EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR004-47628 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_4.5hpf 
Coordinate
chr4:63509270-63511191 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESRRBMA0141.3chr4:63510784-63510795ATTGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:63510803-63510815GTTTGTTTGTTT+6.32
IKZF1MA1508.1chr4:63510712-63510724CAAACAGGAAGT+6.02
IRF7MA0772.1chr4:63509829-63509843AGTTTCGTTTTCTT-6.09
IRF9MA0653.1chr4:63509829-63509844AGTTTCGTTTTCTTT-6.22
PKNOX1MA0782.1chr4:63510663-63510675TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX1MA0782.1chr4:63510663-63510675TGACAGCTGTCA-6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:63510663-63510675TGACAGCTGTCA+6.92
PKNOX2MA0783.1chr4:63510663-63510675TGACAGCTGTCA-6.92
TGIF1MA0796.1chr4:63510663-63510675TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF1MA0796.1chr4:63510663-63510675TGACAGCTGTCA-7.22
TGIF2MA0797.1chr4:63510663-63510675TGACAGCTGTCA+7.22
TGIF2MA0797.1chr4:63510663-63510675TGACAGCTGTCA-7.22
Enhancer Sequence
GTAGTGTAGT GGTTATCACA TTCGCCTCAC ACGCGAAAGG TCCCCAGTTC AAAACTGGGC 60
GGAAACAACC TCTGGCTTTT ATGACAATTG TCAAATCAGG CTTCTGTTGA GTACTGACGT 120
TCACTGAAAA CATTCTTTCT GCAGAGCGGT GTGAGGCTAG AAGTTTGAAT TCAGCTCAGT 180
GTTTACCGCC CCTCGCGGTG TCGCAAACTT GCGTAGAATC TGATTTCTTT TAGCTTTGTG 240
TTGTGCATGA GCAGGTGGCC AGTGCGTTTG CTGGCCCTTC ACGGTGCAGA CCGTACAAGA 300
CAGCTCTATA AAAAAAGACT ATAAATACTT GAAGCAGCAC TGGCCTATTG GTTTCCGTAG 360
TGTAGTGTTT ATCATGTTTG CAATACACGC TAAAGGTCTC CTGTTCGAGA CTGGGCGGAA 420
GCATACAATT AGCGGACACT TTTGTCCAAA GCGACATACA ATAGTGGAGG TATTCAACAA 480
GACGAGGCAA TGCATACGAA AAAGGGCTAT TTATTCCAAG TAATTTGTTT GTGCTCAGAG 540
AATTTAGTGC TGGAGTAGGA GTTTCGTTTT CTTTAGAGAG AGGGATATTC ACCGGGGTTC 600
GGGTGTACTC TGAAGAGATG GGTGTTAGCT GTCGTTTGAA GGACACCAGT GTATCCGTAA 660
TCCGAGTGGG AATGGGAAGG TGATTCCACC AGCGTAGAAC ATTGAATGAA AACATTGTGG 720
AAAGTGACTT TCCGTCTCTC TGCGCTGGCA CCACAAGACA GTGCTCTCAC CCTAACCGGA 780
GGCTCCTGTG GTTATCACGA TGGCTTTACA AGCGGAGGGT CTCCTGTTAG CAACTGGGCG 840
GAAACATTCA GATTTGCTTT TACGCACATT CTCAATTGGC TCTCTGCTCA CTGGATGATC 900
CACGATACAA GGGCATGGAT CTGTCAAATG TCATGACTTG ACGTTGTACG AGGATTTGAC 960
GAAAAAAATG CCCTGCAAAC CTTAAAAAGC AACACCATCC CAGGACAATT CTTTTAAACC 1020
CCTTTCAGTG CACTTGCATT AAAGCCCGCG TGATGCGGCA CTTTGTCAGT GTTACTGTAT 1080
CATTCGGACA TGGGGGCAGA GAGTTAAAGA ATTCAGCCTG AGCGCACTGC CGCAGGCTCG 1140
GTTTGTCAGA AGTGGGATTC GAACCCACGC CTCCAGCGGA GACTGCGACC TGAACGCAGC 1200
GCCTTAGACC GCTCGGCCAT CCTGACATGC AAGCTTGGCA GGAGCTGTCT CCTGGGAGCC 1260
ACACCGCAGT ACCGTGACAT GGAATCTGGT GCTTCACAGC TTGCCCAGCT CCGGCTGTCC 1320
AGCTCATTGG CGCTGCAGGC AGCTAATCTG TGCTCGCCTC CTGGGGCTGC GCCTAGTTTC 1380
AATAGCCAAC ACTTGACAGC TGTCATTGCT TACGGCCACA CCACCCTGAG GGGGCTATAG 1440
AGCAAACAGG AAGTGAGTTG GCAGCAGTAA GGAGAGAAAG GCTCTCCCCA TTTTGTTTGT 1500
CTACCTTTTT GTTTATTGAC CTTGAGTGTT TTTGTTTGTT TGTTTTCTTT TTGTCTTTAA 1560
AAACCACCTA ACAGCAGCAT TTTGCTGACT GAAGGGTGGT TATGTAGTGT GTTTTATTTT 1620
TAATCATGGA CAGATTCCCC GGCAACGACA TGGAAATGGA GGGACTTGCA AGAAAGGATA 1680
AAGAAAATGG GCTGGATAAT AGACGAAGAG GTAAAGAAAA TGGACTTGAC AACAGACAAA 1740
GAGATAAATA AAATGAAGAG CCCGGCCAAC GAAGAGGTGA GAAAGGCAAG GATAAGCAAG 1800
AGGTACAAAG AAGAGTATGC ACAAAGGAAG CAACAGTAAC TGTAGAAGTA GAAAATGTAA 1860
AAGATGCAAG AAGATTTGAT ATAACCAAAG CAGTCACGGA GCTGATTGGA GAAGGAAGAA 1920
T 1921