EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00003 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:4580237-4581409 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr1:4581123-4581138GGTAAATCATTAACC-6.44
HNF1AMA0046.2chr1:4581123-4581138GGTAAATCATTAACC+6.7
HNF1BMA0153.2chr1:4581124-4581137GTAAATCATTAAC-6.46
HNF1BMA0153.2chr1:4581124-4581137GTAAATCATTAAC+6.82
POU4F1MA0790.1chr1:4581327-4581341TATTAAATATGCAT-6.17
POU4F2MA0683.1chr1:4581325-4581341CATATTAAATATGCAT-6.31
POU4F3MA0791.1chr1:4581325-4581341CATATTAAATATGCAT-6.09
Enhancer Sequence
TTTATCACAA GGTATTTGTA GCATATATAT AGCAATATAT CACTTTAATC TATTAAATCT 60
GTTAATAAAA GTAGCTTTAT ATAATTTTTC AAGGTTAAAA GTCATTGGAA GACAGATCAT 120
AATGCAATTC AAGAGCATAA ATAAATAGGG GGGGAAAAAT ATTAAAATTA TGAATCACAA 180
AATACGGAAA CCTGCTAATT TATGGATATT TTTAGTGTAC TAATAAGTAC TAATAATTAC 240
AGTGTACTAA TAATAGTTGT AATAATAATA GTAGTAGTAG TAATAATAAT AATAACACTA 300
TATATATATA TATATATATA TATATATATA TATATGGATT TAAATAAAAT ATATTCAAGG 360
CAATGATTTC AGAAAAAATT GAATCTAACA CAAAAAAAGT GTATTGAAGA AATGTCTTAC 420
TAAACATCGC ACACACACAT CACAAATTCA TTTTCTGAAC TCTGTGACTG TTGCATTTTT 480
TTCCTGTCAT CCAACATCCA AAAATGTTGA AATCACGACC ACAGGAAATA AAAATCACAA 540
ATGAATCCCA ATAGTTTTTC GTTAGCCAGT AATGAGACTC AGAAGACGTT GGGACTTTTT 600
GGATTCTGAG ATGTTTCCCA GAATAACATG TCCTGCTGTA CTCCTATGAG CGATTGAGTT 660
TTCAGTTTTT AGGAGCGGGA TCCTTTATTT TTCACATGAA ATGTGAATAG ATTGCAGAAT 720
CTCACAAGCC CCGGTCTGAC ATGTCGTATA ATTAACGACC AACTGTAAAT AACCCATTCA 780
TCCGCTCCCA ACAACCAGCC AGCGGCACAC AATGGCGTCC ACAAGAGCAG GACTAACAAC 840
AGCATTTAAC ATAAACCCTT GAGGAGGAAC AGAGCGCTTC AGCTTGGGTA AATCATTAAC 900
CAGCCTATGC TCTGGGACTG GATGTGCTCC GCGGCTTTAT GTCTCTCCGT TTGTTCTAAA 960
GGAAGTAACA ATGAGCATGT TTGCATGCTC ACCATACACT GATAACTCAG CTTACTGAAA 1020
TAGCTTGTTG TCTCGGTTTA CATGCAAGGC AGTAACCGGG AATGCAAGTA TTATATCAGT 1080
ATTAGAAGCA TATTAAATAT GCATTTATTA AATCAGTATA CCAGTATACA TAATATAAAT 1140
ATTTTTGAAT ATATATATAT ATATATATAT AT 1172