EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-53138 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr6:26965477-26966267 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr6:26966049-26966066GGTCATTAATTAATTAA+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr6:26965686-26965704CCCTCCTTCCTCTCTACC-6.09
Lhx3MA0135.1chr6:26966052-26966065CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr6:26966055-26966068TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr6:26966056-26966069AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr6:26966059-26966072TAATTAATTATTC+7.12
PBX2MA1113.1chr6:26965937-26965949GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr6:26965935-26965952AAGTGATTGACAGGTGG+6.14
POU4F1MA0790.1chr6:26966060-26966074AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr6:26966058-26966074TTAATTAATTATTCAT-7.91
POU4F3MA0791.1chr6:26966058-26966074TTAATTAATTATTCAT-8
POU6F1MA0628.1chr6:26966053-26966063ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:26966057-26966067ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:26966053-26966063ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr6:26966057-26966067ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr6:26966006-26966017AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr6:26965612-26965623GTCTTTGTTTT-6.14
Enhancer Sequence
ACAAAAAAAA ACACAGTTTT GTAAGTTCTG CTATGTACGT ATTACGTACG GTTCGTCCGA 60
TAGACAACAC CGGCATCGCG ATCCTCCGCT GCAAATCCGC TCGTGAAAAG TACACACTCA 120
GGCCCTGTTT ACACTGTCTT TGTTTTTAAA TGGCATTTTA GAACGACAAC GATTTGACAT 180
CCACAGTGGC GTGTAGCATT TCTGAGCAGC CCTCCTTCCT CTCTACCTCT GAAAATGCAC 240
ATCATGTGAC CACACAGACA CAGACGCACA CACAGCCATG CGCTCGAGAC AGCAGGTCCA 300
GGCAGTCAGA GGACTGCTTC AATCTTTTAC TCACTTGTAC TTAGTCATTT TAGCGAACAC 360
CTCAGATACT GTTGGCTGGT TCCTGTTGGT TGTGCGTCTT TTTTACCAAC GCCATTATAA 420
CGACACAGAT CACTGCCTAT TCACGAGTCC CGCAGAAAAA GTGATTGACA GGTGGTAATT 480
ATGTGTGTAT CTTGCCTTTA TTCATTTTCT GTATGATTTG TTTATGGGTA AAACAAAGAC 540
CATACAGGTC AGGTAGTTAC AAATAATTAA TTGGTCATTA ATTAATTAAT TATTCATAAT 600
CGAAAATCGA ATAGTGAATT TAGAATAGAA AATGTAATCG AATCGAGAAT TTGGAGGATC 660
GTGACACACT TATTAGATGA GGTCTTCTGA GAAGGTTTTT AAAAGGTCTT CTCCTTACTT 720
CCGTGTGCAG CTGTATAGTG TATTCTGGGA AATTCTTCTT ACTCCTTGGT TTCAAGTGTG 780
GTGCTGAAAA 790