EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-55764 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr7:34184450-34184990 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr7:34184525-34184535TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr7:34184525-34184535TCTAATTAAA+6.02
BACH2(var.2)MA1470.1chr7:34184718-34184738TATCCGTCACGTCATCTTGT-6.07
DMRT3MA0610.1chr7:34184490-34184501TTTGATACATT-6.02
HOXC11MA0651.1chr7:34184658-34184669GGTCGTAAAAC+6.14
HOXC12MA0906.1chr7:34184658-34184669GGTCGTAAAAC+6.14
HOXD10MA1506.1chr7:34184658-34184669GGTCGTAAAAC+6.62
HOXD12MA0873.1chr7:34184658-34184669GGTCGTAAAAC+6.02
Hoxa11MA0911.1chr7:34184658-34184670GGTCGTAAAACT+6.74
MIXL1MA0662.1chr7:34184831-34184841TCTAATTAAC+6.02
PHOX2AMA0713.1chr7:34184522-34184533TAATCTAATTA+6.32
POU1F1MA0784.1chr7:34184832-34184846CTAATTAACATATT-6.88
POU1F1MA0784.1chr7:34184708-34184722CTAATTTGCATATC-7.19
POU2F2MA0507.1chr7:34184708-34184721CTAATTTGCATAT+7.04
POU3F1MA0786.1chr7:34184709-34184721TAATTTGCATAT-6.74
POU3F2MA0787.1chr7:34184709-34184721TAATTTGCATAT-6.74
POU3F3MA0788.1chr7:34184709-34184722TAATTTGCATATC-6.09
POU3F3MA0788.1chr7:34184833-34184846TAATTAACATATT-6.36
POU5F1MA1115.1chr7:34184710-34184721AATTTGCATAT-6.62
PROP1MA0715.1chr7:34184522-34184533TAATCTAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr7:34184522-34184533TAATCTAATTA+6.32
Enhancer Sequence
GAGAGTATGC ATATTATAAT AGTGAGTTTA TAACTCACTT TTTGATACAT TAACTTAGCG 60
TTCATATTAG CGTAATCTAA TTAAAAATAA ATATTTATGA ACAGGATATT TTATAACCTA 120
GGAGCGCTGA CTTAAAATGT ATTATTTGGC CATGTATCTT TCATCTCCCT ACCGGACGCA 180
TTAGGAACAA CAGGGCCGTA AAATTGTGGG TCGTAAAACT GCTAGGATCC AAAAGCCTGC 240
ACGAAAAGTT GCCACCCACT AATTTGCATA TCCGTCACGT CATCTTGTAA TATCTGGCAA 300
GCGTAAGCCC GTCATCTCTT TACTCTCCGA GGTGCAGTGT ATTATATTAC ATTTAAACAT 360
TACATCCAGA TATAAATAGG TTCTAATTAA CATATTGCTT TGCGCGATGT CGTCATTGCA 420
TAATCAACTC AAAACTACAT CTTTATGTTG TATAAAAAAT AATTTACGTT TTCTCAAATT 480
GACTGGCCAT CTCAGCAAAA ACATTATTTG AAATATGTCC ATATAGATTT GTATGAAAAA 540