTTGC AAACTCGCGC GGCCGAACTC TGCTTTCACT 660
GTCGCTGGAA TGCACGTGAA CGCGCGCGCG TCGCGTTGTA AAGGCACGCG AGCATCTGTC 720
GCCTCGTCTG TCTCATTATC CCTCATTCGA TTAGCGCTTT CTCTTTCAGT GCGGGCTGGG 780
TTTCGCCTTC TCAATAGACC CACAGTCACA AAGGTCTGAC AATGCGCATT GTTATTCATA 840
CTGGGTCACA GAGCAAACTT AGCCCTCTTC CCCCTCAGTT GGGACGGGCC TTTACTGCTT 900
TATGAGTCGT TGAGCGGGAT AACAAGACTC CGGAGCCCGT TTGCTCGCGT GATGCATGTA 960
GTGCGTGGTC TTAAAAGCAC CATATTGAGC TTTGTGTCGC GGCAAGGGCG ACAAATTTAT 1020
TACAGTAGCC CACTATGGTA ATCCAGCCCC GCTATAAACC ACAAGTTAGT GTATGTACAG 1080
GCTAATTTGT GGAAATGATA TGACAGCTGC ACTCGAGGGC CACCCTCGGC TATACACTGT 1140
GTTGCTAATG CTGCCAGTGA GAGTTTATGC TTACAGTGCA AAGCTTAATA GTACTGTCCA 1200
TTAATATTTG ACTGAAATCT AAATTTGCAT ATTGTATGAA TGAAAAGCCC TGGGTATGTA 1260
TTTGAATTAG TTTCTAACTA AAAAGTCCTG TAGGATTCCG GTTAAAATTG TATCACAATT 1320
TGGAATCAAA TTCAATGCAT CCTAATGTGA TCCAGTAAGA TCCTTCTGTA AAAAAAACTC 1380
TCAAGGATTT TTCCCTCATA TTGGATGCTG CATATCTTTA ATAGAACCCA ATGTATCACT 1440
GATTCAGTTA AATTAATTAT ACCAGTAGAT AAATGAATCA TTTTAATAAT GTTCTACTTT 1500
ATTAAATAGG GAATGTCCTA TGTATATATG TGCTTTACTA TATAAAATGA TAAATGGACA 1560
TTTAATTCTA TTGGCAACCA TTATATTCCT ACTGGGAACT ATGCTCTACA TTTTTTATTC 1620
ATCTTGTTTA ATACTGCACT GTCAGAAAAA AAAAAATTAC ACTTTGCCAC TGGGATAGAT 1680
TTCTTAAAAG TCCACCCACA GGGTCTAATA TGTACCCTTG AGGTATATAA AGGCTATATC 1740
CTTTTGAAAT AGATACAGCA CGAGACAATT GTGTATCATT TGAGAGTACT GCCACTATGA 1800
CAAGTGAATA CAGATTATAA CAAAGATTCC AAAATAATGG CTGCACGGTG GCGCAGTGGG 1860
TAGCTTGTTC GCATCACAGC AGGAAGGTGG CTTGTTCGAG CCTCGGCTGA GTCAGTTGGT 1920
GTTTCTGTGT GGAGTTTGCA TGTTTTCCCT ATGTTGGCAT GGGTTTCCTC TGGGTGCAGC 1980
CACACATGCG TGGATGGGTT GCAGCTGGAA GGGCATGTGC TGCGTAAAAC ATATGCTGAA 2040
TAAGTTGGTG GTTCATTCCG CTGTGAAGAC CCCTGATTAA TAAAGGGACT AAGCCGAAAA 2100
AAAATGAATG AATGAATTCC AAAATGATCA ATTAAATACT TCTCGTCTTT TTTTAAGAAA 2160
AAGATTTTTT TATCTAAGAG TCAATGTCAT GTCACACACA CACACACACA CACACACACA 2220
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACAAACA 2280
CACACACACA CACACACACA CACACTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCGCTCT CTCACACACA 2340
CACACACACA CACACACACA CTGGCAGTGA GTAATACCAA CCTCTCAGCC CCAGTTCAAG 2400
CACCGTCACC CAGGACAAAT CACTCTGACA CTGATGTCTG CTGAGGTGGC TCTTTCTGAC 2460
GACTGAGAGA ATGAAAAGGA GAGAAGGAAA GTGGAATTAA AGACGGACAT AAAGAATGAG 2520
ATAAAGTGTT GCTGGCTAGA CAACAAGGAA TAGTTCCCTC ATAAAAGCAA ATTTACTCAC 2580
TCTTCTATAT TGACACTTTT ACTGGTCACA CTTTATTTTG ATGATTTGTT AGTTGAATTT 2640
AAGTTACATT GTAAGTAATT CTCATTAGAT TATAGGTATA CTATTAGGTT CGGGTTAGTG 2700
TAAGTTGAAA TGTACTTGCT ACATTACTTA TAGTCAGTTA AATGTTTGTT GAAGGAGAAA 2760
TATCAACAGA TATTAAGCAG ACAGTCTACT AATGCCCAAA TGGACCATCA AAATAAAGTT 2820
TTACCCTTTT ACTTAATGCT AAATTGTGCA CACAAAAGTG CACACAATAC AGTTATTATA 2880
AATATTCAGA TAAGCCATTA TGTTGTTCCT CTGTGTGCTG AGAAACACAA AACCCTTGAA 2940
GGTTACTGTA TCTGTGGCAT ATGCTATCAA GACCTTAG 2978