EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-58968 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr8:38859715-38860582 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr8:38860069-38860080ATAATTAATAT-6.02
BHLHE41MA0636.1chr8:38859737-38859747GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr8:38859737-38859747GTCACGTGAC-6.02
CTCFMA0139.1chr8:38860494-38860513TGACCACTAGGTGTCGCCG+7.02
LMX1BMA0703.2chr8:38860138-38860149AATTTAATTAA+6.32
MITFMA0620.2chr8:38859733-38859751CCAGGTCACGTGACTAAA+7.35
MITFMA0620.2chr8:38859733-38859751CCAGGTCACGTGACTAAA-7.35
NFAT5MA0606.1chr8:38860131-38860141AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr8:38860131-38860141AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr8:38860131-38860141AATGGAAAAT-6.02
NKX2-3MA0672.1chr8:38860399-38860409ACCACTTGAA+6.02
USF1MA0093.2chr8:38859736-38859747GGTCACGTGAC-6.14
USF1MA0093.2chr8:38859767-38859778GGTCACGTGGC-6.62
USF2MA0526.2chr8:38859764-38859780CTTGGTCACGTGGCTA+6.78
USF2MA0526.2chr8:38859733-38859749CCAGGTCACGTGACTA+6.91
Enhancer Sequence
AAGCATGATC CGAAACACCC AGGTCACGTG ACTAAAGTGT TTCAAAACAC TTGGTCACGT 60
GGCTAAAGCG ATTCAAAGCA TTGATCATTT CAGAGGCGTT TCAAGACCCG GAGAATCTCC 120
ATCTGACTGG CATGATCAAG AACGTAACTG TGTCTTGTAT GGCAGTGGAC TGTGCGTGTG 180
ACAACAGATC TGTGTTACAA ATTTGTTTTG GGTTCGAATC CCGACTAGTC CAAATACTAC 240
AAAATCATGA TTTTATATAT TTTAATCATG TTACTGTTTT ATGGTGTAGT CTAGATAGGA 300
TACAGCTACG GATATGCCAT CAATTTAGCA TCATTTTTGT AACACTGTAA AACAATAATT 360
AATATTTTTA CAGTACTGTG ATGGGTTTAG GTTTTGGATA GACGTTAATA AAATACAATG 420
GAAAATTTAA TTAATAATAT AAATAATTAT TGTTAACTTC TGGCCACAAC TGTATCTGAT 480
CTAGCAACAA CCCTGTTATA TGAACAAAAC AATACAAATT TATTTACAAG GTGTTTATTC 540
GTATGTCAGA GCAATGTTGA AACAAAACGA TACAACAACA AAGCATTACC AACTGCTATC 600
AAAGCATTTC AAAATAATTG CTACAGTATG AATTCGAACC CATTATTCCC GCATGGTGGT 660
TACGGACTCT AACCGCTCGT CTACACCACT TGAAGATTTA GGGCTACAAA GTGGGGTTTC 720
ATACACTAAT TTGCTCAACT GTTCTTTGCT GAAGCTGCTT CAGTGAAATA CAATTAAAAT 780
GACCACTAGG TGTCGCCGTA GAGTGGTGTT TCAAAACGTT TCGAAGCTTC GACACATTTG 840
CTTCGATAGT TTCAGTGTTT CACGAAG 867