EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR006-00002 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4hpf 
Coordinate
chr1:4451306-4453574 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:4452276-4452293CGCACTAATTAGCTCAC+6.36
Alx4MA0853.1chr1:4452276-4452293CGCACTAATTAGCTCAC+6.28
BHLHE23MA0817.1chr1:4451511-4451523AAACATATGCTG+6.04
CTCFMA0139.1chr1:4452771-4452790CAGTGCCATCTAGTGGAGG-6.75
GBX1MA0889.1chr1:4452279-4452289ACTAATTAGC+6.02
HOXB3MA0903.1chr1:4452279-4452289ACTAATTAGC+6.02
LHX6MA0658.1chr1:4452279-4452289ACTAATTAGC+6.02
MNX1MA0707.1chr1:4452823-4452833GGTAATTAAA+6.02
NRF1MA0506.1chr1:4452065-4452076TGCGCATGCGC-6.32
PHOX2AMA0713.1chr1:4452825-4452836TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr1:4452825-4452836TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr1:4452825-4452836TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr1:4452825-4452836TAATTAAATTA-6.62
ZNF24MA1124.1chr1:4451587-4451600AAATGAATGAATA-6.42
ZNF24MA1124.1chr1:4451744-4451757AAATGAATGAATG-7.34
ZNF263MA0528.1chr1:4452730-4452751AGAGGAGGAGGGAGAAATGAG+6.18
ZNF263MA0528.1chr1:4452724-4452745AAAGGAAGAGGAGGAGGGAGA+7.45
Enhancer Sequence
AGGTCAGTTG CCATTTCTGT GTGGAGTTTG CATGTTCTCC CCGTGTTTGC GCAGGGTTTC 60
CTCCAAGTGC TCCGATTTCC CCTACAAGTC CAAAGACATG TGGTATAGGT GAATTGGGTG 120
TGCTAAAATT GACATTAGTG TATGATTGTG TGTGTATAGA TTTCCCCAAC GATGGGTTGT 180
GGCTGGAAGG GCATACGCTT GGTAAAAACA TATGCTGGAT GAGTTGGCAG TTCATTCCAC 240
TGTGGCGACC CCAGATTAAT AAAGAGACTA AGCCAAAAAG AAAATGAATG AATAAATAAC 300
TTTAATATAC TGTGAATCAT TTCCCAGAGA TGGGTTGCGG CTGGAAGGGC ATCCGCTGCG 360
TAAAAAAATG TGCTGGATAA GTTGGCGGTT CATTCCGCTG TGGCGACCCC GGATTAATAA 420
AGGAACTAAG CTGAAAGAAA ATGAATGAAT GGATTCTTCT AACACTTTAT TGGGTAGCTA 480
TGCTGTGTAA AAACATAACA ATTTAATCCA AAACCAGCTG AGAACCAGTG GTCTAAAACA 540
CACAGGGCAC TCACTCATCC AACAATGACT GTTTTTCAGA TGGTCGCCCA CTTAGCATGG 600
TTTGGTTTTT CGGAATACTC CCAATCATCA GAGGAAGACT TTTTAGGAAA CAAGATGTGC 660
ACTAAAAACT GGAAGAGATG TTGGGAGATC ACGGAGGTGA TGCTAAAAAA GGGAGTGATG 720
TGTTGGCAAA GCTCTCTGCA ACCCCTCTGT CTGGACGTGT GCGCATGCGC CGGCGACCTT 780
CCTACACACT CCTGCAAGTC TCTCGCTATC TTTTTTATCT TTCTCCCGCG CGCGCGCGCT 840
CTCGTTCTGT CTGAGCAGGG ACGCGCTCCT ACCAATCTGT CTCTCGCGCT CACATTTCCT 900
CCCTCTCCAT CACAGTCTTT TCTCTTCTAT CATCGTTGTC TATCTCAGCA TCATGCGGCA 960
ATGACAACCC CGCACTAATT AGCTCACAGC CAGAGTCTGT CAGTGGCGTG TTTACGTGAG 1020
CGAGCACGAG TGACGGCAAA GTCAGCAAAG TTCCGAGATG GAGGCGCGCG CTGCCCTCCG 1080
CGCCCCCGCC TCAAGCCCTT CGTTTCCCCT ACCGCGGAGA ACGTAAAAAG AATCGCAAAC 1140
CCGTGGAATT TTTCTTCTTC CCGTCGTTAA CGGGTGGCTC GTGTGATGAA TGGCGCTTGG 1200
GAGATACTGA CAGCTCACCT GTAGCCCGCA TTAGGTTGCA TTTAAAGCAC AGGACTGCAC 1260
AAAAATATAT ATACACACAC GCGCGCGCGC GCGCGCGCAC ACACACGGGC AGGCTCTTCT 1320
GATGAATAAT GATTGACTGC CTCTGAAAGA TCTGCGTCAG TTGTAGCTGC AGCTTTCTGA 1380
ACTGTGCCGC AGGCAATTAC TTTGTTTTAT ATTAAAAAAA AGGAAGAGGA GGAGGGAGAA 1440
ATGAGATGGA GCTCGGGAAA GATCACAGTG CCATCTAGTG GAGGCCGGCG GTGGAGGAGG 1500
TTGTTGTTTA CAGGAAAGGT AATTAAATTA CCCCATTAAC TCAGCTTGAG TTTTTCAGGG 1560
GGAAAAAGAC TGTGTGGGAG GTAACTGAAG CAATGTTAGT TATAAAACAA GTCTATATTT 1620
GTATACTGCC AGCAGTCGGT AACTACTTTA TACCATTATT TATAAGACAG AAGTAGATGC 1680
AGGGACTCAT GATCTTAGAA AAGGTTAATG AAGGAGATGC TCGCTTTTGT TTTCCTATAA 1740
GGTGAAATCT ACCTTAAATG CTTCCTGCTT CAATCCTCAT GTTTGGGGTT TGTACTGTGT 1800
GAGCGTTACA TAAAGCGCCA CAGCATTGCA GAGTTTATGT GGAAATCAAT CACAGGATCC 1860
CTTTATGGAT TCCCCCACGC TTGCTTTTAA AACATTCATC TTGGTGTGTG TTGGCCGGGA 1920
TGGTGAGGGC TAAAAATATC CTGCTTTCGG TTTATAGCGG CCAACAATGC AGGGTAGGAA 1980
ATCTACTTTG CTGCCGATCA ATAGGTACGG GTTTCCTGTC AAGTGCGCCG ACAACCTCTT 2040
TAGTCATTCA AGCCCTTTCA AATGTCTCAC ACTGCGATCT TTGTGTCCCG CCAATTTCTA 2100
ATTTCACAAT GTTTTGGTGG GAGGATTAGC TACGCCGCTA CGGAGCACTA TTTCTTTGGG 2160
GGGCTCAGGG AGAAAGAAAA AGAGTAAATC TGTTTCCATA AGGGAAGGGT TTTTGAAAAA 2220
TGCAATTTAT TCCTCTTGCT TTGAGGCCTG ATTTATTTCA TATCACGG 2268