EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-52666 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr6:20170705-20171845 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:20171176-20171195TTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.79
CTCFMA0139.1chr6:20171309-20171328TTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.79
FOSMA0476.1chr6:20171199-20171210TGTGACTCATT+6.62
GSX1MA0892.1chr6:20170885-20170895CCTAATTAAA+6.02
KLF13MA0657.1chr6:20171802-20171820TTGCCACGCCCACTTCAA+6.21
KLF14MA0740.1chr6:20171474-20171488GGACACGCCCCTCT+6.17
KLF14MA0740.1chr6:20171803-20171817TGCCACGCCCACTT+7.73
SP1MA0079.4chr6:20171801-20171816TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr6:20171803-20171816TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr6:20171801-20171818TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr6:20171804-20171816GCCACGCCCACT+7.22
Enhancer Sequence
CCAATAGGGC CTTGCACCGT TCGGTGCTCG GTCCCTAATA ATAATAATAA TAATAATAAA 60
AAACGGAGCA ATTCCAATAG GGCCTACGCA CCGTTTCGGT GCTCGGTCCC TAATAATAAT 120
AATAATAATA ATAAACGGAG CAATTCCAAT AGGGCCTACG CACCGTTTCG GTGCTCGGTC 180
CCTAATTAAA GCTGCAAGCA GCGATGATAG GGACCTCGCA CCCGGGCTCA CCGCCGCCCG 240
GTGGCCTCAG GATGACAGAG AACAGCGAAC AATAATAATT TAAGCCAATA TATATTTAAA 300
AAACCTGAGA AAAATCACAG ATTTATGCCA AACTTCCTCC TGTCAGCAAG TTGCGCTTAG 360
ACTGTGTGTC AATATTGGCA TGTAGATGTA TTTAGGAGAT AAATTTTTTT TAACCATGTA 420
ATTTTTCAGG CAGATCGAAC ATTGTTTGGC TGAGTTATAA GTAACTTCCT ATTGCCAGCA 480
GGTGGCGCTA TGACTGTGAC TCATTATTGG CTTGTAGATG TCTTCAGGAG CGGATTTTAA 540
TAAACCATGT GAATTTTCAG GCAGGTCAAA CATTGTGTGG CTGAGTTATA AGCCGAACTT 600
CCGGTTGCCA GCAGGTGGCG CTATGACTGA CTCAATATTG TTATGTGGAT GTGTTTAGGA 660
GAGGACTTTT ATCAACCATG TGTAGTTTCA GGCAGATCGG ACATTGTGTG ATTGAGTTAT 720
AAGGAATTCC TGGTCAATGG CGAAGCGTTG AGGTTTGTCA TGCCGCCACG GACACGCCCC 780
TCTCCGAAAA CTCTAGATCT TCGCAATTTA ACATCGCCAA GGCCTTTAGA TGACAAAACC 840
AAATTTTGGT GTTGATTGGA TAAAATCCCT AGGAGGAGTT CGTTAAAATA CAACGCCTGG 900
AAATGGCAAA AACGCCACTT TTTTACAGCA GGAAGTTAAA AATATCTGAC TTCCTGTTGA 960
GTTTGAGATA TGGCTCCAAG AGACTTTTTC GTATGTTTTG GCATGTTTGA GGTGTGTGAC 1020
AATTTTCGTT CATGTGTGTG ATACGTATAT CAGAGGCTCG TCCGATTAAT TTTGGTAGGT 1080
GGGGCTGTCG AGTCTATTTG CCACGCCCAC TTCAATATTG TTATGTGGAT GTGTTCCGGA 1140