EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-60351 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr9:16031793-16033275 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr9:16032948-16032959TTTTATTGCTT-6.32
FOXE1MA1487.1chr9:16032453-16032468TTTGTTTGTTTTACG-6.49
Foxd3MA0041.1chr9:16032452-16032464GTTTGTTTGTTT+6.32
HOXD9MA0913.2chr9:16032947-16032957GTTTTATTGC-6.02
Sox1MA0870.1chr9:16032923-16032938CACAATTTCATTGTG+6.61
Enhancer Sequence
GTAGACCCAG CCTCTACCAA AGCCTATAAA ACTTTGAACA AAGGAATTTC ATCGTCGTCT 60
TTTGCCGGTC ATCTTTGCCA GTCGTCACCG CCGTCGCTGC CAGGACGTCG CTCTTCTCGT 120
GCTGTGGCCG TTACATCGCC TCGCCCGAAG CCTCGTTACA TCACGGAGCA GACCGCGACC 180
TTCACTTGCT GCCGCCTCGA CCCCCGATCT GCTTGTGCAA CCGCTTCAAC AACAAGCCAT 240
CGGGTCAACA CATCCAAACT CTGAAACTCA TCCTAACTAC AGGAACCCAG GAAGGACTTC 300
GAACGCCGCC TTGTCCAACA TCCGTATCCC TAGCAACCGA CTAAGGAAAC CCCTCTTCAC 360
CGACAAGGGA ATTCCATCAC GTCACTGAAG TTGCTACGCT GACCAATCAG CTTCGCCGGG 420
ATTTCCCTTT GGACCAGTCG AGGAAACCAA ATTACATCAG AACGCAAGTA GCACAAACAA 480
GGTTTCTATC CATTGCTGAC TCTGGTGTGA ATTATGTTTA AGTAGTAAAG AATAGCGAAA 540
TTCTCTGCTT TTATGGTTTC TCTCAGGTTG CAATGCTAAG AACTTAGCAA AGGCTAGAAG 600
TTAAATCCAC TCAGTCAAAA CTCTCCTCAA ACTGCTTGTG CGTGTGTGTA TGTATGTGCG 660
TTTGTTTGTT TTACGTAGAT TAGTACTTTG TGTTATAGAG TAGCAATAAA CTTTTGTTTC 720
GTTTTAAGAT CCGTGTTGGT GTGTTGTGTG CTTTATAAGT TAATGCCTCA GCTTCAGATA 780
CTGCTACCTT GCTTATTAAA TAATTAGATA CTGTTTTTAT ATTGTTATTG TTGGCCACGT 840
AATAATATAA TACAGAATTG CTTTACACTA AACGTTCTAT TTGCTGGACA AATACTAAAG 900
TTAAGTGTAA GCTTTAAATA ATTCTATGTG AATCATGTTC GAATCTTTGA TTCGAATCCC 960
CAAAGTTTAA ACATGATTTA AACCAAAGAG CTGATTCTTA CATAGTGGTG GAGAATAATT 1020
CGGGCAAGCA GATCTAACTT TTAAAGCACA AAATCCCGAA ATCACGTTGT TAATCTTTTC 1080
TATTTTTGTC CGGAAAGAAT AGATCAGAAA GAACAGAAGT TTTGCTACTG CACAATTTCA 1140
TTGTGGTACC ATTTGTTTTA TTGCTTGACT ACATTTAGTG TTGTTAAGAA AGTAAAACTT 1200
CATTTAAGTT GTCCGCCGAG ACACACTGTA AGCCGCTCTA AAGCGCATGC AGAGAAAGAC 1260
AAAGCGTATT CCTTTGTGCT TATCTCATAA CGTTATATAA GGCCTTCACA GTATGATTTC 1320
GTACGCTGCG ATTCCCGGAT GGAAACTCAG CTGTGTTTTC TCCTAGTAAC TGATTTAGCA 1380
TAGCTAACTA AATTCATGTT GCCCTGTAAT TTGCTAATAC TTAGTAAATT ATTTAAAACG 1440
CGGAGCTCAG AGAAAGCTGC CTAGCGTAGT TTATAGGAGA AG 1482