EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-50493 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr5:42499526-42501028 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA2MA0036.3chr5:42500288-42500299TTCTTATCTGT+6.14
GATA6MA1104.1chr5:42500287-42500300TTTCTTATCTGTT-7.34
Gata1MA0035.3chr5:42500288-42500299TTCTTATCTGT+6.62
HMBOX1MA0895.1chr5:42500872-42500882GTTAACTAGT-6.02
LMX1BMA0703.2chr5:42500339-42500350TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr5:42500340-42500351TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr5:42500340-42500351TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr5:42500340-42500351TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr5:42500340-42500351TAATTAAATTA-6.62
SOX15MA1152.1chr5:42499873-42499883CTATTGTTTT+6.02
Stat6MA0520.1chr5:42499610-42499625TTCTTCCTGAGAAAA+6.15
TCF3MA0522.2chr5:42500804-42500814AGCAGGTGTT-6.02
ZNF143MA0088.2chr5:42500171-42500187CTCCCAGCATGCATTG+6.21
Enhancer Sequence
CGGATGATTA AACAACTCTA CAAACATCAT CACCAGCTAC ACTTATTACT TAATACATTT 60
ATTTTTGTAT AACATCTACT AAAGTTCTTC CTGAGAAAAA GTTAAAGTTT TACGTCACCA 120
TCATGGAGAA CAGAGTTTGC TTTAGTTGGG CTCTTAGCCC TGTCATTTTT AACATTTACA 180
TATCTTGGCT GCTGCAATTG TTAAGAACTT TGTTTAAAAA GCTCCTTTGT TGTGGCAAGC 240
CAGCCAAAAA CCTAAATAAG ATCTGGTGAT GTTCATGTTG CTATTAAATG GCAGAGTCAG 300
TTCTCATTTA GTGTAATAAA ATTTACTGCT CCTATTCAAT TTTAAATCTA TTGTTTTACA 360
TTTTATGTAT ATATATATGG CAATGATTTC TGGAAGTTTT TAAGAATATC TTGGACAATA 420
ACACTGCTCT ATGGTGTAAC TTGCACTCAA AGAGACATCA ATAATCAGCA TATGAACCTC 480
AATAATGGTG ACAACTAACA AAATTAACAG TTTAACTCAC AAACAGGCAA CTGAAAGTCT 540
AAACATAAAC AACAGCAGAA TCAAACACAA ATAAAGAAAA CTGTTAGACC ATTATACAAC 600
ATTTATTTAT ACCGCAATGC ATGCTGGGAT ATTTGTATTG TGCCACTCCC AGCATGCATT 660
GCAGCATCAA ACATTTGAGA TTTTACCATT GTTGAGATAC AAGGTCAGAT TCATGAGGTC 720
TGAGTGTGTA CTTGTCATAA CTGAAGTTTT TTTGTATGTT ATTTCTTATC TGTTAAGTAA 780
TTACGGAGGT ATCTTTTCTG TTTCCACTTC TCATTAATTA AATTAATACC TGCAACTAAG 840
CATAAAATCT ATTGCATGAG GCCCTTCATC CAGATATATA CCACAACATT TATCAGAACT 900
AATTTGGGCC AAATAGATTT CTTTATTTAT TGACTTTCCA ACTTTATTGC TATAGTTCAA 960
ACGTTTTGTA AACTCTGTAT TACAGCAATT GGAAAGTCTT CTTAAATGAG TTCAAGGGTG 1020
AAGAGCCCAA CTAAATCAGC CCCTCACTCC ATTACGGTGA CACAAAAAAC ACCTTAATTT 1080
CTGTTGGATC TCAATGAGAA TTGTATGGAA GTCAAATCAG TCAGTAATAA GTGTGTGTCT 1140
GCTGTTGTTT GTGGAGTTGT TTAATGATCC TCTGCTGAGA CTGAAGCTGT TTTATTTTAT 1200
TTGATTTTAT TTCATGTTGT AACTGACGTC ACTGTTTGTG TTTCTTGTTT CTTTTCTTCA 1260
GTAATTGTAA TTATTAACAG CAGGTGTTCA TCAGTGTCTG AATTCACTCA TTAGTGTTCA 1320
TTAAAACTGT CAGGTGAACT ATATTAGTTA ACTAGTGTAT GAAATAGTGA ACAAGGACAC 1380
AAAGTGTGAT TTCAAACACA GACTTCAAAA CATCGAATCT GAACTCTGTT AGCTCACAGT 1440
TTTCTGCAGT TGGTTACTTT CTCGAAAACA AATATGTTAC CCAGAAAGCA CTGTTTTTAA 1500
CA 1502