EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-50620 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr5:46654458-46655606 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr5:46654572-46654583ATATTAATTAT+6.02
Arid3bMA0601.1chr5:46654605-46654616ATAATTAATAT-6.02
BHLHE41MA0636.1chr5:46655398-46655408GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr5:46655398-46655408GTCACGTGAC-6.02
E2F8MA0865.1chr5:46655265-46655277CTTGGCGGGAAA-6.11
POU4F1MA0790.1chr5:46654601-46654615ATTAATAATTAATA+6.15
Pou2f3MA0627.1chr5:46655481-46655497GCGTATGCAAATTTGA+6.65
Sox3MA0514.1chr5:46654906-46654916AAAACAAAGG-6.02
USF1MA0093.2chr5:46655397-46655408GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr5:46655394-46655410GCGGGTCACGTGACGA+6.62
Enhancer Sequence
ACGGTTTATT CTTAATTATT AATATTCCGG CTTAAGCTTC AGTCAGTTTG GTCAAACAAA 60
CATATGATTG TAAATGATCA TGCTCGCGCG ACCGAGCGGA TTCCCAGATT ATGAATATTA 120
ATTATCAACA ATAACGAATT ATTATTAATA ATTAATATTC CGGATCAATT TATTGTTAAT 180
TTGACCAAAC GAACACAAGC AAAGCCGCCG CTCTTCCGAG CGGACAAGGT AATCTATTCA 240
TTTAGAAAAA GGGAATTTAA TTGCTACTTC TTGTGAAGTA GATTAATCAT TTAAAAGTTT 300
TAAACAACTT ATAATAGCTA GGCAGGGGAA TCTGTATTTC AGTGACATTT TCTCGTGAGG 360
CAAACAATAC AATTCATTTG ATTATAATGG AATTTATTGA CTAGTCAGAC GTAACGAACA 420
AACAAACGCA CAAACATACA TTAAACACAA AACAAAGGTA AACCACGTGG AGATATCAGG 480
TCTATAGAAC GTGTAACAGC AAAGAGAAAT AGTAAAGCGA GAAAATATAG ATTTCAGATA 540
AAAGAGTGAC AAATCTTTCA GTTCCACACG CACCATTACG GACCACCAAG GTTATAAAAA 600
ACACCTTTTT GAAAAAAAGG GGCACAGCTT AATCGCATAA CTAAAATCAC CTGGTTTTTC 660
ATGTCTGGCG GTCTCTCTTA TGCGTCTCTC TTCCGTCGTG ATGAAACTAC TCTTGATGTC 720
CTTTGATGCG TGGAGTTTGT AATGCAGTTC GGACGAACAC GATCGCAAAC TTTAAACTGA 780
ATTTACTTTG CCGGAAAATA AAGAAAGCTT GGCGGGAAAG TCCATGCGGC TGTGAAGAGC 840
CGTGTGGCCC TTAAAGGGAC CACCGTCAAT GATGTTCCTT TTTTGGGACG TTCTCTTTCT 900
GCCCAGATGT TTGGGAGGGC AGAATGAGTT ATACCTGCGG GTCACGTGAC GACCCGTTCA 960
GCATTCTGAC CAATGATTTC AGGGGAAAGT TTGCGCGCGA ACCTTCCTTT GTCTCTGGGC 1020
TGCGCGTATG CAAATTTGAG CGTCCGCCTA AAGCATGCGG ACAGGCATTT AATACAGGGC 1080
TTTAAAGAAT AAAGCAATGC GAGTTATGGT CTCGATCTAT GCATCATGCG TTGTAAAATG 1140
TCGAGGGC 1148