EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-52649 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr6:20126869-20128617 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr6:20127133-20127152CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr6:20127574-20127593TGGCCAGCAGGTGGCGCTG+9.21
CTCFMA0139.1chr6:20128361-20128380TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
IKZF1MA1508.1chr6:20127388-20127400ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr6:20128176-20128188ACTTCCTGTTCC-6.44
IKZF1MA1508.1chr6:20128483-20128495ACTTCCTGTTTT-6.74
KLF13MA0657.1chr6:20128069-20128087TTGCCACGCCCACTTTAC+6.67
KLF14MA0740.1chr6:20128070-20128084TGCCACGCCCACTT+7.73
Klf12MA0742.1chr6:20128070-20128085TGCCACGCCCACTTT+6.06
SP1MA0079.4chr6:20128068-20128083TTTGCCACGCCCACT+6.18
SP3MA0746.2chr6:20128070-20128083TGCCACGCCCACT+6.71
SP4MA0685.1chr6:20128068-20128085TTTGCCACGCCCACTTT+7.11
SP8MA0747.1chr6:20128071-20128083GCCACGCCCACT+7.22
SPICMA0687.1chr6:20128482-20128496GACTTCCTGTTTTG-6.22
Enhancer Sequence
CCTGCTATTT ACACCGGGTT TGGTGTGTGT GCAAATTTTC ATGAGTTTTC GGGCATGTTT 60
AGACCCTCAA AAGTGCCCCG ATAGGGGGCG GAATAATAAT AATAATAATA ATTAAAGCTG 120
CAAGCAGCGA TGATAGGGAC CTCGCACCCA GGCTCACCGC CGCCCGGTAG CCTCAGGATA 180
ACAGAGAACA GCGAACAATA TTAATTTCAG CCGATATATA TAAAGAACCT GAGAAAAAAT 240
CACAGATTTA TGCAAAACTT CCTCCTGTCA GCAGGTGGCG CTATAACTGT GACTCAAGAT 300
CGGCATGTAG ATGTCTTTAG GAGAGGCATC TCATCTAACC TGTGAATTTT CAGGCAGATC 360
GGACATTGTT TGGCTGAGTT ATAAGCCAAA CTACCTTCTG CTATCAGGTG GCGCTATGAC 420
TGTGACTCAA TATTGTTATG TGAATGTGTT CAGGGGAGGA CTTTTATCAA CCATGTGAAG 480
TTTCAGGCTG ATCGGACTTT GTGTGGTTGA GTTATGAGGA CTTCCTGTTC CATGGCGAAG 540
CGTTGAGGTT TGTCATGCTG CCACAGACAC GCCCTTCTGT GAAAATTTCA GACCCTAACA 600
AAATGTAATT GCTAGAACTT TCAGATAACA ACCAACCAAA CTTGGAGCTG ATACGAAAAA 660
TTTTGTGGGA GGAGTTTATT ACTCTGTAAA TCATGACATT TCTTGTGGCC AGCAGGTGGC 720
GCTGTAACTG TATCTGGATA TTGGCATGTA AATGTGTTCA GGTCAGGACT CTTATTAAAC 780
ATGTGAATTT TGAGGCAGAT TAGATAATGC ATGCCTGAGT TATAATGACT TCCGATTTTG 840
TGGCGAATCG TCAAAGTTTG CGAGGCCGCC ACGGACACGC CCATTGACAA AAACTCTAAA 900
GCTTCACAAT TTAACATCGC CAAGGCCTTT AGATGACAAA ACCTAATTTT GGTGTCGATC 960
AGATAAAATC CCTAGGAGGA GTTCGTTAAA ATACAACGCC TGGAAATGGC AAAAATGCCA 1020
CTTATTTGCC GCAGGAAGTT AAAAATATCC GACTTCTTGT TGGGTTTGAG ATATGGCTCC 1080
AAGAGACTTT TTCGTATGTT TTGGCGTGGT TGAGGTGTGT GCCAATTTTC GTGCATGTGC 1140
GTGATTCGTA GATCAGGGGC TCGTCCGTTT AATTTTTATA GGTGGCGCTG TCGAGTCATT 1200
TTGCCACGCC CACTTTACTA TTGTTATGGG GATGTGTTCG GGAAAGGACT TTTATCAAGC 1260
ATGTGAAGTT TTAGGCTGAT CGGACTTGGT GTGGTTGAGT TATAAGGACT TCCTGTTCCA 1320
TGGCGAAGCG TTGAGGTTTG TCATGCCGCC ACAGACACGC CCCTCTGCGA AAACTCTAGA 1380
TCTTCACAAT ATATCATCGC TAGAGCTTTC AGATAACACC ACTCAAATTT GGTGCTGGTA 1440
CAATAAAGTT TGTGGGAGGA GTTTGTCACA CTGTAAAACA TGTCATTTCC TGTGGCCAGC 1500
AGGTGGCGCT ATAACTGTAT CTGGATAGTG GCATGTAAAC GTGTTCAGGT CAGGACGCTT 1560
ATCAAGCGTG TGAATTTTGA GGCAGATCGG ATAATGTATC ACTGAGTTAT AATGACTTCC 1620
TGTTTTGTGG CGAATCGTCA AAGTTTGCGA AGCCGCCACG GACACACCCA TCGACGAAAA 1680
CTCTAAAGCT TCGCAATTTA ACATCGCCAA GGCCTTTATA TGACAAAACC TAATTTTGGT 1740
GTTGATCG 1748