EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00005 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:5337653-5340613 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC+6.32
RFX1MA0509.2chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC-6.3
RFX2MA0600.2chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC-6.23
RFX2MA0600.2chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC+6.27
RFX3MA0798.1chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC-6.35
RFX3MA0798.1chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC+6.3
RFX4MA0799.1chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC+6.04
RFX5MA0510.2chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC-6.61
RFX5MA0510.2chr1:5338298-5338314TGTTGCCATGCCAACC+6.72
ZNF384MA1125.1chr1:5339873-5339885AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:5339874-5339886AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:5339875-5339887AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:5339876-5339888AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:5339872-5339884TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
TAATTTTTAT TCAGGATTTG TTAAATTTTA GTTGTTGTTT CTGTTTAGTA TTTGTTTAAT 60
ATTTGTTTTT GTTTAGGGTT TGTTGTTGTT TTTTTAGTAT TTATTTAATA TTTATTTTTG 120
CTTAGTTTAG GTTTTGTCTA GATTTTGATT AGGTTTTTGT TTAGTTTTTG TTTAGTTTTT 180
ATTTAATTTT TGTTTTGGTT GTGTTGTTTT TGTTTAGTAT TTTTTAATGT ACGTTTTTGT 240
TAAGTTTAGG TTTTGTTTTG TTTCATTTTT GTTGTTTTTG TTTGGTATTT TTTTGTTCAG 300
GTTTTGTTTT GTTGTTGTTT TTTATTAATT TATTTTTTGG GACATACATA AAATCATGTG 360
CTTTTTTGCA TAAAATATTA AGAAAGAAAT ACAAACTAAC AAGCCACCCA GAAAAGAAGA 420
AGCATCATCT ACCAAACTAA TATTAAAACC TCTCAACTAG CAGCAACTTT CTTCTAAGTG 480
TTGAATTGAT TTGCATTCAA ATGTTAGCAG ACATCTGGCC CTCATTTCTC TCAGCTGAAA 540
CAGATACTGG CCTGAGGAAA CACGATGTCA AACAATGCTG ACTAATGTCA CTTTCTCTTG 600
TAATCCATTA CCTCCTCTAC CTGCATGCTA ATGACAGATA GAGCCTGTTG CCATGCCAAC 660
CCTGCCTGCC AATCAACACC AGGTCATGAC AGGATTTCGC CACGGCTAGT GAATGAGCCA 720
TTCGTCTGTC AAAGTGATGC TGATTTGGAG TGTTACAGTG GAGGACAGGA TTATCTATAA 780
AAAGCTGATG CAAGAAATCT TAGGGGGGAA AAAAAACGCA GCCAGGTCAC TAGCTTTTGG 840
AAGAGAGCTT GGAGTTCAAC ATCATTTCAA ACATATCTTC CAGAAATGTC TGATCAATAT 900
TAGAGAACTG TGAAATTGGT TTATTTAATC CCCAAATTTG GGAACACTAT TTATGTCATG 960
ATCACCAGCG ATCCACTCCT GGCAAATCAC TGATGAACTA CACATTTCAC ACAAACAAAC 1020
