EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-57390 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr8:584177-585580 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF9MA0653.1chr8:584586-584601AGTTTCGCTGTCGTT-6.17
PBX2MA1113.1chr8:584347-584359GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr8:584345-584362CGGTGATTGACAGGCAG+6.55
RFX1MA0509.2chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA+7.32
RFX1MA0509.2chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA-7.33
RFX2MA0600.2chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA-7.44
RFX2MA0600.2chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA+7.47
RFX3MA0798.1chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA-7.12
RFX3MA0798.1chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA+7.48
RFX4MA0799.1chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA-7.26
RFX4MA0799.1chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA+7.32
RFX5MA0510.2chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA+7.54
RFX5MA0510.2chr8:585506-585522AGTTGCCATGGTAACA-7.54
Enhancer Sequence
AAACAGGATA CAGTCTTTAG CATCTCTGAC ATTTCTCCCC TCTGATTTTG CAGTTTATAT 60
TTTGTATTTA CATCATTTTT GTGAGGAAAA CTGACTCTTT TATTCTGTAA TGATGAGAAC 120
GCAACAGCAC CAGCGAGTGC TGAAAGAGGA AACGGTGGGC GGAGCCTGCG GTGATTGACA 180
GGCAGAGGGA TTGACCTCAC CATCATGCGA TATGAAGTAA CCGGAGGTTA ATAACGGCGA 240
CACACGCGTC AGACACGGGA GAAAACTCGA AGATTCAAGC TTATTAACAA ACTACAACGA 300
CGGAAACCCA TCGGGTGACA ACCGCTGTTG ATGCTCAGAT TATCTCCAGC TTAACTGAAG 360
TAGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTAT ATGAGTGTGT GTGTGTTTAA GTTTCGCTGT 420
CGTTGATAAA TGTTCAGCAG TTTGATGAGC AGAAGCCCGG TTGCGGAACT CAGAATGTTC 480
GAGGCTCGAG GACTCTGGAG GGTTTGTGTG GACGTCAGCT GTGTGTTGCT CGGTAAGACC 540
CGAAACACAC ACTCACTCAA AACACACAAA CGCGGCTTAT TATTAGCTGA TGACCCGCGC 600
TATTCTTATT CTTATTCTCC AACTGTAGAT TCTGCTTCCG CCACTGACTC GATACAATGT 660
TGCAACTTCA CACAGACTGA CGGGTTTATT CGCGCTAAAA TGTTTCAGTT TGATTCTAAG 720
AATAGAATGT GCGGCCAGAT GAAAGTACAG TAAGTGTTTG AACTGTAAAT GTTGACATAA 780
GCAGTGTTTG CATTACATCC GCACTGTAGG AACAGTGTCC TTCACACACT CAGAGCTGTT 840
TGCTTACATC CATTCACAGC ACATTACATT CATAGTCACT ATTTTGTTTC TTGGTCTTAT 900
ACGAGTTGTG TGTTTATGAG CAGGTAATTC TACAATAAGG AAACTGTGAT TGCTTATGAA 960
AGAAATGTAT AGGAATGTCA ATAATCAGTG GAGTCAGGCA GACGCAGAAT ATAACGCTAC 1020
TCTTCTTTCT TTGATCTCAA ATGTTGAATA GCTTTTTGGT CTTAATATTT TTCCCTATTG 1080
ACAGATAATC ACATGTCATT GTAAGCAAAT ATTTTAGTCA TTCATAGTAT ATACTAGTTC 1140
TCAATCTTGG TCCTGGAGGT CCGGTGTCCT GGGCTAGCTA ATCAAGCTCT TACTAGGCTT 1200
TCTAGAAACA TCCTTGCAGG TGTGTTAAGG CAAGTTAAGC TAAAATGTGC AGAACACTGG 1260
ACCTCCAGGA CCGAGTTTGA GAACCCTTGG TATATACTAT AGTACTTCTG CTTGGGTGAT 1320
TCATTCAATA GTTGCCATGG TAACACAACA ACTATAGTAC TATAAACAAA TGAACCAATA 1380
CTGTAGTTTT TTTTTATAGC TTT 1403