EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-47882 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:65657257-65659146 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF14MA0740.1chr4:65658674-65658688GGGGGGGCGTGGCT-6.35
KLF16MA0741.1chr4:65658321-65658332GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:65658467-65658478GGGGGCGTGGC-6.62
KLF16MA0741.1chr4:65658676-65658687GGGGGCGTGGC-6.62
NR4A1MA1112.2chr4:65658578-65658588GTGACCTTTA-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr4:65658662-65658675TTTAAGTGGTTTG-6.24
SP1MA0079.4chr4:65658320-65658335TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:65658466-65658481TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP1MA0079.4chr4:65658675-65658690GGGGGGCGTGGCTTG-7.85
SP3MA0746.2chr4:65658320-65658333TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:65658466-65658479TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP3MA0746.2chr4:65658675-65658688GGGGGGCGTGGCT-6.74
SP4MA0685.1chr4:65658318-65658335TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:65658464-65658481TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP4MA0685.1chr4:65658673-65658690TGGGGGGGCGTGGCTTG-7.45
SP8MA0747.1chr4:65658320-65658332TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:65658466-65658478TGGGGGCGTGGC-6.11
SP8MA0747.1chr4:65658675-65658687GGGGGGCGTGGC-6.44
Enhancer Sequence
AGGGTGTTCT AAGTGGTTGC TAGGTGGTTG CTAAGGTGTT GCTAGGCGGT TGCTAAGGTG 60
TCCTGAGTGG TTGCTAGGTG GTTGCTAAGG TGTTGCTAGG CGGTTGCTAG GGTGTCCTGA 120
GTGGTTGCTA GGTGGTTGCT AAGGTGTTGC TAGGCGGTTG CTAGGGTGTT CTGAGTGGTT 180
GCTAGGTGGT TGCCAGGCGG TTGCTAGGGT GTCCTGAGTG GTTGCTAGGT GGTTGCTAAG 240
GTGTTGCTAG GCGGTTGCTA AGGTGTCCTA AGTGGTTGCT AGGTGGTTGC TAAGGTGTTG 300
CTAGGTGGTT GCTAGGGTAT TCTAAGTGGT TGCTAAGGCG TTGCTAGGCG GTTGCTAGGG 360
TGTCCTGAGT GGTTGCTAGG TGGTTGCTAA GGTGTTGCTA GGTGGTTGCT AGGGTGTTCT 420
GAGTGGTTGC TAGGTGGTTG CTAAGGTGTT GCTAGGCGGT TGCTAAGGTG TCCTGAGTGG 480
TTGCTAGGTG GTTGCTAAGG TGTTGCTAGG CGGTTGCTAG GGTGTTCTGA GTGGTTGCTA 540
GGCGGTTGCT AGGCGGTTGC TAGGGTGTCC TGAGTGGTCG CTAGGCCCTT ACTAAGGCGT 600
TACTAGGCGG TTGCTAGGTG GTTGCTAGGC GGTTGCTAGG GTAATTTGGG TGGTTGCTAG 660
GCAGTTGCTA GGGTACCCTG GTTGGTTACT AGGCAAGCCT CACATACATG CCTGATGAAA 720
TATTTATACT TAGTAAGCAT TTCTAGCAAG TTACAGTACA TGGCTAGTCA ATATTAGCAT 780
GTAGCTAGTC ACTGCTAGCA TGTGTAGCAT ATAGGAAGTT CCGTTTGCTA GCATGAGTCA 840
AACGAGCCAA TCCCCAAGTC TCTACGATGT TCCGATGCTG AGATATAGCT GTTGATGAAC 900
GGTTGCTAGG GTACTGTGTT TTGTTGCTAT GGGCGAGGTT ACAGAGTGAA CTTGAATGTG 960
GTTGGCTGTC CAAGTCAAAT GAGCCAAACC CCAAGTCAAT AGGACACTGC TATGCAAAGA 1020
TATGCATGTA GGCCAGTTAC AATGGCAGTC TATGGGACCA GTTTGGGGGC GTGGCTTGTG 1080
AGCTTCATTA TCATATTGAG ATGCTCATTG GTTGTCTGAG TCAGATGAGC CATCCCCCAA 1140
GTCAATAGGA CACTGCTAAG CAAAGATATG CATGTAGGCC AGTTATAATG GCAGTCTATG 1200
GGACCAGTTT GGGGGCGTGG CTTGTGAGCT TCATTATCAT ATTGCAATGC TGATTGGTTG 1260
TCTGAGTCAG ATGAGCCCAC CCCCATGTCT CTATGACACT CCTATGTAAT GTTATAGATG 1320
TGTGACCTTT ATAATGGAAG TCAATGGGAT CTGCAATGGG ACATCCCACC CCATGTTAAG 1380
TCAATGGGGC ACCTTAATAG GGGTCTTTAA GTGGTTTGGG GGGGCGTGGC TTGTGAGCTT 1440
CAAAATCATA TTGAGATGCT GATTGGTTGC CTCAGTGAAG TTAGCCAACC CCCAAGTCTG 1500
TATGACACTG CAATGTAATG TGATTGACGT GAGTCAAGAA ATGAATGGGA GTCAATGGGC 1560
CATGTAAAGT CAATGGGGAC CCCTTTGGGA CGTCCTAGCA CCCCAGGGGT ACAACTTATA 1620
CCCCTTTTTG GGGTATGTTC TCATACAGGC TGCAACCCCG TACAGATGTT GCGAATCCCA 1680
TATTTCTACG AATTTCACAC TTGGCGCTAT AACGCCTAAA AGGTCGTCCC ATTTCGCGGC 1740
GCGTTTAGTG CTCTCCTAGA AAAATGAATG GGAGTCAATG GGGCCAATGT AAGTCAATGG 1800
GAGCACTTTG GGACGTCCTA GAGCCCCAGG GGTGCAACTT TTACCCCCTT GCAAGGTATG 1860
TTCTCACTTA GGCTGCAACC CTCTACAGA 1889