EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-50159 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr5:35189805-35190495 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr5:35190376-35190393GGTCATTAATTAATTAA+6.06
EWSR1-FLI1MA0149.1chr5:35190057-35190075CCCTCCTTCCTCTCTGCC-6.09
Lhx3MA0135.1chr5:35190379-35190392CATTAATTAATTA-6.46
Lhx3MA0135.1chr5:35190382-35190395TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:35190383-35190396AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:35190386-35190399TAATTAATTATTC+7.12
PBX2MA1113.1chr5:35190251-35190263GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr5:35190249-35190266AAGTGATTGACAGGTGG+6.14
POU4F1MA0790.1chr5:35190387-35190401AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr5:35190385-35190401TTAATTAATTATTCAT-7.91
POU4F3MA0791.1chr5:35190385-35190401TTAATTAATTATTCAT-8
POU6F1MA0628.1chr5:35190380-35190390ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:35190384-35190394ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:35190380-35190390ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr5:35190384-35190394ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr5:35190320-35190331AAAACAAAGAC+6.14
SOX10MA0442.2chr5:35189983-35189994GTCTTTGTTTT-6.14
ZNF384MA1125.1chr5:35189836-35189848AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr5:35189837-35189849AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr5:35189838-35189850AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr5:35189839-35189851AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
GAGTTATGTT TACAACGTTC GTGTTGTCGA CAAAAAAAAA AAAAAACAGT TTTACAAGCT 60
CTGCTATGTA CGTATTACGT ACGGTTCGTC CGATAGACAA CACCGGCATC GCGATCCTCC 120
ACCCGCCCCC GTTGCAAATC CGCTCACGAA AAGTACACGC TCAGGCCCTG TTTACACTGT 180
CTTTGTTTTT AAATGGCATT TTAGAACGAC AACGGTTTGA CATCCACAGT TGCGTGTGGC 240
ATTTCTGAGC AGCCCTCCTT CCTCTCTGCC TCTGAAAATG CACATCACCT GTCAGAGGAC 300
TGCTTCAGTC TTTCACTCAC TTGTACTTGG TCATTTTAGC AAACACCTCA GATACTGTTG 360
ACTGGTTCCT GTTGGTTGTG CGTCTTTTTT ACCGACGCCA TTATAACGAC ACAGATCACT 420
GCCTATTCAC GAGTCCCGCA GAAAAAGTGA TTGACAGGTG GTAATTATGT CTGTATCTTG 480
CCTTTATTCA TTTACTGTAT GATTTGTTTA TGGGTAAAAC AAAGACCATG CAGGTCAGGT 540
AGTTTAAACG GTAGGCTACA AATAATTAAT TGGTCATTAA TTAATTAATT ATTCATAATC 600
GAAAATCGAA TCGAATCGTG CCTTTAGAAT CGAAAATGTA ATCGAATCGA GGACTTGGAG 660
GATCGTGACA CCCTTAGTGT GAAATTATAT 690