EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-54220 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr6:57858819-57861277 
TF binding sites/motifs
Number: 32             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr6:57860777-57860791GGGGGGGCGTGGCT-6.35
KLF16MA0741.1chr6:57860132-57860143GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr6:57860278-57860289GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr6:57860424-57860435GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr6:57860570-57860581GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr6:57860779-57860790GGGGGCGTGGC-6.62
NR4A1MA1112.2chr6:57860681-57860691GTGACCTTTA-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr6:57860765-57860778TTTAAGTGGTTTG-6.24
RREB1MA0073.1chr6:57858872-57858892CCCCAAAACCACCCACCCCT+6.1
RREB1MA0073.1chr6:57858841-57858861TTTGGGGGGTGGTTTTGGGG-6.34
RREB1MA0073.1chr6:57858840-57858860TTTTGGGGGGTGGTTTTGGG-6.74
SP1MA0079.4chr6:57860131-57860146TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr6:57860277-57860292TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr6:57860423-57860438TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr6:57860569-57860584TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr6:57860778-57860793GGGGGGCGTGGCTTG-7.85
SP3MA0746.2chr6:57860131-57860144TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr6:57860277-57860290TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr6:57860423-57860436TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr6:57860569-57860582TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr6:57860778-57860791GGGGGGCGTGGCT-6.74
SP4MA0685.1chr6:57860129-57860146TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr6:57860275-57860292TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr6:57860421-57860438TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr6:57860567-57860584TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr6:57860776-57860793TGGGGGGGCGTGGCTTG-7.45
SP8MA0747.1chr6:57860131-57860143TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr6:57860277-57860289TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr6:57860423-57860435TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr6:57860569-57860581TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr6:57860778-57860790GGGGGGCGTGGC-6.44
ZNF263MA0528.1chr6:57858999-57859020GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGA+6.05
Enhancer Sequence
GCGTAATGTT GAGTCAATGC GTTTTGGGGG GTGGTTTTGG GGCCCCTGCG GGGCCCCAAA 60
ACCACCCACC CCTTATAAAA GTCATAGCAC ACCATTCCCG ATAAGGCCGC ACGATTTGAG 120
GCCACTTTCA AGGGTCTGGG ACGAAAGCTG CGGGACTAGT TACGCGCCGA AAAAGTGTAC 180
