EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-50753 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr5:52018887-52019954 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr5:52019019-52019030ATATTAATTAT+6.02
NFYAMA0060.3chr5:52019907-52019918GACCAATCAGA+6.14
ZNF384MA1125.1chr5:52019527-52019539TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
GGCCGTGGCC AGAGGCGCTG TAACGTTACT GCAGAGAGAG AAATGCCATC CTGCTGTTTC 60
CACAGAGCTG TTCTGTTTCT GTTGTTGGGC TTCCAAATGA CACGACCCAA ACACAGAAGT 120
GCTTACAGTT CAATATTAAT TATGTTCCAG AGAACTATAA AATACATAGC AAGCATGATT 180
TGACAAAACA CAGCTTCCAG AATCTCTCCC AGTTCAGTGC TGGATTCAGT TAAAATCTTC 240
TCAAAGATGG AGCAAGGAGA CGCTGTGAAC TCTGAGTCAT GACCTGTAAG TGTTTTTATT 300
TGTTAAAATT GATCATGACA TGTACAGTGT CTAACTTTAA CGGTGTGTTG TAGCAAAGAT 360
GTAAACAACG GGAAATTATG GTAACCGCTA ACGACTTAGC TAACGTTACA AATCCATATT 420
TATCAAACGG CTGTAAACGC ACACACACAC ATACACATAC ACGCACTCTT GGCCAGCACC 480
TGCGTCTATC TGTGTGAGAC GGCAGAATTT CTCTCTATAG GCAGCTATGC TATGCGTTTT 540
ACAACTCGGA CAATAAAGTC GCAAAAGATA TGTGAACGAT TCATGTTACT TACACAGGCA 600
TATTCCGCAT ATGCATGAAA GACGTCCTGT AACGCATTGA TTTAAAAAAA AATACAGCAA 660
TGATTTCCCA ACTGGAGTGT AACATCAAAA ACAAATCAAT CCAGGCTCAC AAAGGTCTCA 720
TCTCACATCG TGTGCTTTAT TCTGTCACCA CAGAAAATAA CTTAATCCGA GCATGAGAGA 780
AAAAGAACAA TAAAAATCTC TCCCGCGCAC ATGCGCTTCT CGTGTTACAA ATACTTCATC 840
GTATACACGC ATAAACACAC TAAAAGGCAC AGAAACAGTT AAAGGAGCCG CATCCCATTT 900
TCACTCGTTA CAGACACGTG TTGACTGACT GACTGACTGA CTGACTGTTT ACACAAAACG 960
CGCGTGCTTA TCAGGGCTTG ACGTGAAGCC GATCGGCGTA TCACAGCATA TTATGATGAT 1020
GACCAATCAG AGTCACTTGA GGGTGGGCCT TTTAGAGGAA CTAGGAA 1067