EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-55652 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr7:29969849-29972209 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXP1MA0481.2chr7:29971399-29971411TACTGTTTACTT-6.18
Foxq1MA0040.1chr7:29970115-29970126TATAAACAATA-6.32
LMX1BMA0703.2chr7:29972067-29972078GTTTTAATTAA+6.14
NFIL3MA0025.1chr7:29972058-29972069TTATGTAACGT+6.32
POU4F1MA0790.1chr7:29971047-29971061CATTAATTATTGAT-6.43
RREB1MA0073.1chr7:29970377-29970397GAGTTGGGGGTGGGTGGTGG-6.66
SOX10MA0442.2chr7:29971001-29971012TCCTTTGTTTT-6.32
Sox3MA0514.1chr7:29971002-29971012CCTTTGTTTT+6.02
ZNF263MA0528.1chr7:29969916-29969937GGAGGAGGAGGAGGAGGGTCG+7.28
ZNF263MA0528.1chr7:29969913-29969934AATGGAGGAGGAGGAGGAGGG+7.79
Enhancer Sequence
CACCTCTGGT TTCGTGTGTG TGTTTGAGAG AGAGAAAGAG TGTGTTAGAG GTGTGGCTCC 60
AGTGAATGGA GGAGGAGGAG GAGGGTCGAG CCGAGTGTCT CAGTGGTTTA TCCATGAGAG 120
AAGAAATCAG CGGCTGAATG TTGCACAGTT ACCCGGGACT CAGAGAAAAC CTGCTGGATT 180
ACAACGACTC ATTTACGACT CGCATCAGCT GGCAGTCTAT TCAGAGAGAG GTGTAACAGC 240
TTCAAGCGCT TCAGCGGTAA GTTGCATATA AACAATAAGT TAAAGGGGCA GTGGGTTGAC 300
CAAGAGGTGC GATCGAGGAT CCAGTATTGT TCGCAGACGT AGGACTGACC ACGTTTATCT 360
GTTGAATGTT GTGGTGCGGA AAATCACCTG TTGCGAAACA ACACTTTTTA ATGTCGACCA 420
ATAATTTATT TTCTTCTGAG ATAAGTGTTT TGGTACTAAG GTGTACTAGG ATCCAGACAG 480
GCTGTATTTA GTGTGTTTGT AGTTGTAGTA GAGGGTGGGT GAGTGAGTGA GTTGGGGGTG 540
GGTGGTGGTA GTAGGTGGGT GGAAAAAAAT GGCTCAAATA AACAAGGTGG TGCTGGATTG 600
TGCGTGTGCG TGCTCTGACA AAGTACACCG CAAAGTAAAG CTCGACATCT TGCAAGTGTG 660
TGTGAGGATG AATAAACATC AAAAGTAGGG TGGAAAGTGC AGATTTAGTA CTGTTTGTGA 720
TGCAGAAAGG GTAAAAACTG CACAGTCAGC TTTTATACCC ACGTGTTATC GCATGGGAAC 780
TTTTAATAGA ATATCAGACG GTTTCAGATC AAGTGGAGCA GATCATCAGA AAAACTAGGA 840
CTGTATAGTT TCACGTTTAC AGCAAGCATC AGGACTGCAT TAAGTAATGC ACTATTCTTC 900
TGTAAACAGT GATGACAAAT ACATTAAAAA CAACAGGTTA CATGTAAGAC CTCTATTAGC 960
TTGCATAGTC AAGAATAATC ACATAATCTA ACATAACCTT TGGTTATATA GATCCATTAT 1020
GATGACATCA GGCAAGCAAA AACATTCACA AAACAAAAAC AAGATTGTTT CTGACTATTA 1080
CTTTTATTTA ATTGCCCTTA ACCTTAAAAT AATCAGCCTC ACCTTTCTGG AACCCGTCCT 1140
TAAATATGTG TTTCCTTTGT TTTAAAGATG CTTTGATCAA GAGTACTGCC TTCATTACCA 1200
TTAATTATTG ATATTAATCA TCTTAATTAT GACGGGGGTT TCTGAAAACA GGGAACATCC 1260
TCCTTAATTG TGTCGACTGG GTTTTTTAAT TTGTTTACCC TTCAGACCAT GTGATTTTGA 1320
GTGTAGAGAA GGAGGTTAGA TAATGATTAA CATGAGATAA CAATTAAATT GTAATTAGTG 1380
ATCAAAAAAT GTGTCTTCTC CTCTTACTAT CTTTTTAGTT GCTGATTATT AGAACAAGAA 1440
TTCAAAACTG AAGTGTACTT CCTTATATTT TTTAAATGCT GACTAAAACT GAAGACCGTA 1500
GTTCCTTTCT ATGGTTGGTT GAGAGAAGAG AGCACATGAA AGCAGACCTT TACTGTTTAC 1560
TTAAACTCTG CTCTGTTTAA AACAGCATCG ACCTTTTGGA TCAAAGACTC GGACAGTGAA 1620
TACCTTGTTT GTCCTATCAA AGAATCGTTT GATGTTTATG CAGTTTAGTC AAGATGCAAG 1680
TTCTAGTGTT TTTTAGTTAG TATTTGGTTG GGAGTCAACA ATTGATAACC GGTTCTCCAT 1740
TTGGTTCATT GTATCAGAGG AAGACTGTTC TTCTCACCAT GTCACACCTC AGGACAGTTA 1800
AAGATCCTTT TATGTGTAAA TAACCGAGAA CATGAGCTCC ATATTGTTGA GCTTATTATG 1860
AGGTCAGCAG TTTCAGTAGA ATTTAACTAA TATAGATGGC CTTACTTCAA TTTTTTGGCC 1920
CAAGGTCTGG CTCTACAAAG AATTGTAAAA GAAACCAATG CTGTGCTGCT CTTTTCCAGT 1980
TAGTGTCATA AAAGTATTAG GCCTAGAGGA ACGAGGCCAG ACAGCTTGTA AATTTTATTG 2040
CAAATATCAG AGATCTTTTT GAAGTTAAAG ATAAGGCGTT GACCTCTATA TCCTTCTTTC 2100
GATGGTCTAC TTTACGATAT AGTGCATTGT AAATTATCTT ATACTGACAA GAAAACTTTA 2160
CCAATTAAGA GTGAAGAGCG AATCGAATAT TTACTGCTGT TAAAAAGAGT TATGTAACGT 2220
TTTAATTAAC TTCTAGAGTA CAAGGTTGAG AGGTTATATC ATTAATCCCT CTATCAAGTC 2280
TTCCTCTCTT GAGATCAGGC ACTAAATCAG ATCATATCAA CATCAATGGA AGGTAGTTTA 2340
TAAACAAAAG TTATTTCCCT 2360