TAGAATTCCC GTCATGCCGT TTCACACACA CACCGGTTGC CGTTCACCAC TGATGACTCG 1080
CACACAGCTG AATCCCCCCG TCATCACTGA TCATCTGGAC TACATATACA GCACACATAC 1140
TGTACACCAG TTGAGGACCG AGTCTTTGTT TGTTGTCATT ATGCATTATT TTTGTTTTGC 1200
TTTTTGTTTT CCTGCCTTAT TTCTGATCTT AGCCCCGCAC TGCCCCGTTT TGACCCCATG 1260
CCTGTTTTTC GACTACGTCT TGGATTTGAA ATGTATTTAT TTAACAGGGA CATTGCTCAA 1320
TAATGAACAG TTTAAGACAT CACACTTAGC TGATGATTGA TTATAAAGCT TGTTTGGCAT 1380
GCTGTCCTGG GAGAGAGTTT GAGTCCCGCT AGTTCAGAAG CCAAAATGTC TGTCCTATGT 1440
GCAAGTTGTA AATCCAACCT TTAGTTTGGC AGGTTGTACT GAAAAAGTTG TGTGAAGTGA 1500
CTCAGTTTCT TTGTTTGCGC CACTTAGTCG TTCAGACGTC ATATTTCAAT AGCAGTCCTT 1560
TTGTTTTTTT ATTATTCAAG ACAACGCAAT GTGATTTAAT GTAAAGGCCT ACTTTTGAAT 1620
TCTCCATGTT AAACAGTAAA CTCTATTTTT ATGACTGGAA TCCATCATAG ACATCATACC 1680
ATTCCTTGTG CTCTCTTTCC ACATGTCTTT CCCTCATCTA ATTCTCCCCA CTTTTTCACT 1740
CTAGATGACA AATAAACCTG ACAAAAGGTC TCTGTAAATC TCCCAGTGTG ATCGCCCACA 1800
GAGGGGCATC GACATCAATC ACACCGGCAT GACCCGCGCT GAGGCCTGCG CAAGCACACA 1860
GTCGGCACAC AAACACAGGT AAAATCCTCC CGATGTGATT CTGGGTGATG CTGTGCAAAC 1920
AAAGCTGGGA TTACAGGGAT TAAGAAGGAG ACCGGACTAA TCTGAGATGG ACTGCTGTGT 1980
GTGTGTGTGT GTGTGTGCTG GTCATTGGCT CCAGATGTGT GAGATTACCT ACTAAAAGAC 2040
AAACCTGGGT TGTGGATTCA CCCCCAGAGG GTAGTTGTGG AAACAAACCC ACACGTTTGG 2100
GGGAAAAAAA CACTGCAACT GCAATATTTG ATATAAGTAT TGAACATGTC ATGTATTTTT 2160
TTCTCAAACG TGCCATATTT CTAAAGAAGC TGTTGACATG GAATCAAACC AGATTTTGGT 2220
AAAAAAAAAA AAAAACAATA CAAACATAAA AATAAAACAG AACAAAAAAA TCTGAAAAAT 2280
TAGTTATGTG TAATGACAAT GAAATGAAAG AAGGAGAAAG TGCTTTAATA CTTTATATAA 2340
AAGGTTTCAT TGGTGATGGC AGCTTAAAGT TGCCTCTTAT ATGGAGAATG AAGTCACTTG 2400
CATTGCTCAG GTGTGAGTTT TTGAGGTATG GGTTGGTTGG GTAGGTTGGG AAATCGGTCG 2460
GTCGGTCAGT CAGTCAGTCG ACAGTGGCCT CTGGTGGATT TGTGCGAGAA AAGCAAGCGT 2520
GAATGGCACT CACAAGAATA ATTTGAGAAG GTGATATACA ATTTGAATTT ACTGAAATAG 2580
AAAAACTGCT TTTTCTTCAT GTACGCTTAA ACAAGATCTC TGAATTATAT GCATTGCTGT 2640
CTAATACTGG CCCTTCAACC TTTGATTCTT CAAGGGCAAT ATGGGAAAAG GATCTGAGGT 2700
GATGAGGAGT GGCTATCTGC CTGCTCAAAT ATCTATCCCA AAAGTACTTC AATTTCGGTT 2760
CATGAGCAAA ATTATAAATG TATTAACAGG ATTGATCAAA CCCCAGTTCG CCTCCATAGA 2820
ATATTTCCCA ATCATTCCCT GCTGTGTTTC AAATTTAAGT TAGACATTGG CACAGTGATG 2880
TATGTATTTT TTGATAAATG TACTGAAAAG AGATTCACAA AATGATTATA TATATAGTTG 2940
GGAAGACTTT TGCTTTGTCC 2960