EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-52652 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr6:20134658-20135785 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:20135516-20135535TGCCCAGTAGGTGGCGCTA+7.51
CTCFMA0139.1chr6:20134729-20134748TGACCAGCAGGTGGCGCTA+9.14
IKZF1MA1508.1chr6:20135331-20135343ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr6:20135638-20135650ACTTCCTGTTTT-6.74
KLF13MA0657.1chr6:20135224-20135242TTGCCACGCCCACTTCAA+6.21
KLF14MA0740.1chr6:20135225-20135239TGCCACGCCCACTT+7.73
Nfe2l2MA0150.2chr6:20135212-20135227TGCCGAGTCATTTTG-6.51
SP1MA0079.4chr6:20135223-20135238TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr6:20135225-20135238TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr6:20135223-20135240TTTGCCACGCCCACTTC+6.99
SP8MA0747.1chr6:20135226-20135238GCCACGCCCACT+7.22
SPICMA0687.1chr6:20135637-20135651GACTTCCTGTTTTG-6.22
Enhancer Sequence
CCCAATTTTG GTGCTGATAC GATAAAATTT GTGAGAGGAG TTCGTTACAG TGTAAAACAT 60
GACATTTCCT GTGACCAGCA GGTGGCGCTA TAACTGTATC TGGATATCGG CATGTAAACG 120
TGTTCTGCTC TGAACTCTTA TTAAACATGT GGATTTTGAG GCAGATCTGA TAATGCATGC 180
CTGAGTTATA ATGAGTTCCT GTTTTGTGGC GAATCGTCAA AGTTTGCGAT GCCGCCACGG 240
ACACACCCAT CGACAACACC TCTAAAGCTT CGCAATTTAA CATCGCCAAG GCCTTTAGAT 300
GACAAAACCC AATTTTGGTG TCGATCGGAT AAAATTCCTA GGAGGAGTTC GTTAAGATAC 360
AAAGCCTGGA AATGGCAAAA ATGCCACTTA TTTGCCGCAG GAAGTTAAAA ATATCCGACT 420
TCCTGTTGGG TTTGAGATAT GGCTCTAAGA GACTTTTTTG TATGTTTTGG CGTGTTTGAG 480
GTGTGTGCCA ATTTTCGTGC ATGTGCGTGA TTCGTAGATC AGGGGCTCGT CCGTTTAATT 540
TTCATAGGTG GCGCTGCCGA GTCATTTTGC CACGCCCACT TCAATATTGT TATGGGGATG 600
TGTTCAGGAG AAGAATTTAA TCAACCATGT GTAGTTTCAG GCAGATCGGA CATTGTGTGG 660
TTGAGTTATA AGGACTTCCT GTTCCATGGC GAAGCGTTGA GGTTTGTCAT ACCGCCACAG 720
ACACGCCCCT CTGCAAAAAC TCTAGATCTT CACAATATAT CATCGCTAGA GCTTTCAGAT 780
AACACTACCC AATTTTGGTG CTGATACGAT AAAATTTGTG GGAGGAGTTT GTTATAGTGT 840
AAAACATGTC ATTTCCTGTG CCCAGTAGGT GGCGCTATAC CTGTATCTGG ATATTGGCAT 900
GTAAACGTGT TCAGGTCAGG ACTCTTATCA AACGTGTGAA TTTTGAGGCA GATCGGATAA 960
TGCATGCCTG AGTTATAACG ACTTCCTGTT TTGTGGCGAA TCGTCAAAGT TTGTGAGGCC 1020
GCCACGGACA CGCCCATCGA CGAAAACTCA AAAGCTTCGC AATTTAACAT CGCCAAGGCC 1080
TTTAGATGAC AAAACCCAAT TTTGGTGTCG ATCGGATAAA ATCCCTA 1127