EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-56652 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr7:58311407-58313054 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr7:58311890-58311909TTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.75
CTCFMA0139.1chr7:58312154-58312173CTGCCAGCAGGTGGCGTTA+6.79
CTCFMA0139.1chr7:58312021-58312040CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr7:58312460-58312479TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
GSX1MA0892.1chr7:58311601-58311611CCTAATTAAA+6.02
IKZF1MA1508.1chr7:58312582-58312594ACTTCCTGTTTT-6.74
KLF13MA0657.1chr7:58312955-58312973TTGCCACGCCCACTTCCG+6.46
KLF14MA0740.1chr7:58312319-58312333GGACACGCCCCTTT+6.51
KLF14MA0740.1chr7:58312956-58312970TGCCACGCCCACTT+7.73
SP1MA0079.4chr7:58312954-58312969TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr7:58312956-58312969TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr7:58312954-58312971TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr7:58312957-58312969GCCACGCCCACT+7.22
SPICMA0687.1chr7:58312581-58312595GACTTCCTGTTTTG-6.22
Enhancer Sequence
CTCGGTCCCT AATAATAATA ATAATAATAA TAATAATAAT AAACGGAGCA ATTCCAATAG 60
GGCCTACGCA CCGTTTCGGT GCTCGGTCCC TAATAAACGG AGCAATTCCA ATAGGGCCTA 120
CGCACCGTTT CGGTGCTCGG TCCCTAATAA ACGGAGCAAT TCCAATAGGG CCTTGCACCG 180
TTCGGTGCTC GGTCCCTAAT TAAAGCTGCA AGCAGCGATG ATAGGGACCT CGCACCCGGG 240
CTCACCGCCG CCCGGTGGCC TCAGGATTAC AGAGAACAGC GAACAGTAAT AATTTAAGCC 300
ATTTTATTTA AAAAATCTGA GAAAATCACA GATTTATGCC AAACCTCCTC CTCTCAGCAG 360
GTGGCGCTAT GACTGTGACT CAAGATTGGC ATGTAGATGT CACCAGGAGA GGAATCTTAT 420
CAACCATGTG AAGTTTCAGG CAGATCGAAC ATTGTTTAGC TGAGTTATAA GCCAAACTGC 480
CTTTTGTCAG CAGGTGGCGC TATGACAGAC TCAATGTTGT TATGTAGATG TGTTCAGGAG 540
AGGACTTTTA TCAACCATGT GAACTTTCAG GCAGATCGGA CTTTGTGTGG TTGAGTTATA 600
ATGCAAACTA CCATCTGCCA GCAGGTGGCG CTATAACTGT GACTTAAGAT TGGCATGTAG 660
ATGCCATCAG TAATGGAATT TAATCAACCA TGTGAAGTTT CAGGCAGATC GGATGTTGTT 720
TGGCTGAGTT ATAAGCCTAT CTACCTTCTG CCAGCAGGTG GCGTTATGAC TGACTCATTA 780
CTGTTTTGCG GATGTGTTCA GAAGAGGACT TTTATCAATC ATGTGAAGTT TCAGGCTGAT 840
CGGACATTGT GTGGTTGAGT TATGAGGACT TGCTGTTCCA TGGCGAAGCG TTGAGGTTTG 900
TCATGCCGCC ACGGACACGC CCCTTTGCAA AAACTCTAGA TCTTGACAAT ATATCATCAC 960
TTAAGCTTTC AGATAACAAC CCACCAAATT TGGTGCTGAT ACGAAAAAAT TTGTGGGAGG 1020
AGTTTATTAC TCTGTAAATC ATGACATTTC CTGTGGCCAG CAGGTGGCGC TATAACTGTA 1080
TCTGGATATC GGCATGTAAA CGTGTTCTAG TCTGGACTCT TTTTAAACAT GTGAATTTTG 1140
AGGCAGATCT GATAATGCAT GCCTGAGTTA TAGTGACTTC CTGTTTTGTG GCGAATTGTC 1200
AAAGTTTGCG AGGCCGCCAC GGACACGCCC ATCGACGAAA ACTCTAAAGC TTCGCAATTT 1260
AACATCGCCA AGGCCTTTAG ATGACAAAAC CCAATTTTGG TGTCGATCGG ATAAAATCCC 1320
TAGGAGGAGT TCGTTAAAAT ACAACGCCTG GAAATGGCAA AAATGCCACT TTTTCGCCGC 1380
AGGAAGTTAA AAATATCTGA CTTCCTGTTG GGTTTGAGAT ATGGCTCCAA GAGACTTTTT 1440
GGTATGTTTT GGCATGTTTG AGGTGTGTGC CAATTTTCGT GCATGTGCGT GATTCGTGGA 1500
TCGGGGGCTC GTCCGTTTAA TTTTTCTAGG TGGCGCTGTC GAGTCATTTT GCCACGCCCA 1560
CTTCCGAGAC CCATATCAAC CTGCTATTTA CACCGCGTTT GGTGTGTGTG CAAATTTTCA 1620
TGAGTTTTCG GGCATGTTTA GACCCTC 1647