EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-54377 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr6:60220793-60222512 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRTA2MA1478.1chr6:60221316-60221328AATCGTTACATT+6.32
GSX1MA0892.1chr6:60220955-60220965CCTAATTAAA+6.02
SOX13MA1120.1chr6:60220887-60220898AGCCATTGTTT-6.14
ZNF384MA1125.1chr6:60221379-60221391TCAAAAAAAAAA+6.11
ZNF384MA1125.1chr6:60222170-60222182AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:60222171-60222183AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:60222172-60222184AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr6:60222173-60222185AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr6:60222178-60222190AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
TAACTGCTTT AAAAAAATAA TAATAATAAT ATAGGCCCAT TAGGTGCCCA CAAAATACCT 60
CTAGGTCTTA AGGGTTAGAT GTTTAATACT TAATAGCCAT TGTTTAAAAC AGGTGTCAAA 120
CTAAATTCCA TAAGGGCTGC AGCTCCACAG TTTAATTCCA ACCCTAATTA AACACACCTG 180
ATCAAACTGA TTGAGTCCTT CAGGCTTGTT TGAAACCTAC AGGTAAGTGT GTTGGAGCAG 240
GGTTGGAACT AAACTGTGGA GGGCTTCAGC CCTCCAGGGA TCTAGTTGAC ACCCCTGGTT 300
TAAAGGGTTA TATTTTACCA TCAAAATATA TGTTATATAA TCAACATAGA TTGTAAAAAT 360
TAAAGTTGAG TGCCATTAGT TAGTGCCCGC TCACTTTTGA CAAGGCCCGT CTAAAATATA 420
TTTCTGCTAT TGTAATACAA ATGCACTATT GTTGCATTAT CATAGTTTAA TTTTGTCATG 480
TTCAGAGATC TTAAATACGG TTATTCCCCC TGCAAACATT TTCAATCGTT ACATTTGTCA 540
TTTCCCCTCC AAATAAAATT TAGCCGGAGG CGCGCAACAT ATGACCTCAA AAAAAAAAGG 600
TGCTGTAACA TTACCTATAT GTAGCACCCC AATATGACAG CGGCATAGCA GTGTTTAGGC 660
ACTTGTTTGC TTTTGTTATT AACTTGAAAG TTCAGCTATT CAGTTTAATT GAAAAAAGGG 720
GGCAGTTTAA ATTGCATTAA AGGCAACTAC TGATGGGTTG TGTAATGTTT CAAAGAGCTG 780
TTGCAGCATG AGTGGAAAAT AAAATCGTAC TAGTGCTGCC TGGCACAGTT TGGCACAAAA 840
TGGAGCAGTT CCATTTAGAG AATGAATCAG CACGAGTGGA AAAGCAGCTA AAGTTTATGA 900
AAAGTTTTAA TCTGGATGTA GAGAATCTCA TAACACAGAA AAAGCACTCC TAAAGGCGTA 960
TTTATACTTC TGCATCAAGC ACACAAGTAT GCTTCAGCAC AACCTGTGCA TGGTCACATA 1020
GCCCTTGCTG TGGCAGTCAG ACACTGATGC ACACCTCAAT GAATAGAGCA AGCTGTGATT 1080
GGTCAGCTTT GTAGAGCTGA CAAGTGTGCC CTAACCTAGT CCTCATCTTC AGTCAGTAAT 1140
TTGGGGGCCA ATTCTGACAG CAAACTGTGT AAGGCCAGAT TAAGCATCTG TAAAACTCTT 1200
CATATTAATG TTGCCAAACT TTGACAAGCC ATCAATAACT GATGCAGAAA AGCTTATTCA 1260
TGCTTTCATG ACCTCTCAGA CTACTGTAAT GAGTTACTAG GTGGTTACCC TGCTGGCCTC 1320
ACTAACAAAC TGCAGCTGGT TCAAAATGCA GGTGCTAGAG TGCTTTCTAG AACCAAGAAA 1380
AAAAAAAAAA AAAAAAACAG TACTCCAGTT CTTTCAGTGC ATGGACTCCT TATTAAATAT 1440
TTAATTTACA TTGTTATTGT TTAACTACAA AGCCCTCAAT GCCTTAGCTG CCCAGTATTT 1500
GAGGGAGCTC CTGGTGTATT ATGGAGCATG AGATTGATTC CTTTAAGACC CTATAGTGAC 1560
CCACGGGTCC ATGTATTGAT CCTGAAGGGT CAGTCTGTAC ACCAGCCAGT GNNNNNNNNN 1620
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 1680
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NCTGTAAAG 1719