EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-50772 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr5:52496614-52497812 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr5:52496732-52496743ATATTAATTAT+6.02
BHLHE41MA0636.1chr5:52497551-52497561GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr5:52497551-52497561GTCACGTGAC-6.02
HNF1AMA0046.2chr5:52496760-52496775TATTAATCATTAATA-6.01
MITFMA0620.2chr5:52497547-52497565GCGGGTCACGTGACAACC+6.35
MITFMA0620.2chr5:52497547-52497565GCGGGTCACGTGACAACC-6.35
Pou2f3MA0627.1chr5:52497634-52497650GCGTATGCAAATTTGA+6.65
Sox3MA0514.1chr5:52497066-52497076AAAACAAAGG-6.02
USF1MA0093.2chr5:52497550-52497561GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr5:52497549-52497565GGGTCACGTGACAACC-6.01
USF2MA0526.2chr5:52497547-52497563GCGGGTCACGTGACAA+6.54
Enhancer Sequence
AATAACGGTT TATTCTTAAT TATTAATATT CCGGCTTAAG CTTCAGTCAG TTTGGTCAAA 60
CAAACATATG ATTGTAAATG ATCATGCTCG CGCGACCGAG CGGATTCCCA GATTATGAAT 120
ATTAATTATC AACAATAACG AATTATTATT AATCATTAAT ATTCCGGATC AATTTATTGT 180
TAATTTGACC AAACGAACAC AAGCAGAGCC GCCGCTCTTC CGAGCGGACA CTGTAATTTA 240
TTCATTTAGA AAAAGGGAAT TTAATTGCTA CTTCTTGTGA AGTAGATTAA TCATTCAAAA 300
GTTTTAAACA ACTTATAATA GCTAGGCAGG GGAATCTGTA TTTCAGTGAC ATTTTCTCGT 360
GAGGCAAACA ATACAATTCA TTTGATTATA ATGGAATTTA TTGACTAGTC AGACGTAACG 420
AACAAACAAA CGCACAAACA TACATTTAAC ACAAAACAAA GGTAAACCAC GTGGAGATAT 480
CGGGTCTATA GAACGTGTAA CAGCAAAGAG AAATAGTAAA GCTAGAAAAT ATAGATTTCA 540
GATTAAAGAG TGACAAAACT TTCAGTTCCA CACGCACCAT TACGGACCAC CAAGGTTATA 600
AAAAACACCT TTTTGATAAG GGGCACAGCT TAATCGCATA ACTAAAATCA CCTGGTCTTT 660
CATGTCTGGC GGTCTCTCTT ATGCGTCTCT CTTCCGTCGT GATGAAACTA CTCTTGATGT 720
CCTTTGATGC GTGGAGTTTG TAATGCAGTT CGGACGAACA CGATCGCAAA CTTTAAACTG 780
AATTTACTTT GCCGGAAAAT AAAGAAAGCG TGGCGGGAAA AAGTCCATGC GGCTTAGAAA 840
GCCACGTGTG GCCCGAGGGC CACCGTCAAT GATGTTCCTT TTTGGGACGT TCTCTTTCTG 900
CCCAGATGTT TGGGGGGAAG TGTGCTTATA CCTGCGGGTC ACGTGACAAC CCGTACAGCA 960
TTCTGACCAA TGATTTCAGG GGAAAGTTTG CGCGCGAACC TTCCTTTGTC TCTGGGCTGC 1020
GCGTATGCAA ATTTGAGCGC CCGCCTAAAG CATGCAGACA GGCATTTAAT ACAGGGCTTT 1080
AAAGAATAAA GCAATGCGAG TTATGGTCTC GATCTATGCA TCATGTGTTA TAAAATGTCG 1140
AGGGCATTCT ATTGACACCA AACACTCTAC AAGTACATCA CATTAAAGGT ACATTAAC 1198