EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-51640 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr5:69045029-69045723 
TF binding sites/motifs
Number: 27             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr5:69045047-69045064ATTAATTAATTAATGAG-6.3
BHLHE40MA0464.2chr5:69045399-69045409GTCACGTGAT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr5:69045422-69045440GGTAGAGAGGAAGGAGGG+6.09
Hmx1MA0896.1chr5:69045059-69045076ATGAGCAATTAATTATT+6.25
Hmx2MA0897.1chr5:69045059-69045076ATGAGCAATTAATTATT+6.04
Hmx3MA0898.1chr5:69045059-69045076ATGAGCAATTAATTATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr5:69045049-69045062TAATTAATTAATG+6.46
Lhx3MA0135.1chr5:69045045-69045058TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:69045046-69045059AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:69045042-69045055GAATAATTAATTA-7.12
MITFMA0620.2chr5:69045395-69045413TGTGGTCACGTGATCTGC+6.7
MITFMA0620.2chr5:69045395-69045413TGTGGTCACGTGATCTGC-6.7
PBX2MA1113.1chr5:69045178-69045190CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr5:69045175-69045192CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr5:69045040-69045054ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr5:69045040-69045056ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr5:69045040-69045056ATGAATAATTAATTAA+8
POU6F1MA0628.1chr5:69045047-69045057ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:69045051-69045061ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:69045047-69045057ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:69045051-69045061ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr5:69045503-69045514AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr5:69045110-69045121GTCTTTGTTTT-6.14
SREBF2(var.2)MA0828.1chr5:69045399-69045409GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr5:69045399-69045409GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr5:69045399-69045409GTCACGTGAT-6.02
USF2MA0526.2chr5:69045395-69045411TGTGGTCACGTGATCT+6.53
Enhancer Sequence
GATTTTCGAT TATGAATAAT TAATTAATTA ATGAGCAATT AATTATTTGT AGCCTACCGT 60
TTAAACTACC TGACCTGCAT GGTCTTTGTT TTACCCATAA ACAGATCATA CAGTAAATGA 120
ATAAAGGCAA GATACACACA TAATTACCAC CTGTCAATCA CTTTTCTGCG GGACTCGTGA 180
ATAGGCAGTG ATCTGTGTCG TTATAATGGC GTCAGTAAAA AAGACGCACA ACCAACAGGA 240
ACCAGCCAAC AGTATCTGAG GTGTTCGCTA AAATGACGAA GTACAAGTGA GTGAAAGATT 300
GAAGCAGTCC TCTGACTGCC TGGACCTGCT GTCTCGAGCG CATGGCTGTG TGTGCGTCTG 360
TGTCTGTGTG GTCACGTGAT CTGCATTTTC AGAGGTAGAG AGGAAGGAGG GCTGCTCAGA 420
AATGCTACAC GCCACTGTGG ATGTCAAATC GTTGTCGTTC TAAAATGCCA TTTAAAAACA 480
AAGACGGTGT AAACAGGGCC TGAGTGTGAA CTTTTCGCGA GCGGATTTGC AACGGGGGCG 540
GGCGGAGGAT CGTGATGCCG GTGTTGTCTA TCGGACGAAC CGTACGTAAT ACATACATAG 600
CAGAGCTTGC AAAACTGTGT TTTTTTTTTG TCGACAACAC GAACGTTGTC AACATAACTC 660
ACTGGAAATC CAAAATGCTT AAACACCAGC GACT 694