EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-47916 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:65817198-65818134 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr4:65817404-65817415ATTGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:65817418-65817430GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr4:65817422-65817434GTTTGTTTGTTT+6.32
IKZF1MA1508.1chr4:65817332-65817344CAAACAGGAAGT+6.02
Nkx2-5(var.2)MA0503.1chr4:65817410-65817421CTTGAGTGGTT-6.32
PKNOX1MA0782.1chr4:65817283-65817295TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:65817283-65817295TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:65817283-65817295TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:65817283-65817295TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:65817283-65817295TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:65817283-65817295TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:65817283-65817295TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:65817283-65817295TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
CTCCGGCTGT CCACCTCATT GGCGCAGCAG GCAGCTAAGC TGTGCTCGGC TCCTGGGGCT 60
GCGCCTAGTT TCAATAGCCA ACACTTGACA GCTGTCATTG CTTACGACCA CACCACCCTG 120
AGGGCGCTAT AGAGCAAACA GGAAGTGAGT TGGCAGCAGT GAGGAGAGAA AGGCTCTCCC 180
CATTTTGCTT GTCTACCTTT TTGTTTATTG ACCTTGAGTG GTTTGTTTGT TTGTTTTATT 240
TTTGTCTTTA AAAACCACCT AACAGCAGCA TTTTGCTGAC TGAAGGGTGG TTATGTTGTG 300
TTTTTTATTT TTAATCATGG ACAGATTACC CGGCAACGAC ACGGAAATGG AGGGACTTGC 360
ACGAAAGGAT AAAGAAAATG GGCTGGATAA TAGACGAAGA GATAAAAAAA ATGGACTTGA 420
CAGCAGACAA AGAGATAAAT AAAATGAAGA GCCCGGCCGA CGAAGAGGTG AAAAAGGTAA 480
GGATAAGCAA GAGATACAAA GAAGAGTGTG CACAAAGGAA GCAACAGTAA CTGTAGAAGT 540
AGAAAATGTA AAAGATGCAA GAAGGTTTGA TATAATCAAA GCAGTCGCGG AGCTGATTGG 600
AGAAGGAAGA ATTCTGGCGG TGAGACCCAA ACAAACAAGG GAGTATGAAG TAACAATGGA 660
GACTGAAGAT GACACCGAAA TTTTAATAGA CAATGGATTG ACAATAAAAG GAGTGAAATC 720
TGAAGTACGG AGGTTACAAA ACAGAGACTA TGTTGTTTCG TTCAAGCATC TGCCTGTTTA 780
CCTAGCTGAT GAAGAAATTT TAAGCAAGCT AGAGGGATGG GGAGTTTTCC CCATGTCTAA 840
AACTAAAAGA AGACTGTATC CAGGCACAAG CATAGAAGAT GGAACAAGGT TTGTAAAAAA 900
CGGATTTCCA GAAGAGACGG TCTCCCTACC ATACAG 936