EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-51614 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr5:68371984-68372728 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr5:68372673-68372690GGTCATTAATTAATTAA+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr5:68372308-68372326CCCTCCTTCCTCTCTACC-6.09
Lhx3MA0135.1chr5:68372676-68372689CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr5:68372679-68372692TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:68372680-68372693AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:68372683-68372696TAATTAATTATTC+7.12
PBX2MA1113.1chr5:68372548-68372560GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr5:68372546-68372563AAGTGATTGACAGGTGG+6.14
POU4F1MA0790.1chr5:68372684-68372698AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr5:68372682-68372698TTAATTAATTATTCAT-7.91
POU4F3MA0791.1chr5:68372682-68372698TTAATTAATTATTCAT-8
POU6F1MA0628.1chr5:68372677-68372687ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:68372681-68372691ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:68372677-68372687ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:68372681-68372691ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr5:68372617-68372628AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr5:68372234-68372245GTCTTTGTTTT-6.14
Enhancer Sequence
CACTGGAGAC CCGTCGACAG AACTTAAACC CTCTCCTCTT TCAATGAAGT CGCCGGTGTG 60
GAAGCATTTT GGATTTCCAG TGAGTTATGT TGACAACGTT CGTGTTGTCA ACAAAAAAAA 120
CACAGTTTTG CAAGCTCTGC TATGTACGTA TTAGGGTTCG TCCGATAGAC AACACCGGCA 180
TCGCAATCCT CCGCCCGCCC CCGTTGCTAA TCCGCTCGCG AAAAGTACAC ACTCAGGCCC 240
TGTTTACACT GTCTTTGTTT TTAAATGGCA TTTTAGAACG ACAACGATTT GACATCCACA 300
GTGGCGTGTA GCATTTCTGA GCAGCCCTCC TTCCTCTCTA CCTCTGACAC ACACACACAC 360
ACAGACGCAC ACACACAGCC ATGCGCTCGA GACAGCAGGT CCAGGCAGTC AGAGGACTGC 420
TTCAATCTTT CACTCACTTG TACTTAGTCA TTTTAGCGAA CACCTCAGAT ACTGTTGGCT 480
GGTTCCTGTT GGTTGTGCGT CTTTTTTTAC CGACGCCATT ATAACGACAC AGATCACTGC 540
CTATTCACGA GTCCCACAGA AAAAGTGATT GACAGGTGGT AATTATGTGT GTATCTTGCC 600
TTTATTCATT TACAGTATGA TTTGTTTATG GGTAAAACAA AGACCATGCA GGTCAGGTAG 660
TTTAAACGGT AGGCTACAAA TAATTAATTG GTCATTAATT AATTAATTAT TCATAATCGA 720
AAATCGAATC GTGCCTTTAG AATC 744