GGAAGAAGAA GAAGAAGAAG AAGAAGAACT AGAATTGTAC ATTTCCTAAA GGAAATGTGA 240
ATGGGGTTTG CGTGGCAAAT CGATGGGGTA CAAAATGGTA CTAAACTGGG CAATAGCACT 300
GGAAAGGTAA GAAATGGTGG TTGCTAAGAT GTTGCTAGTC GGTTGCTAGG GTGTCCTGAG 360
TGGTTGCTAG GCGGTTGCTA GGGTGTTCTG AGTGTTTGCT AAGGTGTTGC TAGGTGGTTG 420
CTAGGGTGTC CTGAGTGGTT GCTAGGTGGT TGCTAAGGTG TTGCTAGGCG GTTGCTAGGG 480
TGTTCTAAGT GGTTGCTAGG TGGTTGCTAA GGTGTTGCTA GGTGGTTGCT AGGGTATTCT 540
AAGTGGTTGC TAGGCGGTTG CTAGGGTGTC CTCAGTGGTT GCTAGGTGGT TGCTAAGGTG 600
TTGCCAGGCG GTTGCTAAGG TGCCCTGAGT GGTTGCTAGG TGGTTGCTAA GGCGTTGCTA 660
GGTGGTTGCT AGGGTATTCT AAGTGGTTGC TAAGGCGTTG CTAGGCGGTT GCTAGGGTGC 720
CCTGAGTAGT TGCTAAGTGG TTGCTAAGGT GTTGCTAGGT GGTTGCTAGG GTATTCAGAG 780
TGGTTGCTAA GGCATTGCTA GGCAGTTGCT AGGGTGTCCT GAGTGGTCGC TAGGCCCTTA 840
CTAAGGCGTT ACTAGGCGGT TGCTAGGTGG TTGCTAGGCG GTTGCTAGGG TAATTTGGGT 900
GGTTGCTAGG CAGTTGCTAG GGTACCCTGG TTGGTTACTA GGCAAGCCTA ACATACATGC 960
CTGATGAAAT AATTATACTT AGTAAGCATT TATAGCAAGT TACAGTACTT GGCTAGTCAA 1020
TATTAGCATG TAGCTAGTCA CTGCTAGCAT GTGTAGCATA TAGGAAGTTC CGTTTGCTAG 1080
CATGAGTCAA ACGAGCCAAT CCCCAAGTCT CTACGATGTT CCGATGCTGA GATATAACTG 1140
TTGATGAATG GTTGCTAAGG TACTCTGTTT TGTTGCTATG GGCGAGGTTG CAGAGTGAAC 1200
TTGAATGTGG TTGGCTGTCC AAGTCAAATG AGCCAAACCC CAAGTCAATA GGACACTGCT 1260
ATGCAAAGAT ATGCATGTAG GCCAGTTACA ATGGCAGTCT ATGGGACCAG TTTGGGGGCG 1320
TGGCTTGTCA CCTTCATTAT CATATTGAGA TGCTCATTGG TTGTCTTAGT CAGATGAGCC 1380
AACCCCCAAG TCAATAGGAC ACTGCTAAGC AAAGATATGC ATGTAGGCCA GTTATAATGG 1440
CAGTCTATGG GACCAGTTTG GGGGCGTGGC TTGTGAGCTT CATTATCATA TTGAGATGCT 1500
CATTGGTTGT CTGAGTCAGA TGAGCCATCC CCCAAGCCAA TAGGACACTG CTAAGCAAAG 1560
ATATGCATGT AGGGCAGTTA TAATGGCAGT CTATGGGACC AGTTTGGGGG CGTGGCTTGT 1620
GAGCTTCATT ATCATATTGA GATGCTCATT GGTTGTCTGA GTCAGATGAG CCATCCCCCA 1680
AGCCAATAGG ACACTGCTAA GCAAAGATAT GCATGTAGGG CAGTTATAAT GGCAGTCTAT 1740
GGGACCAGTT TGGGGGCGTG GCTTGTGAGC TTCATTATCA TATTGCAATG CTGATTGGTT 1800
GTCTGAGTCA GATGAGCCCA CCCCCATGTC TCTATGACAC TCCTATGTAA TGTTATAGAT 1860
GTGTGACCTT TATAATGGAA GTCAATGGGA TCTGCAATGG GACATCCCAC CCCATGTTAA 1920
GTCAATGGGG CACCTTAATA GGGGTCTTTA AGTGGTTTGG GGGGGCGTGG CTTGTGAGCT 1980
TCAAAATCAT ATTGAGATGC TGATTGGTTG CCTCAGTCAA GTTAGCCAAC CCCCAAGTCT 2040
GTATGACACT GCAATGTAAT GTGATTGACG TGAGTCAAGA AATGAATGGG AGTCAATGGG 2100
CCATGTAAAG TCAATGGGGA CCCCTTTGGG ACGTCCTAGC ACCCCAGGGG TACAACTTAT 2160
ACCCCTTTTT GGGGTATGTT CTCATACAGG CTGCAACCCC GTACAGATGT TGCGAATCCC 2220
ATATTTCTAC GAATTTCACA CTTGGCGCTA TAACGCCTAA AAGGTCGTCC CATTTCGCGG 2280
CGCGTTTAGT GCTCTCCTAG AAAAATGAAT GGGAGTCAAT GGGGCCAATG TAAGTCAATG 2340
GGAGCACTTT GGGACGTCCT AGAGCCCCAG GGGTGCAACT TTTACCCCCT TGCAAGGTAT 2400
GTTCTCACTT AGGCTGCAAC CCTCTACAGA TGCTGTGAAT CCCATATTTC TATGAAAT 2458